Protein–RNA interactions for Protein: Q0VG85

Ccdc162p, Coiled-coil domain-containing protein 162, mousemouse

Predictions only

Length 912 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc162pQ0VG85 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Ccdc162pQ0VG85 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ccdc162pQ0VG85 AC158605.1-202ENSMUST00000217860 540 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ccdc162pQ0VG85 AC148335.1-201ENSMUST00000218778 818 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ccdc162pQ0VG85 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Ccdc162pQ0VG85 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ccdc162pQ0VG85 4930562F07Rik-201ENSMUST00000028061 830 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ccdc162pQ0VG85 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ccdc162pQ0VG85 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ccdc162pQ0VG85 Armc5-201ENSMUST00000044660 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ccdc162pQ0VG85 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Ccdc162pQ0VG85 n-R5s195-201ENSMUST00000082891 119 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Ccdc162pQ0VG85 Trip4-202ENSMUST00000119245 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ccdc162pQ0VG85 Npepps-201ENSMUST00000001480 4215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ccdc162pQ0VG85 Cyb5r3-202ENSMUST00000162178 2547 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ccdc162pQ0VG85 A130077B15Rik-201ENSMUST00000219429 2547 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ccdc162pQ0VG85 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ccdc162pQ0VG85 Btbd9-202ENSMUST00000168787 6857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ccdc162pQ0VG85 Cd6-202ENSMUST00000039043 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ccdc162pQ0VG85 Celf3-213ENSMUST00000199775 2351 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ccdc162pQ0VG85 Mafb-201ENSMUST00000099126 3363 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ccdc162pQ0VG85 Slc7a3-201ENSMUST00000073927 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ccdc162pQ0VG85 Eno3-206ENSMUST00000170716 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ccdc162pQ0VG85 Cfap52-201ENSMUST00000021287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ccdc162pQ0VG85 Arhgef9-201ENSMUST00000113873 2117 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ccdc162pQ0VG85 Cntn4-203ENSMUST00000113258 2464 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ccdc162pQ0VG85 Asb15-201ENSMUST00000031696 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ccdc162pQ0VG85 Dmbt1-201ENSMUST00000084509 6243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ccdc162pQ0VG85 Treml4-201ENSMUST00000059873 1744 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ccdc162pQ0VG85 Abhd1-202ENSMUST00000201125 1352 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ccdc162pQ0VG85 Nmnat1-203ENSMUST00000119921 2657 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ccdc162pQ0VG85 Mob3a-201ENSMUST00000003438 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ccdc162pQ0VG85 Elavl2-204ENSMUST00000107110 3671 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ccdc162pQ0VG85 Entpd5-203ENSMUST00000110272 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ccdc162pQ0VG85 Ckap2-201ENSMUST00000046916 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ccdc162pQ0VG85 Aldh3a2-201ENSMUST00000066277 2892 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ccdc162pQ0VG85 Tpm1-207ENSMUST00000113687 962 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ccdc162pQ0VG85 Rhox2c-201ENSMUST00000115190 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ccdc162pQ0VG85 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ccdc162pQ0VG85 Gm7809-201ENSMUST00000153199 742 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Ccdc162pQ0VG85 Gm24548-201ENSMUST00000158650 108 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Ccdc162pQ0VG85 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Ccdc162pQ0VG85 Psenen-203ENSMUST00000207747 669 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ccdc162pQ0VG85 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Ccdc162pQ0VG85 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ccdc162pQ0VG85 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ccdc162pQ0VG85 Gm9996-201ENSMUST00000070359 913 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Ccdc162pQ0VG85 Gm11559-201ENSMUST00000092694 1096 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ccdc162pQ0VG85 Dcaf11-202ENSMUST00000117236 2538 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ccdc162pQ0VG85 Dusp14-201ENSMUST00000018792 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ccdc162pQ0VG85 Ak8-201ENSMUST00000074156 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ccdc162pQ0VG85 Dmbt1-202ENSMUST00000208311 6272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ccdc162pQ0VG85 Gpatch2l-204ENSMUST00000221368 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ccdc162pQ0VG85 Gtf2i-202ENSMUST00000082057 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ccdc162pQ0VG85 Zfp597-201ENSMUST00000090522 5668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ccdc162pQ0VG85 Herc3-201ENSMUST00000031823 3596 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ccdc162pQ0VG85 Tmem135-202ENSMUST00000117852 2986 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ccdc162pQ0VG85 Slc2a10-201ENSMUST00000029196 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ccdc162pQ0VG85 Gm42463-201ENSMUST00000198041 4886 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Ccdc162pQ0VG85 Bcar1-203ENSMUST00000212349 3116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ccdc162pQ0VG85 Slc30a8-201ENSMUST00000037240 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ccdc162pQ0VG85 Slc26a2-202ENSMUST00000146409 7814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ccdc162pQ0VG85 Rab11fip4os1-201ENSMUST00000145652 2187 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ccdc162pQ0VG85 Mageb4-202ENSMUST00000113969 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ccdc162pQ0VG85 Dnmt1-201ENSMUST00000004202 5367 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ccdc162pQ0VG85 Cntnap4-201ENSMUST00000034225 4848 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ccdc162pQ0VG85 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ccdc162pQ0VG85 Slc2a7-201ENSMUST00000059893 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ccdc162pQ0VG85 Pip5k1b-201ENSMUST00000025800 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ccdc162pQ0VG85 Fyb2-202ENSMUST00000106804 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ccdc162pQ0VG85 Ift22-205ENSMUST00000200157 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ccdc162pQ0VG85 Tnfrsf18-202ENSMUST00000103173 1189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ccdc162pQ0VG85 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ccdc162pQ0VG85 Rps19-203ENSMUST00000108430 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ccdc162pQ0VG85 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Ccdc162pQ0VG85 Gm16177-201ENSMUST00000120728 718 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Ccdc162pQ0VG85 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ccdc162pQ0VG85 Proz-203ENSMUST00000211363 984 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ccdc162pQ0VG85 Tpd52l1-203ENSMUST00000213639 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ccdc162pQ0VG85 AC162938.2-203ENSMUST00000216604 1134 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ccdc162pQ0VG85 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ccdc162pQ0VG85 Tm2d3-201ENSMUST00000032726 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ccdc162pQ0VG85 Rpp38-201ENSMUST00000062672 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ccdc162pQ0VG85 4931429L15Rik-201ENSMUST00000159565 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ccdc162pQ0VG85 Zfp516-202ENSMUST00000171238 7725 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ccdc162pQ0VG85 Zfp516-201ENSMUST00000071233 7703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ccdc162pQ0VG85 Dysf-216ENSMUST00000204987 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ccdc162pQ0VG85 Gm29358-202ENSMUST00000187941 3227 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Ccdc162pQ0VG85 Nop14-201ENSMUST00000041364 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ccdc162pQ0VG85 Dab2ip-207ENSMUST00000112992 6184 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ccdc162pQ0VG85 Gm13404-201ENSMUST00000156633 1960 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ccdc162pQ0VG85 Pcdhgb5-201ENSMUST00000192535 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Ccdc162pQ0VG85 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC13.21□□□□□ -0.3
Ccdc162pQ0VG85 Pak6-201ENSMUST00000099557 4411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Ccdc162pQ0VG85 Fdxacb1-201ENSMUST00000042391 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Ccdc162pQ0VG85 Fndc8-201ENSMUST00000018988 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Ccdc162pQ0VG85 Kcnj11-205ENSMUST00000211674 3142 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Ccdc162pQ0VG85 Hdac7-205ENSMUST00000118294 4069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Ccdc162pQ0VG85 Slc43a1-204ENSMUST00000121114 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Ccdc162pQ0VG85 Fastkd5-201ENSMUST00000110262 3015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.3
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