Protein–RNA interactions for Protein: Q07475

Nrep, Neuronal regeneration-related protein, mousemouse

Predictions only

Length 68 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NrepQ07475 Atp11c-202ENSMUST00000101527 6044 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
NrepQ07475 Gm8522-201ENSMUST00000118416 1929 ntBASIC8□□□□□ -1.13
NrepQ07475 Cyp2b10-202ENSMUST00000072438 1916 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
NrepQ07475 Trim16-202ENSMUST00000072639 1929 ntTSL 2 BASIC8□□□□□ -1.13
NrepQ07475 Clcn1-201ENSMUST00000031894 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
NrepQ07475 Ttc16-206ENSMUST00000161430 2874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
NrepQ07475 Gm15958-202ENSMUST00000153479 2087 ntTSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
NrepQ07475 Ttc33-203ENSMUST00000118193 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
NrepQ07475 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC8□□□□□ -1.13
NrepQ07475 Hmgcll1-202ENSMUST00000117981 1189 ntTSL 5 BASIC8□□□□□ -1.13
NrepQ07475 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC8□□□□□ -1.13
NrepQ07475 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC8□□□□□ -1.13
NrepQ07475 Myl3-203ENSMUST00000136695 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC8□□□□□ -1.13
NrepQ07475 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC8□□□□□ -1.13
NrepQ07475 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8□□□□□ -1.13
NrepQ07475 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC8□□□□□ -1.13
NrepQ07475 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8□□□□□ -1.13
NrepQ07475 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
NrepQ07475 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
NrepQ07475 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC8□□□□□ -1.13
NrepQ07475 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC8□□□□□ -1.13
NrepQ07475 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
NrepQ07475 Prr13-201ENSMUST00000023810 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
NrepQ07475 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
NrepQ07475 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
NrepQ07475 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
NrepQ07475 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
NrepQ07475 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC8□□□□□ -1.13
NrepQ07475 Skiv2l-201ENSMUST00000046022 3951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
NrepQ07475 Sorbs1-201ENSMUST00000099466 2223 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8□□□□□ -1.13
NrepQ07475 Fbxo8-201ENSMUST00000040218 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
NrepQ07475 Gm44510-201ENSMUST00000206288 4532 ntBASIC8□□□□□ -1.13
NrepQ07475 Cct3-204ENSMUST00000164166 1804 ntTSL 5 BASIC8□□□□□ -1.13
NrepQ07475 Bsnd-201ENSMUST00000054472 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
NrepQ07475 1700055D18Rik-202ENSMUST00000186030 3720 ntBASIC8□□□□□ -1.13
NrepQ07475 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8□□□□□ -1.13
NrepQ07475 Scn8a-213ENSMUST00000201549 7120 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC8□□□□□ -1.13
NrepQ07475 Rpgr-202ENSMUST00000072393 2380 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8□□□□□ -1.13
NrepQ07475 Mdm1-203ENSMUST00000164077 2922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
NrepQ07475 Tfdp1-204ENSMUST00000209885 2511 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
NrepQ07475 Vipas39-202ENSMUST00000072744 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
NrepQ07475 Ctnnd1-220ENSMUST00000111694 6362 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC8□□□□□ -1.13
NrepQ07475 Cntnap2-205ENSMUST00000199100 6279 ntTSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
NrepQ07475 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
NrepQ07475 Trip12-207ENSMUST00000186648 6442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8□□□□□ -1.13
NrepQ07475 Ces2h-201ENSMUST00000172032 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8□□□□□ -1.13
NrepQ07475 Ank2-214ENSMUST00000182547 2428 ntTSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
NrepQ07475 Maged2-202ENSMUST00000112697 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
NrepQ07475 Vstm2a-201ENSMUST00000109645 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
NrepQ07475 Stx4a-202ENSMUST00000121705 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
NrepQ07475 Gm26685-201ENSMUST00000181831 2023 ntTSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
NrepQ07475 Tubgcp5-205ENSMUST00000205796 3448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
NrepQ07475 Tln2-201ENSMUST00000039662 8052 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
NrepQ07475 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
NrepQ07475 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
NrepQ07475 Avil-201ENSMUST00000026500 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
NrepQ07475 Slx1b-203ENSMUST00000144897 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
NrepQ07475 Arfgap3-202ENSMUST00000226124 2461 ntAPPRIS ALT2 BASIC8□□□□□ -1.13
NrepQ07475 Adamtsl2-201ENSMUST00000091233 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
NrepQ07475 Zfp398-202ENSMUST00000114598 8328 ntTSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
NrepQ07475 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.99□□□□□ -1.13
NrepQ07475 Aph1b-201ENSMUST00000034934 4910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
NrepQ07475 5730596B20Rik-201ENSMUST00000070587 3354 ntAPPRIS P1 BASIC7.99□□□□□ -1.13
NrepQ07475 Pcsk9-201ENSMUST00000049507 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
NrepQ07475 Cemip-201ENSMUST00000064174 7111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
NrepQ07475 Pif1-201ENSMUST00000047099 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
NrepQ07475 Adgrl2-217ENSMUST00000200154 5412 ntTSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
NrepQ07475 Slc35a4-206ENSMUST00000186538 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
NrepQ07475 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
NrepQ07475 L3mbtl3-201ENSMUST00000040219 4572 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
NrepQ07475 Rufy4-202ENSMUST00000127134 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
NrepQ07475 Gckr-202ENSMUST00000201166 2272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
NrepQ07475 Pram1-201ENSMUST00000052079 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
NrepQ07475 Exoc4-202ENSMUST00000090381 2598 ntTSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
NrepQ07475 Lama1-201ENSMUST00000035471 9518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
NrepQ07475 Kcnv1-201ENSMUST00000022967 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
NrepQ07475 Nup214-201ENSMUST00000065398 6605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
NrepQ07475 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC7.99□□□□□ -1.13
NrepQ07475 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC7.99□□□□□ -1.13
NrepQ07475 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
NrepQ07475 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
NrepQ07475 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
NrepQ07475 Bbip1-201ENSMUST00000135402 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
NrepQ07475 B230312C02Rik-201ENSMUST00000145549 1703 ntTSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
NrepQ07475 AI854703-202ENSMUST00000154570 3806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.99□□□□□ -1.13
NrepQ07475 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
NrepQ07475 Gm26541-201ENSMUST00000181866 3973 ntTSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
NrepQ07475 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC7.99□□□□□ -1.13
NrepQ07475 Gm18798-201ENSMUST00000187264 1700 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
NrepQ07475 Uba1y-ps1-201ENSMUST00000188314 1708 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
NrepQ07475 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
NrepQ07475 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.99□□□□□ -1.13
NrepQ07475 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC7.99□□□□□ -1.13
NrepQ07475 Gm45641-201ENSMUST00000209775 452 ntTSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
NrepQ07475 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.99□□□□□ -1.13
NrepQ07475 Gm6458-201ENSMUST00000211573 635 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
NrepQ07475 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC7.99□□□□□ -1.13
NrepQ07475 Plek2-201ENSMUST00000021544 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
NrepQ07475 AC123738.2-201ENSMUST00000223791 1899 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
NrepQ07475 Cct5-201ENSMUST00000022842 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 103.2 ms