Protein–RNA interactions for Protein: Q07104

Gdf3, Growth/differentiation factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdf3Q07104 Oscar-203ENSMUST00000148012 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gdf3Q07104 Ctr9-201ENSMUST00000005749 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gdf3Q07104 Camk1g-201ENSMUST00000016323 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gdf3Q07104 Gm43112-201ENSMUST00000196665 3122 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Gdf3Q07104 Slfn1-201ENSMUST00000037994 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gdf3Q07104 Gpr19-203ENSMUST00000111932 1711 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gdf3Q07104 Scn8a-208ENSMUST00000200963 5814 ntTSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gdf3Q07104 H2-M10.3-201ENSMUST00000073546 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gdf3Q07104 Rin1-201ENSMUST00000025818 4184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gdf3Q07104 Lhx9-202ENSMUST00000046870 3645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gdf3Q07104 Zranb2-201ENSMUST00000029831 2540 ntTSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gdf3Q07104 Pax6-204ENSMUST00000111083 2370 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gdf3Q07104 Gabra1-201ENSMUST00000020707 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gdf3Q07104 Srrm4-202ENSMUST00000139425 2798 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gdf3Q07104 Neu4-201ENSMUST00000050890 4511 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gdf3Q07104 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gdf3Q07104 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gdf3Q07104 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gdf3Q07104 Uba52-ps-201ENSMUST00000183770 379 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Gdf3Q07104 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gdf3Q07104 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gdf3Q07104 AC165260.3-202ENSMUST00000224550 1031 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Gdf3Q07104 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Gdf3Q07104 Med27-201ENSMUST00000028139 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gdf3Q07104 Pop1-202ENSMUST00000079028 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gdf3Q07104 Zbtb25-202ENSMUST00000176102 2707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gdf3Q07104 Nol6-201ENSMUST00000030138 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gdf3Q07104 Myo7a-203ENSMUST00000107127 6806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gdf3Q07104 Mkx-201ENSMUST00000079788 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gdf3Q07104 Gm18806-201ENSMUST00000207607 1775 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Gdf3Q07104 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gdf3Q07104 Cdc37l1-201ENSMUST00000050148 5179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gdf3Q07104 Pknox1-206ENSMUST00000176701 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gdf3Q07104 Gckr-202ENSMUST00000201166 2272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gdf3Q07104 Hoxa1-201ENSMUST00000000964 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gdf3Q07104 Gmip-202ENSMUST00000123453 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gdf3Q07104 Elovl5-201ENSMUST00000034904 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gdf3Q07104 Pitpnm2-201ENSMUST00000086123 6620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gdf3Q07104 Ascc1-202ENSMUST00000164083 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gdf3Q07104 Vrk1-201ENSMUST00000021539 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gdf3Q07104 Slc6a21-201ENSMUST00000085364 1732 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gdf3Q07104 Gtf3c1-204ENSMUST00000205659 6570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gdf3Q07104 Cycs-202ENSMUST00000161401 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gdf3Q07104 Fam120b-201ENSMUST00000055352 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gdf3Q07104 Pygo1-201ENSMUST00000038489 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Gdf3Q07104 Mpp4-203ENSMUST00000114275 2982 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Gdf3Q07104 Klhl7-201ENSMUST00000030841 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Gdf3Q07104 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Gdf3Q07104 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Gdf3Q07104 Pigo-202ENSMUST00000098109 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Gdf3Q07104 Spdye4a-201ENSMUST00000085733 1819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Gdf3Q07104 Rnf20-210ENSMUST00000167496 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Gdf3Q07104 N4bp2l1-201ENSMUST00000016279 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Gdf3Q07104 Cyp2b10-202ENSMUST00000072438 1916 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Gdf3Q07104 Adra2b-202ENSMUST00000104934 4014 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Gdf3Q07104 Zfp780b-201ENSMUST00000081618 3004 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Gdf3Q07104 Scaf1-206ENSMUST00000211735 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Gdf3Q07104 Nrg1-212ENSMUST00000208598 1778 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Gdf3Q07104 Vamp5-203ENSMUST00000206154 2619 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Gdf3Q07104 1500009C09Rik-201ENSMUST00000136948 1526 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Gdf3Q07104 Ighv8-9-201ENSMUST00000103533 301 ntAPPRIS P1 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Gdf3Q07104 Ighv8-13-201ENSMUST00000103542 303 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Gdf3Q07104 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Gdf3Q07104 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Gdf3Q07104 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Gdf3Q07104 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Gdf3Q07104 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Gdf3Q07104 Gm17040-201ENSMUST00000168672 548 ntTSL 3 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Gdf3Q07104 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Gdf3Q07104 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Gdf3Q07104 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Gdf3Q07104 Gm6439-201ENSMUST00000199849 862 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Gdf3Q07104 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Gdf3Q07104 Proz-203ENSMUST00000211363 984 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Gdf3Q07104 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Gdf3Q07104 AC099934.4-201ENSMUST00000220745 523 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Gdf3Q07104 Myo16-201ENSMUST00000042103 6725 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Gdf3Q07104 Unc5c-202ENSMUST00000106236 9646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Gdf3Q07104 Slc6a12-205ENSMUST00000166457 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Gdf3Q07104 Rfesd-201ENSMUST00000050997 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Gdf3Q07104 Atp1a2-202ENSMUST00000097464 3186 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Gdf3Q07104 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Gdf3Q07104 Pcdhb22-202ENSMUST00000192409 6609 ntAPPRIS P1 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Gdf3Q07104 Nfya-201ENSMUST00000046719 3645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Gdf3Q07104 Rnh1-201ENSMUST00000106033 2091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Gdf3Q07104 Ap1b1-201ENSMUST00000009234 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Gdf3Q07104 BC025446-201ENSMUST00000055719 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Gdf3Q07104 Tia1-201ENSMUST00000095752 3130 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Gdf3Q07104 Vipas39-202ENSMUST00000072744 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Gdf3Q07104 Olfr763-201ENSMUST00000077460 2523 ntAPPRIS P1 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Gdf3Q07104 Brd3-201ENSMUST00000028282 5419 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Gdf3Q07104 Trim16-202ENSMUST00000072639 1929 ntTSL 2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Gdf3Q07104 Uspl1-201ENSMUST00000050472 3757 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Gdf3Q07104 H2-Q1-201ENSMUST00000073208 2024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gdf3Q07104 Drc7-201ENSMUST00000058479 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gdf3Q07104 2900069G24Rik-201ENSMUST00000192780 1311 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Gdf3Q07104 Syt15-201ENSMUST00000035351 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gdf3Q07104 Mtmr10-201ENSMUST00000032736 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gdf3Q07104 Hmgcll1-201ENSMUST00000008052 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gdf3Q07104 Gm10827-201ENSMUST00000181897 2586 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.3 ms