Protein–RNA interactions for Protein: Q03358

Msx2, Homeobox protein MSX-2, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msx2Q03358 Ikbkb-202ENSMUST00000063401 3977 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Msx2Q03358 Sod3-201ENSMUST00000101208 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Msx2Q03358 Alms1-ps1-201ENSMUST00000159498 2166 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Msx2Q03358 Rpap1-202ENSMUST00000099529 4813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Msx2Q03358 Atl2-202ENSMUST00000112437 3371 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Msx2Q03358 Esam-201ENSMUST00000002011 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Msx2Q03358 Kif3b-201ENSMUST00000028977 5635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Msx2Q03358 Nmrk1-203ENSMUST00000159572 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Msx2Q03358 Gm3716-202ENSMUST00000198582 2879 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Msx2Q03358 Zfp384-206ENSMUST00000112425 2691 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Msx2Q03358 Tgfbr1-201ENSMUST00000007757 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Msx2Q03358 Dync1i2-201ENSMUST00000081710 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Msx2Q03358 Fermt3-201ENSMUST00000040772 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Msx2Q03358 Stat5b-202ENSMUST00000107358 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Msx2Q03358 Pip5k1b-202ENSMUST00000112673 2387 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Msx2Q03358 Gm7553-201ENSMUST00000185805 1426 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Msx2Q03358 Stk38-201ENSMUST00000009138 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Msx2Q03358 Uprt-201ENSMUST00000087867 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Msx2Q03358 Ablim1-213ENSMUST00000111559 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Msx2Q03358 Gtf2i-224ENSMUST00000174772 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Msx2Q03358 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Msx2Q03358 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Msx2Q03358 Rprl1-201ENSMUST00000158050 327 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Msx2Q03358 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Msx2Q03358 Chfr-212ENSMUST00000200038 606 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Msx2Q03358 AC132260.2-201ENSMUST00000224482 344 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Msx2Q03358 1700028J19Rik-201ENSMUST00000037220 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Msx2Q03358 Lgals1-201ENSMUST00000089377 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Msx2Q03358 Sec14l1-202ENSMUST00000090433 4654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Msx2Q03358 Cttn-201ENSMUST00000033407 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Msx2Q03358 Cxcr5-202ENSMUST00000179828 2824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
Msx2Q03358 Zfp532-202ENSMUST00000169679 5003 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
Msx2Q03358 Nfkbiz-202ENSMUST00000096026 4067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Msx2Q03358 Gm37348-201ENSMUST00000193104 1789 ntBASIC11.46□□□□□ -0.58
Msx2Q03358 Nlrp6-201ENSMUST00000106045 3823 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
Msx2Q03358 AC124577.2-201ENSMUST00000217413 2420 ntBASIC11.46□□□□□ -0.58
Msx2Q03358 Papln-202ENSMUST00000121733 4373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Msx2Q03358 Cdnf-201ENSMUST00000036350 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Msx2Q03358 Utp23-203ENSMUST00000137116 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Msx2Q03358 Olfr541-203ENSMUST00000210357 1642 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.58
Msx2Q03358 Rad9b-201ENSMUST00000049009 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Msx2Q03358 AC154671.1-201ENSMUST00000228617 1578 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Msx2Q03358 Scn5a-201ENSMUST00000065196 8287 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Msx2Q03358 Kat6b-201ENSMUST00000069648 7649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Msx2Q03358 Olfr1428-203ENSMUST00000214103 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Msx2Q03358 Fam53b-207ENSMUST00000106169 4536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Msx2Q03358 Slc17a5-201ENSMUST00000052441 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Msx2Q03358 AC211878.3-201ENSMUST00000222629 2018 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Msx2Q03358 Ap1s2-203ENSMUST00000112294 3199 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Msx2Q03358 Slc38a3-201ENSMUST00000010208 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Msx2Q03358 Fbln2-201ENSMUST00000041544 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Msx2Q03358 Dcaf11-202ENSMUST00000117236 2538 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Msx2Q03358 Pou6f1-201ENSMUST00000058274 2523 ntTSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Msx2Q03358 Gm38292-201ENSMUST00000192646 3045 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Msx2Q03358 Gm18782-201ENSMUST00000209023 1399 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Msx2Q03358 Gm15991-202ENSMUST00000212123 3565 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Msx2Q03358 Mpl-202ENSMUST00000102671 2934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Msx2Q03358 Sord-201ENSMUST00000110551 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Msx2Q03358 Gm17244-201ENSMUST00000192482 3416 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Msx2Q03358 Acad9-201ENSMUST00000011492 3930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Msx2Q03358 Dpep2-206ENSMUST00000227363 1844 ntAPPRIS P1 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Msx2Q03358 Grm1-201ENSMUST00000044306 6930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Msx2Q03358 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Msx2Q03358 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Msx2Q03358 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Msx2Q03358 3110056K07Rik-202ENSMUST00000136690 1063 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Msx2Q03358 Gm13570-201ENSMUST00000140763 309 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Msx2Q03358 Gm16191-202ENSMUST00000148464 484 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Msx2Q03358 Asgr1-201ENSMUST00000018699 1259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Msx2Q03358 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Msx2Q03358 Serpina1b-203ENSMUST00000186166 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Msx2Q03358 4931415C17Rik-202ENSMUST00000131064 2255 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Msx2Q03358 Saxo2-201ENSMUST00000056728 2783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Msx2Q03358 Plekhn1-204ENSMUST00000218699 3196 ntTSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Msx2Q03358 Rufy2-203ENSMUST00000122231 2664 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Msx2Q03358 Btrc-209ENSMUST00000224478 2194 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Msx2Q03358 Bpifb6-201ENSMUST00000088955 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Msx2Q03358 Olfr482-202ENSMUST00000217304 2612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Msx2Q03358 Tmc7-201ENSMUST00000044195 4546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Msx2Q03358 Elovl7-201ENSMUST00000022207 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Msx2Q03358 Togaram1-207ENSMUST00000223166 6386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Msx2Q03358 Ttll13-201ENSMUST00000058266 3010 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Msx2Q03358 Cyp2d26-201ENSMUST00000006094 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Msx2Q03358 Otud7b-202ENSMUST00000090785 8101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Msx2Q03358 Plin4-202ENSMUST00000190703 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Msx2Q03358 Dzip1l-203ENSMUST00000112885 4350 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Msx2Q03358 Tmem231-201ENSMUST00000034429 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Msx2Q03358 Ccdc57-201ENSMUST00000056781 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Msx2Q03358 Gm13553-201ENSMUST00000133025 1970 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Msx2Q03358 Trim46-203ENSMUST00000107464 3252 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Msx2Q03358 Lrrfip2-213ENSMUST00000216430 1525 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Msx2Q03358 BC043934-202ENSMUST00000185694 2356 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Msx2Q03358 Adra2b-202ENSMUST00000104934 4014 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Msx2Q03358 Wdr78-203ENSMUST00000106868 4045 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Msx2Q03358 Mfsd13b-201ENSMUST00000033166 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Msx2Q03358 Dscaml1-201ENSMUST00000034592 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Msx2Q03358 Rab27b-201ENSMUST00000069749 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Msx2Q03358 Apc2-201ENSMUST00000020349 9074 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Msx2Q03358 Olfr140-202ENSMUST00000111506 3449 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Msx2Q03358 March1-207ENSMUST00000110258 2581 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.1 ms