Protein–RNA interactions for Protein: Q01727

Mc1r, Melanocyte-stimulating hormone receptor, mousemouse

Predictions only

Length 315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mc1rQ01727 1500011K16Rik-201ENSMUST00000135091 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Mc1rQ01727 Gm16686-201ENSMUST00000141816 396 ntAPPRIS P1 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Mc1rQ01727 Gm13165-201ENSMUST00000152923 383 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Mc1rQ01727 Fhit-201ENSMUST00000160340 1094 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Mc1rQ01727 Fhit-208ENSMUST00000179394 453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Mc1rQ01727 H2al1g-201ENSMUST00000179859 509 ntAPPRIS P1 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Mc1rQ01727 Gm26782-202ENSMUST00000181697 971 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Mc1rQ01727 Swi5-207ENSMUST00000183946 768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Mc1rQ01727 Acy1-208ENSMUST00000214275 1284 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Mc1rQ01727 1700011B04Rik-212ENSMUST00000223526 889 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Mc1rQ01727 Prss52-201ENSMUST00000022537 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Mc1rQ01727 S100a1-201ENSMUST00000060738 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Mc1rQ01727 Aurkc-201ENSMUST00000086248 1154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Mc1rQ01727 Msh5-202ENSMUST00000097338 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Mc1rQ01727 Arsg-202ENSMUST00000106696 1508 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Mc1rQ01727 Spr-ps1-203ENSMUST00000187705 2892 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Mc1rQ01727 Rps6kl1-202ENSMUST00000221972 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Mc1rQ01727 Gm38100-202ENSMUST00000201297 1789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Mc1rQ01727 Fam214a-205ENSMUST00000215370 4205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Mc1rQ01727 Lhcgr-201ENSMUST00000024916 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Mc1rQ01727 AC154639.1-201ENSMUST00000224393 2849 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Mc1rQ01727 Katnal2-207ENSMUST00000137354 1482 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Mc1rQ01727 Nmrk1-203ENSMUST00000159572 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Mc1rQ01727 Abat-201ENSMUST00000065987 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Mc1rQ01727 Col8a1-201ENSMUST00000089332 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Mc1rQ01727 Cacna1g-205ENSMUST00000107786 7984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Mc1rQ01727 Gm5846-201ENSMUST00000193146 1414 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Mc1rQ01727 Tcf25-203ENSMUST00000211932 5002 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Mc1rQ01727 Myo18a-210ENSMUST00000130305 5450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Mc1rQ01727 Prkd1-201ENSMUST00000002765 3653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Mc1rQ01727 Sppl2b-211ENSMUST00000220091 3629 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Mc1rQ01727 Tuft1-201ENSMUST00000006123 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Mc1rQ01727 Shtn1-201ENSMUST00000047511 4081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Mc1rQ01727 Tiam1-214ENSMUST00000164263 3569 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Mc1rQ01727 Gm37542-201ENSMUST00000192563 2832 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Mc1rQ01727 Taf6-202ENSMUST00000110936 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Mc1rQ01727 Dync1i2-202ENSMUST00000100028 2097 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Mc1rQ01727 Spats2l-203ENSMUST00000164302 2088 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Mc1rQ01727 Creb3l2-201ENSMUST00000041093 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Mc1rQ01727 Dstyk-201ENSMUST00000045110 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Mc1rQ01727 Apol7e-201ENSMUST00000096358 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Mc1rQ01727 Adamts16-202ENSMUST00000109694 3378 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Mc1rQ01727 Ufd1-201ENSMUST00000005394 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Mc1rQ01727 Ccl1-202ENSMUST00000108189 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Mc1rQ01727 Gm11700-201ENSMUST00000119409 403 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Mc1rQ01727 Gm14017-201ENSMUST00000121934 386 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Mc1rQ01727 Gm11960-201ENSMUST00000122068 925 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Mc1rQ01727 Gm11290-201ENSMUST00000124833 396 ntTSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Mc1rQ01727 Bnip3-203ENSMUST00000130500 719 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Mc1rQ01727 Hmgn1-202ENSMUST00000133885 261 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Mc1rQ01727 Gm11210-201ENSMUST00000150203 422 ntTSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Mc1rQ01727 C8g-201ENSMUST00000015227 822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Mc1rQ01727 Gm15722-201ENSMUST00000159271 661 ntTSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Mc1rQ01727 Tepp-204ENSMUST00000161029 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Mc1rQ01727 Gm4310-201ENSMUST00000177847 889 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Mc1rQ01727 Zfp229-206ENSMUST00000183192 653 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Mc1rQ01727 Gm42800-201ENSMUST00000202494 733 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Mc1rQ01727 Ccl1-201ENSMUST00000021043 611 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Mc1rQ01727 Cacng1-201ENSMUST00000021065 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Mc1rQ01727 AC107638.1-201ENSMUST00000213690 1061 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Mc1rQ01727 AC093022.1-201ENSMUST00000226949 1072 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Mc1rQ01727 Tex10-201ENSMUST00000030030 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Mc1rQ01727 4931428F04Rik-202ENSMUST00000171788 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Mc1rQ01727 Tns2-201ENSMUST00000046144 4718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Mc1rQ01727 Madd-209ENSMUST00000111371 5816 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Mc1rQ01727 Madd-210ENSMUST00000111372 5813 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Mc1rQ01727 Parvg-201ENSMUST00000023074 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Mc1rQ01727 Trpm1-221ENSMUST00000206706 2350 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Mc1rQ01727 Pitpnb-201ENSMUST00000086635 2761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Mc1rQ01727 Atl3-202ENSMUST00000170373 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Mc1rQ01727 Cmtm6-201ENSMUST00000035007 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Mc1rQ01727 H2afv-202ENSMUST00000109737 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Mc1rQ01727 Arhgap27-204ENSMUST00000107024 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Mc1rQ01727 Morf4l2-204ENSMUST00000113097 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Mc1rQ01727 Rapgef6-202ENSMUST00000101206 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Mc1rQ01727 Ttbk2-203ENSMUST00000085840 11152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Mc1rQ01727 Tbc1d1-204ENSMUST00000121370 5419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Mc1rQ01727 Arhgef2-206ENSMUST00000175779 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Mc1rQ01727 Foxl2os-201ENSMUST00000181706 3095 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Mc1rQ01727 Chtop-201ENSMUST00000001043 3257 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Mc1rQ01727 Nr4a2-202ENSMUST00000112627 2400 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Mc1rQ01727 Tfdp2-205ENSMUST00000179416 2408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Mc1rQ01727 Gm43242-201ENSMUST00000199507 1776 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Mc1rQ01727 Rragd-202ENSMUST00000084747 4295 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Mc1rQ01727 Csnk1a1-202ENSMUST00000163205 3204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Mc1rQ01727 Gck-203ENSMUST00000109823 2361 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Mc1rQ01727 1700030J22Rik-201ENSMUST00000070577 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Mc1rQ01727 Ptchd3-201ENSMUST00000036690 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Mc1rQ01727 Zfp426-202ENSMUST00000115562 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Mc1rQ01727 Lgals3bp-201ENSMUST00000043722 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Mc1rQ01727 Tjp3-205ENSMUST00000219479 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Mc1rQ01727 Mamld1-202ENSMUST00000114629 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Mc1rQ01727 Rpl11-201ENSMUST00000102536 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Mc1rQ01727 Lmo3-202ENSMUST00000161450 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Mc1rQ01727 Gm2383-201ENSMUST00000181461 807 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Mc1rQ01727 Gm26759-201ENSMUST00000181773 1251 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Mc1rQ01727 Gm27530-201ENSMUST00000184096 98 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Mc1rQ01727 Gm2260-201ENSMUST00000184965 657 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Mc1rQ01727 Gm28686-201ENSMUST00000187404 609 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Mc1rQ01727 Gm38228-201ENSMUST00000193169 1293 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.1 ms