Protein–RNA interactions for Protein: Q01231

Gja5, Gap junction alpha-5 protein, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gja5Q01231 Gm16219-201ENSMUST00000120096 274 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
Gja5Q01231 Syngr4-202ENSMUST00000120299 722 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Gja5Q01231 Isg20-203ENSMUST00000120331 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Gja5Q01231 Gm13981-201ENSMUST00000122360 447 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
Gja5Q01231 Gm12906-201ENSMUST00000154610 441 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
Gja5Q01231 Gm25226-201ENSMUST00000158198 123 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
Gja5Q01231 Gm4982-201ENSMUST00000160440 1098 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
Gja5Q01231 Lrrc27-201ENSMUST00000016124 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Gja5Q01231 Adora3-202ENSMUST00000164730 1219 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Gja5Q01231 Ly6e-207ENSMUST00000187606 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Gja5Q01231 Akr1c18-201ENSMUST00000021635 1200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Gja5Q01231 Hddc2-201ENSMUST00000000304 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Gja5Q01231 Gm9791-201ENSMUST00000060997 447 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
Gja5Q01231 Tdpoz3-201ENSMUST00000081780 1098 ntAPPRIS P1 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Gja5Q01231 Ccndbp1-202ENSMUST00000099488 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Gja5Q01231 Maged2-202ENSMUST00000112697 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Gja5Q01231 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Gja5Q01231 Sh3kbp1-201ENSMUST00000073094 2280 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Gja5Q01231 Smarca1-205ENSMUST00000141084 1965 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Gja5Q01231 Copz1-201ENSMUST00000100162 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Gja5Q01231 Qrfpr-203ENSMUST00000197447 1690 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Gja5Q01231 Tuft1-201ENSMUST00000006123 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Gja5Q01231 Hcls1-201ENSMUST00000023531 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Gja5Q01231 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Gja5Q01231 Slc4a2-202ENSMUST00000115047 4264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Gja5Q01231 Gm11986-201ENSMUST00000149481 1439 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Gja5Q01231 Rab3c-202ENSMUST00000223922 2398 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
Gja5Q01231 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Gja5Q01231 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Gja5Q01231 Ppp1r32-201ENSMUST00000038842 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Gja5Q01231 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Gja5Q01231 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Gja5Q01231 Ank2-203ENSMUST00000182008 2474 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Gja5Q01231 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Gja5Q01231 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Gja5Q01231 Mta1-202ENSMUST00000069690 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Gja5Q01231 Mir453-201ENSMUST00000104732 82 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
Gja5Q01231 Art5-203ENSMUST00000106935 495 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Gja5Q01231 Rpl35a-205ENSMUST00000115079 510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Gja5Q01231 Gm9166-201ENSMUST00000120293 561 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
Gja5Q01231 Gm15196-201ENSMUST00000121406 482 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
Gja5Q01231 1110028F11Rik-201ENSMUST00000137077 837 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Gja5Q01231 Gm11417-201ENSMUST00000150536 920 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Gja5Q01231 Gm23675-201ENSMUST00000157311 125 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
Gja5Q01231 Gm7985-201ENSMUST00000183329 981 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
Gja5Q01231 Mir7035-201ENSMUST00000184713 82 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
Gja5Q01231 C630004L07Rik-201ENSMUST00000193236 1275 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
Gja5Q01231 Gm44323-201ENSMUST00000198689 129 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
Gja5Q01231 Gm43506-201ENSMUST00000200675 753 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
Gja5Q01231 AI839979-201ENSMUST00000200738 654 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Gja5Q01231 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Gja5Q01231 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Gja5Q01231 Hyal3-202ENSMUST00000148440 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Gja5Q01231 Ncald-211ENSMUST00000168992 3538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Gja5Q01231 Herpud1-201ENSMUST00000034220 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Gja5Q01231 Usp3-211ENSMUST00000174387 1901 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Gja5Q01231 Tcf4-243ENSMUST00000202057 1941 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Gja5Q01231 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Gja5Q01231 Cysltr2-202ENSMUST00000169168 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Gja5Q01231 Gm32479-201ENSMUST00000204226 2739 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Gja5Q01231 Pank4-202ENSMUST00000070953 2706 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Gja5Q01231 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Gja5Q01231 Gm25562-201ENSMUST00000104608 133 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
Gja5Q01231 Cidec-203ENSMUST00000113091 785 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Gja5Q01231 Gm8111-201ENSMUST00000117659 987 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
Gja5Q01231 Gm11269-201ENSMUST00000157011 595 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Gja5Q01231 Fhit-201ENSMUST00000160340 1094 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Gja5Q01231 Fhit-204ENSMUST00000161302 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Gja5Q01231 Fhit-208ENSMUST00000179394 453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Gja5Q01231 Gm28913-201ENSMUST00000186240 364 ntTSL 3 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Gja5Q01231 Gm37452-201ENSMUST00000194416 1160 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
Gja5Q01231 Gm9204-201ENSMUST00000212641 947 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
Gja5Q01231 Gm2594-201ENSMUST00000214774 742 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
Gja5Q01231 Ly86-201ENSMUST00000021860 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Gja5Q01231 Olfr335-ps-201ENSMUST00000223545 939 ntAPPRIS P1 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Gja5Q01231 Arhgef33-210ENSMUST00000225548 456 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
Gja5Q01231 Mustn1-201ENSMUST00000040715 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Gja5Q01231 Krtap4-1-201ENSMUST00000081007 1015 ntAPPRIS P1 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Gja5Q01231 Mir326-201ENSMUST00000083637 95 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
Gja5Q01231 P2rx7-202ENSMUST00000086247 712 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Gja5Q01231 Gm12200-201ENSMUST00000144876 1858 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Gja5Q01231 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Gja5Q01231 F10-201ENSMUST00000033821 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Gja5Q01231 Gm42957-201ENSMUST00000137564 3624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Gja5Q01231 Rbm5-201ENSMUST00000035199 3064 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Gja5Q01231 Grin1-201ENSMUST00000028335 4238 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Gja5Q01231 Slc24a5-201ENSMUST00000070353 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Gja5Q01231 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Gja5Q01231 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Gja5Q01231 Armcx3-202ENSMUST00000086880 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Gja5Q01231 Zscan22-201ENSMUST00000055528 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Gja5Q01231 Bckdk-201ENSMUST00000071056 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Gja5Q01231 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Gja5Q01231 1500004A13Rik-209ENSMUST00000185189 1659 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Gja5Q01231 Neu2-207ENSMUST00000172222 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Gja5Q01231 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Gja5Q01231 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Gja5Q01231 Palb2-204ENSMUST00000106469 2559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Gja5Q01231 Zc3hc1-202ENSMUST00000102992 1865 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Gja5Q01231 Stau1-203ENSMUST00000109236 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms