Protein–RNA interactions for Protein: P97350

Pkp1, Plakophilin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 728 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp1P97350 Hist1h3a-201ENSMUST00000091701 534 ntAPPRIS P1 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Pkp1P97350 Rnf123-218ENSMUST00000178267 4309 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Pkp1P97350 Padi2-201ENSMUST00000030765 4774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Pkp1P97350 Nnt-201ENSMUST00000069902 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Pkp1P97350 Mlc1-201ENSMUST00000042594 2783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Pkp1P97350 Pcgf2-202ENSMUST00000103148 1438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Pkp1P97350 Vps54-202ENSMUST00000109578 4273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Pkp1P97350 Tcn2-203ENSMUST00000109989 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Pkp1P97350 Ppl-201ENSMUST00000035672 6277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Pkp1P97350 Mfsd4b5-202ENSMUST00000073618 2978 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Pkp1P97350 Cyp26b1-204ENSMUST00000204146 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Pkp1P97350 Nr3c1-201ENSMUST00000025300 4989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Pkp1P97350 Jarid2-201ENSMUST00000044608 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Pkp1P97350 Grpel2-201ENSMUST00000062991 4030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Pkp1P97350 Gtf2e1-201ENSMUST00000023525 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Pkp1P97350 Uspl1-201ENSMUST00000050472 3757 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Pkp1P97350 3110062M04Rik-203ENSMUST00000115007 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Pkp1P97350 Fbxo39-201ENSMUST00000108504 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Pkp1P97350 Cdc45-202ENSMUST00000096990 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Pkp1P97350 Plekhg2-203ENSMUST00000121085 4649 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Pkp1P97350 BC017643-201ENSMUST00000038709 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Pkp1P97350 Ephx3-201ENSMUST00000087721 2416 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Pkp1P97350 Gm21319-201ENSMUST00000164517 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Pkp1P97350 F830115B05Rik-201ENSMUST00000197638 1894 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Pkp1P97350 Ccl1-202ENSMUST00000108189 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Pkp1P97350 Rpl36-ps10-201ENSMUST00000117431 216 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Pkp1P97350 Gm10863-201ENSMUST00000130745 438 ntTSL 3 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Pkp1P97350 Gm44805-202ENSMUST00000150569 587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Pkp1P97350 Cmtm1-201ENSMUST00000159039 1130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Pkp1P97350 Gm17334-201ENSMUST00000170390 907 ntAPPRIS P1 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Pkp1P97350 Rpl41-203ENSMUST00000176683 437 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Pkp1P97350 Gm8343-201ENSMUST00000182705 994 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Pkp1P97350 Vmn1r205-201ENSMUST00000185475 951 ntAPPRIS P1 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Pkp1P97350 Gm38117-201ENSMUST00000194653 939 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Pkp1P97350 Gm45186-201ENSMUST00000206874 478 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Pkp1P97350 Ccl1-201ENSMUST00000021043 611 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Pkp1P97350 Gm4157-201ENSMUST00000211647 679 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Pkp1P97350 Olfr156-202ENSMUST00000079465 1099 ntAPPRIS P1 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Pkp1P97350 Trpm1-210ENSMUST00000205731 2575 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Pkp1P97350 Src-201ENSMUST00000029175 3906 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Pkp1P97350 Aldh1a7-201ENSMUST00000025656 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Pkp1P97350 A530013C23Rik-202ENSMUST00000141923 3489 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Pkp1P97350 Adamts13-201ENSMUST00000014996 3474 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Pkp1P97350 Nckap5l-201ENSMUST00000023747 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Pkp1P97350 Nxf1-211ENSMUST00000184970 5591 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Pkp1P97350 Gm44755-201ENSMUST00000207830 2102 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Pkp1P97350 Mzf1-201ENSMUST00000069289 3597 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Pkp1P97350 Gpd1-201ENSMUST00000023760 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Pkp1P97350 Gm12915-201ENSMUST00000131381 1499 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Pkp1P97350 Cd40-201ENSMUST00000017799 2986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Pkp1P97350 Shank2-203ENSMUST00000105902 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Pkp1P97350 Zbtb24-205ENSMUST00000216656 2476 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Pkp1P97350 Luc7l-201ENSMUST00000025023 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Pkp1P97350 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Pkp1P97350 Eif4g1-217ENSMUST00000143939 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Pkp1P97350 Far2-201ENSMUST00000032443 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Pkp1P97350 Ttc30b-201ENSMUST00000099996 2737 ntAPPRIS P1 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Pkp1P97350 Gm33677-201ENSMUST00000220074 2765 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Pkp1P97350 Tfr2-201ENSMUST00000031729 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Pkp1P97350 Slc6a16-201ENSMUST00000179310 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Pkp1P97350 Ighv2-6-8-201ENSMUST00000103455 342 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Pkp1P97350 4933406I18Rik-201ENSMUST00000124673 905 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Pkp1P97350 Naa60-207ENSMUST00000150655 1166 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Pkp1P97350 Gm28937-201ENSMUST00000185413 695 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Pkp1P97350 Gm29400-201ENSMUST00000187208 695 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Pkp1P97350 Gm28662-201ENSMUST00000188446 695 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Pkp1P97350 Gm28251-201ENSMUST00000188835 695 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Pkp1P97350 Gm37318-201ENSMUST00000194325 695 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Pkp1P97350 Gm38017-201ENSMUST00000194768 695 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Pkp1P97350 Gm37287-201ENSMUST00000195449 695 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Pkp1P97350 Gm37793-201ENSMUST00000195548 695 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Pkp1P97350 1700016D08Rik-202ENSMUST00000195807 368 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Pkp1P97350 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Pkp1P97350 Olfr1380-201ENSMUST00000204300 938 ntAPPRIS P1 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Pkp1P97350 1700011B04Rik-212ENSMUST00000223526 889 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Pkp1P97350 AC134869.4-202ENSMUST00000224350 837 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Pkp1P97350 Gm10254-201ENSMUST00000052888 867 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Pkp1P97350 Asb18-202ENSMUST00000097656 788 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Pkp1P97350 E130018N17Rik-201ENSMUST00000129713 1309 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Pkp1P97350 Abi1-204ENSMUST00000114544 2790 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Pkp1P97350 Crcp-201ENSMUST00000026608 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Pkp1P97350 Arhgap30-201ENSMUST00000056449 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Pkp1P97350 AL670603.1-201ENSMUST00000216692 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Pkp1P97350 Tagln2-202ENSMUST00000111230 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Pkp1P97350 Chit1-203ENSMUST00000160060 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Pkp1P97350 Olfr156-203ENSMUST00000214843 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Pkp1P97350 Nnt-203ENSMUST00000109204 3198 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Pkp1P97350 Hnrnpa2b1-202ENSMUST00000090002 1662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Pkp1P97350 Tfdp1-201ENSMUST00000170909 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Pkp1P97350 Vrk1-201ENSMUST00000021539 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Pkp1P97350 Cacng5-201ENSMUST00000039071 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Pkp1P97350 Mbtps2-203ENSMUST00000112522 3891 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Pkp1P97350 Mbtps2-208ENSMUST00000179062 3890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Pkp1P97350 Amigo3-201ENSMUST00000085060 2543 ntAPPRIS P1 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Pkp1P97350 Ttc25-201ENSMUST00000006976 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Pkp1P97350 Sept8-204ENSMUST00000121334 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
Pkp1P97350 Fbrs-207ENSMUST00000206394 2961 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
Pkp1P97350 Ctnnal1-201ENSMUST00000045142 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Pkp1P97350 Sin3b-201ENSMUST00000004494 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Pkp1P97350 Sorcs1-201ENSMUST00000072685 4396 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
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