Protein–RNA interactions for Protein: P70255

Nfic, Nuclear factor 1 C-type, mousemouse

Predictions only

Length 439 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NficP70255 Cend1-203ENSMUST00000137488 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
NficP70255 Fry-201ENSMUST00000087204 10893 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
NficP70255 4930520O04Rik-202ENSMUST00000131898 2660 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
NficP70255 Patl1-201ENSMUST00000061618 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
NficP70255 Th-202ENSMUST00000105929 1950 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
NficP70255 Mfsd4b5-205ENSMUST00000170579 1554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
NficP70255 Tmcc3os-201ENSMUST00000146744 2912 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
NficP70255 Manea-201ENSMUST00000041374 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
NficP70255 Poll-201ENSMUST00000026239 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
NficP70255 Gpr101-201ENSMUST00000057645 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
NficP70255 Mroh5-202ENSMUST00000110021 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
NficP70255 Gm43172-201ENSMUST00000202139 2137 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
NficP70255 Sel1l-204ENSMUST00000167466 5544 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
NficP70255 Pou4f2-201ENSMUST00000034115 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
NficP70255 Ablim2-203ENSMUST00000114203 1333 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
NficP70255 Arhgef3-204ENSMUST00000225949 3198 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
NficP70255 Zfp286-211ENSMUST00000207597 1668 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
NficP70255 Pias2-203ENSMUST00000168882 4984 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
NficP70255 3425401B19Rik-201ENSMUST00000096038 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
NficP70255 Pde6c-201ENSMUST00000025956 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
NficP70255 Lsm10-203ENSMUST00000179323 808 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
NficP70255 A430027H14Rik-202ENSMUST00000192797 618 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
NficP70255 Txndc17-201ENSMUST00000021158 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
NficP70255 Cdk19os-201ENSMUST00000044774 534 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
NficP70255 Ptprr-204ENSMUST00000128399 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
NficP70255 Sec14l1-202ENSMUST00000090433 4654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
NficP70255 Drd1-202ENSMUST00000221470 3576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
NficP70255 Phka2-203ENSMUST00000112377 3947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
NficP70255 Gjd4-201ENSMUST00000041007 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
NficP70255 Gm36855-203ENSMUST00000216660 1406 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
NficP70255 Bpi-202ENSMUST00000109499 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
NficP70255 Ank1-204ENSMUST00000117270 5652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
NficP70255 Galnt11-202ENSMUST00000114950 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
NficP70255 Lsg1-201ENSMUST00000117363 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
NficP70255 Tmem136-201ENSMUST00000061833 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
NficP70255 Anapc4-201ENSMUST00000031072 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
NficP70255 Asb7-202ENSMUST00000124899 4928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
NficP70255 Fam45a-202ENSMUST00000119633 2267 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
NficP70255 A630075F10Rik-201ENSMUST00000180895 1913 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
NficP70255 Cep76-201ENSMUST00000097542 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
NficP70255 Lingo4-201ENSMUST00000050975 3645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
NficP70255 Tpra1-218ENSMUST00000203185 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
NficP70255 Ccr4-202ENSMUST00000215425 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
NficP70255 Edil3-202ENSMUST00000081769 5317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
NficP70255 Med13l-201ENSMUST00000100816 9296 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
NficP70255 L3mbtl2-208ENSMUST00000174229 2578 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
NficP70255 Zfp108-203ENSMUST00000206777 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
NficP70255 Taf1b-201ENSMUST00000075954 2209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
NficP70255 Lipo2-201ENSMUST00000147153 3562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
NficP70255 Gm9008-201ENSMUST00000097218 2353 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
NficP70255 Chit1-202ENSMUST00000159963 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
NficP70255 Rragd-202ENSMUST00000084747 4295 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
NficP70255 Henmt1-205ENSMUST00000196533 1491 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
NficP70255 Srfbp1-201ENSMUST00000025406 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
NficP70255 Zfp341-201ENSMUST00000081926 3299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
NficP70255 Snap29-201ENSMUST00000023449 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
NficP70255 Zfp646-201ENSMUST00000050383 6310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
NficP70255 Chchd7-202ENSMUST00000108386 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
NficP70255 Dixdc1-204ENSMUST00000118707 989 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
NficP70255 Chchd7-206ENSMUST00000121110 381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
NficP70255 Gm14381-201ENSMUST00000122105 414 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
NficP70255 Mitd1-205ENSMUST00000139725 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
NficP70255 Abhd14a-203ENSMUST00000171925 1122 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
NficP70255 Cdk3-ps-202ENSMUST00000174177 915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
NficP70255 Gm43179-201ENSMUST00000198797 275 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
NficP70255 Gm3961-201ENSMUST00000204425 994 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
NficP70255 Gm45331-201ENSMUST00000209868 554 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
NficP70255 Gm45598-202ENSMUST00000210719 986 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
NficP70255 Caly-204ENSMUST00000211283 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
NficP70255 Hspb2-202ENSMUST00000217159 552 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
NficP70255 Ankrd33-201ENSMUST00000070875 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
NficP70255 Birc3-201ENSMUST00000013949 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
NficP70255 Grin1-208ENSMUST00000114318 3920 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
NficP70255 Tardbp-206ENSMUST00000105702 6425 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
NficP70255 Gm42913-201ENSMUST00000197936 1853 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
NficP70255 Hars2-201ENSMUST00000019287 2002 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
NficP70255 Ubxn10-203ENSMUST00000105811 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
NficP70255 Dock6-207ENSMUST00000217336 6880 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
NficP70255 Htr1b-202ENSMUST00000183482 4724 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.55
NficP70255 Osgin1-201ENSMUST00000098365 1959 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
NficP70255 Eps15l1-201ENSMUST00000163643 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
NficP70255 Oraov1-204ENSMUST00000128057 2231 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
NficP70255 Bpi-201ENSMUST00000065039 1926 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
NficP70255 Cldn18-202ENSMUST00000112882 1750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
NficP70255 Npr2-201ENSMUST00000030191 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
NficP70255 Slc20a1-202ENSMUST00000110315 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
NficP70255 Hoxc5-201ENSMUST00000001709 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
NficP70255 Nfasc-203ENSMUST00000163770 3903 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
NficP70255 Alms1-ps1-201ENSMUST00000159498 2166 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
NficP70255 Sdr9c7-201ENSMUST00000047134 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
NficP70255 Snap23-203ENSMUST00000116437 2730 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
NficP70255 Tcf25-202ENSMUST00000108840 2582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
NficP70255 Stpg3-201ENSMUST00000043774 1430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
NficP70255 Ddx11-205ENSMUST00000224497 4141 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
NficP70255 Gm24255-201ENSMUST00000104481 128 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
NficP70255 Prox1os-201ENSMUST00000110279 828 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
NficP70255 Gm14019-201ENSMUST00000131514 403 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
NficP70255 Mir1938-201ENSMUST00000158746 100 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
NficP70255 Retn-202ENSMUST00000169234 1139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
NficP70255 Gm20470-201ENSMUST00000174654 331 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.1 ms