Protein–RNA interactions for Protein: P50207

Hoxc13, Homeobox protein Hox-C13, mousemouse

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Length 328 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc13P50207 Taf9-201ENSMUST00000167256 1230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Hoxc13P50207 Gm29164-201ENSMUST00000185454 1024 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Hoxc13P50207 1700008K24Rik-201ENSMUST00000185974 833 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Hoxc13P50207 Med8-201ENSMUST00000019229 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Hoxc13P50207 Gm37981-201ENSMUST00000194280 535 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Hoxc13P50207 Gm43002-201ENSMUST00000200310 155 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Hoxc13P50207 Gm7504-201ENSMUST00000201449 424 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Hoxc13P50207 Gm44421-201ENSMUST00000205064 1221 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Hoxc13P50207 Gm44980-201ENSMUST00000205826 314 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Hoxc13P50207 Gm17825-201ENSMUST00000206836 794 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Hoxc13P50207 Gm8285-201ENSMUST00000208293 759 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Hoxc13P50207 Gm9132-201ENSMUST00000210182 832 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Hoxc13P50207 AC122891.1-201ENSMUST00000218671 268 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Hoxc13P50207 C330004P14Rik-201ENSMUST00000218833 628 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Hoxc13P50207 AC099934.4-201ENSMUST00000220745 523 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Hoxc13P50207 Npff-201ENSMUST00000023814 540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Hoxc13P50207 Ccdc28b-201ENSMUST00000030586 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Hoxc13P50207 Hopx-201ENSMUST00000081964 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Hoxc13P50207 Rad54l-202ENSMUST00000102705 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Hoxc13P50207 Tcn2-203ENSMUST00000109989 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Hoxc13P50207 Exoc3l4-209ENSMUST00000222897 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Hoxc13P50207 Tspan9-202ENSMUST00000112171 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Hoxc13P50207 Gm20757-201ENSMUST00000182870 1604 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Hoxc13P50207 Slc22a4-201ENSMUST00000020586 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Hoxc13P50207 Olfr648-202ENSMUST00000216612 2929 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Hoxc13P50207 Ldhd-201ENSMUST00000070004 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Hoxc13P50207 Gm39168-201ENSMUST00000210181 1423 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Hoxc13P50207 Prps1-201ENSMUST00000033809 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Hoxc13P50207 Gm14169-201ENSMUST00000124676 2519 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Hoxc13P50207 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Hoxc13P50207 Slc26a6-201ENSMUST00000098376 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Hoxc13P50207 Slc6a9-210ENSMUST00000169885 1876 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Hoxc13P50207 Gp2-202ENSMUST00000207887 1853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Hoxc13P50207 Ttpa-203ENSMUST00000121491 2862 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Hoxc13P50207 Zrsr2-201ENSMUST00000090840 3867 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Hoxc13P50207 Oprm1-205ENSMUST00000078634 1695 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Hoxc13P50207 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
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Hoxc13P50207 Klhl6-201ENSMUST00000058839 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Hoxc13P50207 Fam83h-201ENSMUST00000060807 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Hoxc13P50207 Sectm1b-201ENSMUST00000039309 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Hoxc13P50207 Grin1-201ENSMUST00000028335 4238 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
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Hoxc13P50207 Sult1a1-202ENSMUST00000106372 1369 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Hoxc13P50207 Slc10a3-204ENSMUST00000114147 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Hoxc13P50207 Gm3830-201ENSMUST00000185540 1715 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Hoxc13P50207 Gm15972-201ENSMUST00000132571 418 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Hoxc13P50207 2310057J18Rik-204ENSMUST00000152363 1043 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Hoxc13P50207 1700088E04Rik-201ENSMUST00000169604 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
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Hoxc13P50207 1700088E04Rik-203ENSMUST00000186053 535 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
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Hoxc13P50207 Timm9-201ENSMUST00000021486 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
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Hoxc13P50207 5830428M24Rik-204ENSMUST00000223143 1034 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Hoxc13P50207 Gm10109-201ENSMUST00000072123 1078 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
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Hoxc13P50207 Bpgm-201ENSMUST00000045372 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
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Hoxc13P50207 Lsg1-201ENSMUST00000117363 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Hoxc13P50207 AC166836.1-201ENSMUST00000219933 1795 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Hoxc13P50207 Hspa14-201ENSMUST00000027961 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Hoxc13P50207 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Hoxc13P50207 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Hoxc13P50207 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Hoxc13P50207 Olfr56-202ENSMUST00000102785 1930 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Hoxc13P50207 Gprc5d-202ENSMUST00000111922 1317 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Hoxc13P50207 Slc38a6-206ENSMUST00000140523 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Hoxc13P50207 Gm37122-201ENSMUST00000195313 1567 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Hoxc13P50207 Tbx4-203ENSMUST00000108047 3153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hoxc13P50207 Tmem25-202ENSMUST00000114705 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hoxc13P50207 Tnk2os-201ENSMUST00000141256 1392 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hoxc13P50207 4921507P07Rik-201ENSMUST00000031852 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hoxc13P50207 Plce1-204ENSMUST00000182481 8357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hoxc13P50207 Kdm4d-201ENSMUST00000058796 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hoxc13P50207 Gngt2-205ENSMUST00000107711 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hoxc13P50207 Rtn2-202ENSMUST00000108468 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hoxc13P50207 Gm15615-201ENSMUST00000118876 198 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Hoxc13P50207 Gm16071-201ENSMUST00000119589 793 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Hoxc13P50207 Dusp13-204ENSMUST00000120984 976 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hoxc13P50207 Gm14397-201ENSMUST00000124728 576 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hoxc13P50207 E130307A14Rik-204ENSMUST00000139356 701 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hoxc13P50207 Aamdc-213ENSMUST00000154853 883 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hoxc13P50207 Prss36-208ENSMUST00000156152 1132 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hoxc13P50207 7530416G11Rik-201ENSMUST00000178942 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hoxc13P50207 9930004E17Rik-201ENSMUST00000180031 498 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Hoxc13P50207 Gm5342-201ENSMUST00000181982 1003 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
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