Protein–RNA interactions for Protein: P49935

Ctsh, Pro-cathepsin H, mousemouse

Predictions only

Length 333 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtshP49935 AC136986.1-201ENSMUST00000222829 380 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CtshP49935 n-R5s211-201ENSMUST00000093689 119 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
CtshP49935 Mapk4-202ENSMUST00000159162 3514 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CtshP49935 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CtshP49935 Ank2-203ENSMUST00000182008 2474 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CtshP49935 P2rx1-201ENSMUST00000021141 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CtshP49935 Immt-202ENSMUST00000101301 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CtshP49935 Gucy2e-201ENSMUST00000021259 8331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CtshP49935 Tmem63b-201ENSMUST00000113523 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CtshP49935 Nyap1-202ENSMUST00000118326 4565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CtshP49935 Pak1-201ENSMUST00000033040 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CtshP49935 H2afv-202ENSMUST00000109737 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CtshP49935 Snrk-203ENSMUST00000120173 4758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CtshP49935 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CtshP49935 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CtshP49935 Nrxn1-215ENSMUST00000173917 1439 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CtshP49935 Gm18642-201ENSMUST00000206642 1400 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
CtshP49935 Fig4-201ENSMUST00000043814 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CtshP49935 Ap5b1-201ENSMUST00000096318 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CtshP49935 Abcg2-202ENSMUST00000114294 2178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CtshP49935 Gm11960-201ENSMUST00000122068 925 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
CtshP49935 Tro-208ENSMUST00000164071 891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CtshP49935 Rn7s6-201ENSMUST00000175005 291 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
CtshP49935 Gm7271-202ENSMUST00000191515 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CtshP49935 Gm37826-201ENSMUST00000195329 322 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
CtshP49935 Fxyd4-202ENSMUST00000203066 522 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CtshP49935 Myl6-211ENSMUST00000219236 692 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CtshP49935 CT009536.2-201ENSMUST00000225370 665 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
CtshP49935 Pik3r1-201ENSMUST00000035532 2923 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CtshP49935 Chpf2-202ENSMUST00000121863 3715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CtshP49935 Egr2-202ENSMUST00000105438 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CtshP49935 Axin2-201ENSMUST00000052915 4260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CtshP49935 Lrrc3-201ENSMUST00000057608 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CtshP49935 Selenot-201ENSMUST00000107924 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CtshP49935 Npy5r-202ENSMUST00000211920 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CtshP49935 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CtshP49935 Nelfcd-202ENSMUST00000109075 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CtshP49935 Nelfcd-201ENSMUST00000016397 2280 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CtshP49935 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CtshP49935 Cyyr1-201ENSMUST00000114174 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CtshP49935 Syvn1-204ENSMUST00000138532 3464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CtshP49935 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CtshP49935 Srp54a-202ENSMUST00000220578 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CtshP49935 AC093022.4-203ENSMUST00000228523 2657 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
CtshP49935 Gm11413-201ENSMUST00000155822 1461 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CtshP49935 Papss1-201ENSMUST00000029666 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CtshP49935 Mtmr3-201ENSMUST00000040448 5534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CtshP49935 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CtshP49935 Wdr92-201ENSMUST00000046955 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CtshP49935 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CtshP49935 Gm17435-202ENSMUST00000212699 1998 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
CtshP49935 Zbtb20-201ENSMUST00000079441 3086 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CtshP49935 Pisd-203ENSMUST00000120591 2491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CtshP49935 Herc3-201ENSMUST00000031823 3596 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CtshP49935 Vmn1r198-202ENSMUST00000226786 6195 ntAPPRIS P2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CtshP49935 Catsper3-201ENSMUST00000021961 1330 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CtshP49935 AC138329.2-201ENSMUST00000225579 1842 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
CtshP49935 Tmem132a-202ENSMUST00000120524 3895 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CtshP49935 Gm14892-201ENSMUST00000117636 267 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
CtshP49935 Selenot-ps-201ENSMUST00000119098 593 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
CtshP49935 Gm11651-201ENSMUST00000130673 529 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CtshP49935 Bach2it1-201ENSMUST00000133451 481 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CtshP49935 Gm11789-203ENSMUST00000140645 737 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CtshP49935 Cideb-201ENSMUST00000001497 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CtshP49935 Gm2449-201ENSMUST00000180676 585 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CtshP49935 Gm29410-201ENSMUST00000188383 694 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
CtshP49935 Nmur1-201ENSMUST00000027440 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CtshP49935 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CtshP49935 Hid1-202ENSMUST00000106542 3276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CtshP49935 Prkcd-204ENSMUST00000112206 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CtshP49935 Fndc8-201ENSMUST00000018988 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CtshP49935 4930432E11Rik-202ENSMUST00000063585 10871 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
CtshP49935 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CtshP49935 Rims1-205ENSMUST00000097811 6446 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CtshP49935 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CtshP49935 Calcoco1-201ENSMUST00000023818 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CtshP49935 Arhgef10l-202ENSMUST00000069623 4531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CtshP49935 Gm17276-201ENSMUST00000180839 2782 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CtshP49935 Slc25a13-203ENSMUST00000188414 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CtshP49935 AC108858.2-201ENSMUST00000228186 1425 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
CtshP49935 Cib2-201ENSMUST00000041901 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CtshP49935 Pbld2-201ENSMUST00000020262 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CtshP49935 Vamp1-203ENSMUST00000100942 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CtshP49935 Txndc5-203ENSMUST00000160653 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CtshP49935 Arrb1-201ENSMUST00000032995 3715 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CtshP49935 Jpt2-201ENSMUST00000024981 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CtshP49935 Dmrtc1b-203ENSMUST00000118842 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CtshP49935 Gm19692-201ENSMUST00000203856 2084 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
CtshP49935 Abcc5-202ENSMUST00000079158 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CtshP49935 Zrsr2-201ENSMUST00000090840 3867 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CtshP49935 5033428I22Rik-201ENSMUST00000181638 2040 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CtshP49935 Gm2000-201ENSMUST00000102782 445 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CtshP49935 Gm25063-201ENSMUST00000104666 94 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
CtshP49935 Rs1-202ENSMUST00000112368 731 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CtshP49935 Gm14395-201ENSMUST00000120494 563 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
CtshP49935 Nudt6-207ENSMUST00000141438 899 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CtshP49935 Snhg17-205ENSMUST00000151331 529 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CtshP49935 Lyzl4os-202ENSMUST00000156364 726 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CtshP49935 Gm3671-201ENSMUST00000182463 1007 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
CtshP49935 Pdcd5-ps-201ENSMUST00000191699 381 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.9 ms