Protein–RNA interactions for Protein: P46638

Rab11b, Ras-related protein Rab-11B, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab11bP46638 Camk2g-203ENSMUST00000100837 3564 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Rab11bP46638 Dbh-201ENSMUST00000000910 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Rab11bP46638 Prdx2-202ENSMUST00000109733 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Rab11bP46638 Gm5441-201ENSMUST00000186454 5181 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Rab11bP46638 Cd2bp2-207ENSMUST00000206026 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Rab11bP46638 Tspan14-202ENSMUST00000224209 2477 ntAPPRIS P1 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Rab11bP46638 D6Ertd527e-201ENSMUST00000170124 2161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Rab11bP46638 Ciita-201ENSMUST00000023147 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Rab11bP46638 Steap3-203ENSMUST00000112641 5158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Rab11bP46638 Sfrp4-203ENSMUST00000222464 4049 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Rab11bP46638 Ttc30a2-201ENSMUST00000099995 2431 ntAPPRIS P1 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Rab11bP46638 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Rab11bP46638 Tpm1-207ENSMUST00000113687 962 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Rab11bP46638 Acyp1-204ENSMUST00000121930 634 ntTSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Rab11bP46638 Gm12316-201ENSMUST00000125853 406 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Rab11bP46638 4933427G23Rik-202ENSMUST00000126393 544 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Rab11bP46638 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Rab11bP46638 1810008B01Rik-201ENSMUST00000162325 829 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Rab11bP46638 Trav13d-3-201ENSMUST00000179512 391 ntAPPRIS P1 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Rab11bP46638 Trav13n-3-201ENSMUST00000179580 337 ntAPPRIS P1 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Rab11bP46638 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Rab11bP46638 Gm43818-201ENSMUST00000200605 466 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Rab11bP46638 AC158523.3-201ENSMUST00000220664 864 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Rab11bP46638 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Rab11bP46638 AC139319.1-201ENSMUST00000223331 690 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Rab11bP46638 Armc9-201ENSMUST00000027434 5127 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Rab11bP46638 Crispld2-202ENSMUST00000108972 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Rab11bP46638 Esam-201ENSMUST00000002011 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Rab11bP46638 Rsl24d1-201ENSMUST00000034738 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Rab11bP46638 Pla2g4a-202ENSMUST00000111926 2835 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Rab11bP46638 Gpr101-201ENSMUST00000057645 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Rab11bP46638 Akap5-203ENSMUST00000172992 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Rab11bP46638 Srebf1-201ENSMUST00000020846 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Rab11bP46638 Hdc-201ENSMUST00000028838 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Rab11bP46638 Zbtb45-205ENSMUST00000210282 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Rab11bP46638 Col6a4-201ENSMUST00000121963 7371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Rab11bP46638 Inpp4a-211ENSMUST00000168546 2964 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Rab11bP46638 Gm13264-201ENSMUST00000138416 2011 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Rab11bP46638 B3galt5-201ENSMUST00000099497 5147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Rab11bP46638 Syt11-203ENSMUST00000107505 5020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Rab11bP46638 Fam45a-202ENSMUST00000119633 2267 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Rab11bP46638 Gm10277-201ENSMUST00000092883 2295 ntAPPRIS P1 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Rab11bP46638 Zbtb42-201ENSMUST00000169593 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Rab11bP46638 Far2-201ENSMUST00000032443 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Rab11bP46638 Gpcpd1-205ENSMUST00000110142 3703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Rab11bP46638 Nuak2-202ENSMUST00000082125 3107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Rab11bP46638 F10-201ENSMUST00000033821 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Rab11bP46638 Lnx2-201ENSMUST00000016664 4557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Rab11bP46638 Pigc-201ENSMUST00000028021 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Rab11bP46638 Tmem161a-201ENSMUST00000002413 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Rab11bP46638 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Rab11bP46638 Dao-202ENSMUST00000112292 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rab11bP46638 Kat6b-204ENSMUST00000182405 6977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rab11bP46638 Ankrd31-203ENSMUST00000208758 5859 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rab11bP46638 Arg1-201ENSMUST00000020161 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rab11bP46638 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Rab11bP46638 H2-Q1-202ENSMUST00000105041 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rab11bP46638 Slc25a45-206ENSMUST00000155697 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rab11bP46638 Gcnt7-201ENSMUST00000099060 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rab11bP46638 Ptpn23-201ENSMUST00000040021 5346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rab11bP46638 Arpp21-223ENSMUST00000162097 3952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rab11bP46638 Efemp2-209ENSMUST00000167371 1382 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rab11bP46638 Sdr9c7-201ENSMUST00000047134 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rab11bP46638 Gm7964-201ENSMUST00000051522 1378 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Rab11bP46638 Kcnk18-201ENSMUST00000065204 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rab11bP46638 Gm11696-203ENSMUST00000188296 1793 ntTSL 3 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rab11bP46638 Gm38100-202ENSMUST00000201297 1789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rab11bP46638 1500009C09Rik-201ENSMUST00000136948 1526 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rab11bP46638 AC126257.1-201ENSMUST00000213195 1536 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Rab11bP46638 Nuak2-201ENSMUST00000072177 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rab11bP46638 Gtf2i-224ENSMUST00000174772 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rab11bP46638 Gm14441-201ENSMUST00000121960 540 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Rab11bP46638 Gm13205-201ENSMUST00000123548 562 ntTSL 3 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rab11bP46638 Gm17028-201ENSMUST00000170026 704 ntTSL 3 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rab11bP46638 C1qtnf2-203ENSMUST00000173002 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rab11bP46638 Gm20416-201ENSMUST00000174760 484 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rab11bP46638 Gm6222-202ENSMUST00000182143 629 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Rab11bP46638 4930504D19Rik-201ENSMUST00000204799 349 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rab11bP46638 Gm7619-201ENSMUST00000210649 1282 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Rab11bP46638 4930562F07Rik-201ENSMUST00000028061 830 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rab11bP46638 A130071D04Rik-201ENSMUST00000194467 5864 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Rab11bP46638 Cpa5-201ENSMUST00000062758 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rab11bP46638 Gm11525-201ENSMUST00000134436 2804 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rab11bP46638 Pkp4-201ENSMUST00000037903 4378 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rab11bP46638 Tmc7-201ENSMUST00000044195 4546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rab11bP46638 Tfr2-206ENSMUST00000198783 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rab11bP46638 Pmp2-201ENSMUST00000029034 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rab11bP46638 4930519G04Rik-201ENSMUST00000031547 2092 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rab11bP46638 Vcan-202ENSMUST00000109544 5702 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rab11bP46638 Ccnb1-201ENSMUST00000072119 2489 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rab11bP46638 Vmn1r45-202ENSMUST00000226167 2893 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Rab11bP46638 Tsc2-201ENSMUST00000097373 6018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rab11bP46638 Olfr624-201ENSMUST00000062144 5731 ntAPPRIS P1 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rab11bP46638 Btnl1-201ENSMUST00000080254 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rab11bP46638 Txlna-201ENSMUST00000046425 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rab11bP46638 Pom121l2-201ENSMUST00000017126 2960 ntAPPRIS P4 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rab11bP46638 4930431P19Rik-202ENSMUST00000207761 2959 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Rab11bP46638 Gm42427-201ENSMUST00000200473 5292 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Rab11bP46638 Limk2-201ENSMUST00000101638 3514 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rab11bP46638 Glyctk-202ENSMUST00000112543 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.3 ms