Protein–RNA interactions for Protein: P28705

Rxrg, Retinoic acid receptor RXR-gamma, mousemouse

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Length 463 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxrgP28705 Gm11362-201ENSMUST00000118838 850 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
RxrgP28705 Gm13408-201ENSMUST00000119822 798 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
RxrgP28705 Gm13461-201ENSMUST00000120980 662 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
RxrgP28705 Gm13935-201ENSMUST00000121859 798 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
RxrgP28705 Mcfd2-205ENSMUST00000145895 751 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
RxrgP28705 Arid3b-204ENSMUST00000164010 1259 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
RxrgP28705 Crnde-207ENSMUST00000180102 732 ntTSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
RxrgP28705 Rps13-ps2-201ENSMUST00000182017 453 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
RxrgP28705 Gm9022-201ENSMUST00000182482 992 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
RxrgP28705 Gm44958-201ENSMUST00000203734 736 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
RxrgP28705 4930448A20Rik-201ENSMUST00000205988 1034 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
RxrgP28705 Gm9826-201ENSMUST00000029124 1299 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
RxrgP28705 Rbp2-201ENSMUST00000035029 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
RxrgP28705 Hist1h3a-201ENSMUST00000091701 534 ntAPPRIS P1 BASIC11.98□□□□□ -0.49
RxrgP28705 Ppm1l-201ENSMUST00000029355 9417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
RxrgP28705 Zbtb40-201ENSMUST00000049583 7192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
RxrgP28705 Flnc-201ENSMUST00000065090 9038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
RxrgP28705 Sp2-202ENSMUST00000107623 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
RxrgP28705 Polm-201ENSMUST00000020767 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
RxrgP28705 Mier1-205ENSMUST00000106858 4830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
RxrgP28705 Gm16083-201ENSMUST00000125681 2547 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
RxrgP28705 Traf7-201ENSMUST00000070777 2384 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
RxrgP28705 AC159308.2-201ENSMUST00000213592 2325 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
RxrgP28705 Ptgr2-207ENSMUST00000146377 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
RxrgP28705 Col18a1-203ENSMUST00000105409 4791 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
RxrgP28705 Fli1-201ENSMUST00000016231 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
RxrgP28705 Usp22-201ENSMUST00000041683 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
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RxrgP28705 Rbm10-201ENSMUST00000064911 2793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
RxrgP28705 Pcdh12-203ENSMUST00000194012 2702 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
RxrgP28705 Gm13093-201ENSMUST00000126212 2485 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
RxrgP28705 Trim50-202ENSMUST00000111180 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
RxrgP28705 Vdr-201ENSMUST00000023119 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
RxrgP28705 Ccdc154-203ENSMUST00000182621 2402 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
RxrgP28705 Gjb2-201ENSMUST00000055698 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
RxrgP28705 Kcnd1-201ENSMUST00000009875 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
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RxrgP28705 Plekhg6-201ENSMUST00000042647 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
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RxrgP28705 Fam189b-201ENSMUST00000041913 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
RxrgP28705 Atp13a1-201ENSMUST00000034326 3915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
RxrgP28705 Fnbp1-210ENSMUST00000113564 3892 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
RxrgP28705 Taf6l-202ENSMUST00000010249 848 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
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RxrgP28705 Gm16172-201ENSMUST00000156224 682 ntTSL 3 BASIC11.97□□□□□ -0.49
RxrgP28705 Gm15852-201ENSMUST00000159701 915 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
RxrgP28705 Gm42817-201ENSMUST00000198962 607 ntTSL 3 BASIC11.97□□□□□ -0.49
RxrgP28705 AC158523.3-201ENSMUST00000220664 864 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
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RxrgP28705 Spaca4-201ENSMUST00000094424 707 ntAPPRIS P1 BASIC11.97□□□□□ -0.49
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RxrgP28705 Zp1-201ENSMUST00000025641 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
RxrgP28705 Git1-201ENSMUST00000037285 3512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
RxrgP28705 Tmeff2-202ENSMUST00000114565 2718 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
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RxrgP28705 9330182L06Rik-204ENSMUST00000134991 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
RxrgP28705 Amz2-203ENSMUST00000103061 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
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RxrgP28705 Lysmd1-201ENSMUST00000066386 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
RxrgP28705 H2-T10-202ENSMUST00000174382 1699 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
RxrgP28705 Tuba1a-201ENSMUST00000097014 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
RxrgP28705 Myo5b-203ENSMUST00000121875 6065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
RxrgP28705 Fam110a-203ENSMUST00000109864 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
RxrgP28705 Zfp819-203ENSMUST00000120935 2156 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
RxrgP28705 Trpv3-201ENSMUST00000049676 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
RxrgP28705 Cers6-201ENSMUST00000028426 7038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
RxrgP28705 Ctdspl2-201ENSMUST00000036647 5053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
RxrgP28705 Aldoa-203ENSMUST00000106348 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
RxrgP28705 Tmem159-201ENSMUST00000033210 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
RxrgP28705 Iqcc-201ENSMUST00000046675 2639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
RxrgP28705 Fosb-201ENSMUST00000003640 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
RxrgP28705 Cryz-208ENSMUST00000192462 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
RxrgP28705 Wapl-202ENSMUST00000090027 4185 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
RxrgP28705 Gm6580-201ENSMUST00000117504 1357 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
RxrgP28705 Gm12802-201ENSMUST00000145510 1813 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
RxrgP28705 Gcn1l1-201ENSMUST00000064454 8555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
RxrgP28705 Gm36957-201ENSMUST00000192982 2824 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
RxrgP28705 Lyzl6-202ENSMUST00000107014 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
RxrgP28705 Hmgcll1-202ENSMUST00000117981 1189 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
RxrgP28705 Gm13045-201ENSMUST00000119019 712 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
RxrgP28705 Prkaca-ps1-201ENSMUST00000120823 919 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
RxrgP28705 Gm42791-202ENSMUST00000147473 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
RxrgP28705 Gm23119-201ENSMUST00000158610 140 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
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