Protein–RNA interactions for Protein: P27664

Pde6a, Rod cGMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit alpha, mousemouse

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Length 859 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde6aP27664 Trim46-202ENSMUST00000090924 2721 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pde6aP27664 Cdh7-202ENSMUST00000112701 4945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pde6aP27664 Nlrx1-202ENSMUST00000168499 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pde6aP27664 Afg3l1-201ENSMUST00000001520 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pde6aP27664 Lamp5-201ENSMUST00000057503 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pde6aP27664 Gm4780-202ENSMUST00000215200 2644 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Pde6aP27664 Kdm1b-201ENSMUST00000037025 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pde6aP27664 L3mbtl2-208ENSMUST00000174229 2578 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pde6aP27664 Fam114a2-201ENSMUST00000020831 2557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pde6aP27664 Ctsd-201ENSMUST00000066401 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pde6aP27664 Cdk2ap1-202ENSMUST00000111472 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pde6aP27664 Gm13523-201ENSMUST00000151820 488 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pde6aP27664 Mcpt8-201ENSMUST00000015594 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pde6aP27664 Spata3-211ENSMUST00000159876 760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pde6aP27664 Gm8815-201ENSMUST00000173809 620 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Pde6aP27664 1110038B12Rik-208ENSMUST00000174714 520 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pde6aP27664 Gm9866-204ENSMUST00000183238 351 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pde6aP27664 Gm27184-201ENSMUST00000185095 607 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pde6aP27664 Gm2453-202ENSMUST00000195508 568 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pde6aP27664 Gm5982-201ENSMUST00000196234 512 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Pde6aP27664 Cmtm2a-203ENSMUST00000212492 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pde6aP27664 Gm19208-201ENSMUST00000213861 912 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Pde6aP27664 Reps2-201ENSMUST00000101102 7630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pde6aP27664 Pink1-202ENSMUST00000105816 1465 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pde6aP27664 Mamld1-202ENSMUST00000114629 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pde6aP27664 Tbc1d2-201ENSMUST00000084621 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Pde6aP27664 Pbxip1-201ENSMUST00000038942 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Pde6aP27664 Rit2-203ENSMUST00000153060 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Pde6aP27664 Pdxdc1-201ENSMUST00000023361 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Pde6aP27664 Sorl1-201ENSMUST00000060989 10715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Pde6aP27664 Cisd2-201ENSMUST00000029815 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Pde6aP27664 Cd33-202ENSMUST00000039861 1791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Pde6aP27664 Rsbn1l-202ENSMUST00000196780 7651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Pde6aP27664 Brsk1-204ENSMUST00000205666 1398 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Pde6aP27664 Dnajc5-201ENSMUST00000072334 6578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pde6aP27664 Mpv17l-201ENSMUST00000023360 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pde6aP27664 Plxdc1-201ENSMUST00000017561 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pde6aP27664 Spr-ps1-203ENSMUST00000187705 2892 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Pde6aP27664 Map7-202ENSMUST00000116259 3831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pde6aP27664 Wapl-202ENSMUST00000090027 4185 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pde6aP27664 Nelfcd-201ENSMUST00000016397 2280 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pde6aP27664 Pla2g16-202ENSMUST00000136465 3048 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pde6aP27664 Gid8-202ENSMUST00000078687 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pde6aP27664 Rev3l-201ENSMUST00000019986 10713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pde6aP27664 Nr4a2-202ENSMUST00000112627 2400 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pde6aP27664 Mynn-202ENSMUST00000192715 5555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pde6aP27664 Gm38569-201ENSMUST00000205476 2228 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pde6aP27664 Specc1-212ENSMUST00000202178 2932 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pde6aP27664 Ilvbl-212ENSMUST00000220430 2350 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pde6aP27664 Gm12579-201ENSMUST00000118040 783 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Pde6aP27664 Rab15-202ENSMUST00000118604 778 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pde6aP27664 Gm6506-201ENSMUST00000119775 1136 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Pde6aP27664 Rab15-203ENSMUST00000121716 739 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pde6aP27664 5730437C11Rik-201ENSMUST00000155540 242 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pde6aP27664 Gm23085-201ENSMUST00000157849 293 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Pde6aP27664 Eloc-207ENSMUST00000187910 620 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pde6aP27664 Spast-201ENSMUST00000024869 4672 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pde6aP27664 Rps6kl1-202ENSMUST00000221972 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pde6aP27664 Tbrg1-201ENSMUST00000117654 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pde6aP27664 Gm13553-201ENSMUST00000133025 1970 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pde6aP27664 Gm29771-201ENSMUST00000193142 1423 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pde6aP27664 Gng7-203ENSMUST00000117805 3382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pde6aP27664 Mmachc-201ENSMUST00000030453 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pde6aP27664 Zbtb1-201ENSMUST00000042779 12190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pde6aP27664 Prdx2-202ENSMUST00000109733 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pde6aP27664 1700030J22Rik-201ENSMUST00000070577 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pde6aP27664 Mmp28-202ENSMUST00000103209 3438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pde6aP27664 Atp8a1-202ENSMUST00000072971 7154 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pde6aP27664 Sema4f-201ENSMUST00000000641 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pde6aP27664 Patl1-201ENSMUST00000061618 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pde6aP27664 Mpv17-202ENSMUST00000200744 1653 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pde6aP27664 Qrich2-201ENSMUST00000093909 2156 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pde6aP27664 Plcd1-201ENSMUST00000010804 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pde6aP27664 Fosb-205ENSMUST00000208326 3654 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pde6aP27664 Mrc2-201ENSMUST00000021038 3335 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pde6aP27664 Klhdc7b-202ENSMUST00000225666 3951 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pde6aP27664 Vmac-202ENSMUST00000164907 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pde6aP27664 Kcnt1-201ENSMUST00000037580 5881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pde6aP27664 Ldhd-201ENSMUST00000070004 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pde6aP27664 Pde6c-201ENSMUST00000025956 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pde6aP27664 Gstcd-201ENSMUST00000029651 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pde6aP27664 Cbx7-203ENSMUST00000109616 2899 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pde6aP27664 Rpsa-ps12-201ENSMUST00000120596 892 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Pde6aP27664 Rpl19-ps1-201ENSMUST00000121059 591 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Pde6aP27664 Pabpc1l2a-ps-201ENSMUST00000128361 513 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Pde6aP27664 4930557F10Rik-201ENSMUST00000155432 630 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pde6aP27664 Mir5120-201ENSMUST00000175020 78 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Pde6aP27664 Chtf8-203ENSMUST00000176090 615 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pde6aP27664 Mir8093-201ENSMUST00000185043 137 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Pde6aP27664 Gm19744-202ENSMUST00000186135 948 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pde6aP27664 Gm5852-201ENSMUST00000194119 1021 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Pde6aP27664 Gm44968-201ENSMUST00000207652 1171 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pde6aP27664 Gm40983-201ENSMUST00000222524 502 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pde6aP27664 CT009713.8-201ENSMUST00000225448 560 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Pde6aP27664 Gm9785-201ENSMUST00000062642 1006 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Pde6aP27664 Rpl34-202ENSMUST00000079085 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pde6aP27664 Gm1840-201ENSMUST00000051687 1432 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Pde6aP27664 4932443L11Rik-202ENSMUST00000177130 2827 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pde6aP27664 Tmem230-203ENSMUST00000110164 2957 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pde6aP27664 Plagl1-203ENSMUST00000121766 3897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
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