Protein–RNA interactions for Protein: P23298

Prkch, Protein kinase C eta type, mousemouse

Predictions only

Length 683 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkchP23298 Ehbp1l1-202ENSMUST00000075606 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
PrkchP23298 Dync1i2-202ENSMUST00000100028 2097 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
PrkchP23298 Pabpc4-202ENSMUST00000080178 3019 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
PrkchP23298 Ldb3-204ENSMUST00000064098 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
PrkchP23298 Gm36855-203ENSMUST00000216660 1406 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
PrkchP23298 Strada-202ENSMUST00000103072 1517 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
PrkchP23298 C2-201ENSMUST00000025230 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
PrkchP23298 Nfatc2-209ENSMUST00000171689 2742 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
PrkchP23298 Mob4-205ENSMUST00000162364 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
PrkchP23298 Cstl1-201ENSMUST00000109952 629 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
PrkchP23298 Gm11772-201ENSMUST00000136542 532 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
PrkchP23298 4930515B02Rik-201ENSMUST00000140588 591 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
PrkchP23298 Gm5616-201ENSMUST00000165252 384 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
PrkchP23298 Tmem40-205ENSMUST00000166254 811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
PrkchP23298 Gm17040-202ENSMUST00000170597 889 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
PrkchP23298 Gm8741-201ENSMUST00000174736 384 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
PrkchP23298 Cga-201ENSMUST00000029975 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
PrkchP23298 Ndufaf5-201ENSMUST00000044825 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
PrkchP23298 Ccr4-202ENSMUST00000215425 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
PrkchP23298 Ccdc170-201ENSMUST00000019901 2151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
PrkchP23298 Cramp1l-201ENSMUST00000073337 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
PrkchP23298 Lipo2-201ENSMUST00000147153 3562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
PrkchP23298 Clec16a-203ENSMUST00000115823 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
PrkchP23298 Crem-233ENSMUST00000154135 2530 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
PrkchP23298 Zfp280d-205ENSMUST00000183468 1834 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
PrkchP23298 Mog-201ENSMUST00000102665 1704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
PrkchP23298 Eef1d-205ENSMUST00000109972 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
PrkchP23298 Gm3836-201ENSMUST00000211377 1613 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
PrkchP23298 Gm9279-201ENSMUST00000223175 1606 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
PrkchP23298 Det1-202ENSMUST00000107431 1439 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
PrkchP23298 Tnn-202ENSMUST00000131919 3987 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
PrkchP23298 Sez6l2-201ENSMUST00000106332 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
PrkchP23298 Immt-202ENSMUST00000101301 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
PrkchP23298 Tmem200a-203ENSMUST00000218232 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
PrkchP23298 Gm43242-201ENSMUST00000199507 1776 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
PrkchP23298 Gm38100-202ENSMUST00000201297 1789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
PrkchP23298 Slc37a1-202ENSMUST00000171233 2929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
PrkchP23298 Dpysl5-201ENSMUST00000088081 5022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
PrkchP23298 Katnal2-207ENSMUST00000137354 1482 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
PrkchP23298 Kansl3-201ENSMUST00000010597 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
PrkchP23298 Gm15711-201ENSMUST00000118889 535 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
PrkchP23298 Gm15891-201ENSMUST00000127307 611 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
PrkchP23298 Gm22902-201ENSMUST00000158488 302 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
PrkchP23298 Gm6114-201ENSMUST00000182472 968 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
PrkchP23298 Gm9192-201ENSMUST00000183221 985 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
PrkchP23298 AY036118-201ENSMUST00000200021 923 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
PrkchP23298 Ube2v1-202ENSMUST00000109207 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
PrkchP23298 Gjd4-201ENSMUST00000041007 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
PrkchP23298 Lpar1-205ENSMUST00000107575 3421 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
PrkchP23298 Fzd6-201ENSMUST00000022906 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
PrkchP23298 Slx4ip-201ENSMUST00000028737 2556 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
PrkchP23298 Mark3-208ENSMUST00000221753 2394 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
PrkchP23298 Eng-202ENSMUST00000113272 3021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
PrkchP23298 Stim1-209ENSMUST00000211457 2183 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
PrkchP23298 Gpr45-201ENSMUST00000114761 1546 ntAPPRIS P1 BASIC12.36□□□□□ -0.43
PrkchP23298 Gm9962-202ENSMUST00000186595 1417 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
PrkchP23298 Rgs3-205ENSMUST00000107424 4084 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
PrkchP23298 Arhgap27-204ENSMUST00000107024 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
PrkchP23298 Btnl7-ps-201ENSMUST00000023469 1763 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
PrkchP23298 Rbm10-207ENSMUST00000177738 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
PrkchP23298 Rbm10-201ENSMUST00000064911 2793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
PrkchP23298 Gm26615-201ENSMUST00000181522 3201 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
PrkchP23298 Serinc4-202ENSMUST00000110613 2240 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
PrkchP23298 Tex10-201ENSMUST00000030030 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
PrkchP23298 Gm5847-201ENSMUST00000178959 1595 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
PrkchP23298 Fn1-216ENSMUST00000189821 7410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
PrkchP23298 Cxcr5-202ENSMUST00000179828 2824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
PrkchP23298 Hltf-201ENSMUST00000002502 4955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
PrkchP23298 Henmt1-205ENSMUST00000196533 1491 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
PrkchP23298 Gramd2-201ENSMUST00000098661 1368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
PrkchP23298 Ccdc183-201ENSMUST00000028309 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
PrkchP23298 Tnnt3-211ENSMUST00000105949 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
PrkchP23298 Zfp36l1-ps-201ENSMUST00000118349 899 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
PrkchP23298 Gm11331-201ENSMUST00000119764 288 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
PrkchP23298 Gm12266-201ENSMUST00000120311 962 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
PrkchP23298 Gm10714-201ENSMUST00000131346 874 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
PrkchP23298 Rpl41-206ENSMUST00000177163 544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
PrkchP23298 Hcfc1r1-203ENSMUST00000180140 693 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
PrkchP23298 Gm29264-201ENSMUST00000191240 1264 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
PrkchP23298 CT571245.2-201ENSMUST00000218421 305 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
PrkchP23298 Gm21027-201ENSMUST00000219300 1236 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
PrkchP23298 Ggps1-204ENSMUST00000221713 667 ntTSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
PrkchP23298 C1qb-201ENSMUST00000046384 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
PrkchP23298 Snf8-201ENSMUST00000006217 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
PrkchP23298 Mroh7-201ENSMUST00000106770 4346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
PrkchP23298 F830115B05Rik-201ENSMUST00000197638 1894 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
PrkchP23298 Fam214a-205ENSMUST00000215370 4205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
PrkchP23298 Aldh3a2-202ENSMUST00000074127 3091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
PrkchP23298 Abi1-211ENSMUST00000149719 3303 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
PrkchP23298 Abhd6-201ENSMUST00000026313 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
PrkchP23298 Gm19792-201ENSMUST00000222522 2021 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
PrkchP23298 Gfra1-203ENSMUST00000129100 4415 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
PrkchP23298 Mirt1-203ENSMUST00000181539 2259 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
PrkchP23298 Ccr6-203ENSMUST00000166348 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
PrkchP23298 Fut8-201ENSMUST00000062804 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
PrkchP23298 Nr4a2-202ENSMUST00000112627 2400 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
PrkchP23298 Abcb8-201ENSMUST00000073076 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
PrkchP23298 Slc39a14-202ENSMUST00000068044 4926 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
PrkchP23298 Golga4-201ENSMUST00000084820 7583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
PrkchP23298 Gm42498-201ENSMUST00000199981 1372 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.2 ms