Protein–RNA interactions for Protein: P20263

Pou5f1, POU domain, class 5, transcription factor 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 352 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou5f1P20263 AC164702.1-201ENSMUST00000220135 2212 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Pou5f1P20263 Slc6a13-201ENSMUST00000064580 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Pou5f1P20263 Crry-ps-201ENSMUST00000079090 1309 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Pou5f1P20263 AC123619.2-202ENSMUST00000225097 1568 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Pou5f1P20263 Psd4-201ENSMUST00000056641 4748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Pou5f1P20263 Krt31-201ENSMUST00000007318 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Pou5f1P20263 Fam71f1-201ENSMUST00000090487 1584 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Pou5f1P20263 Itsn2-211ENSMUST00000219007 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Pou5f1P20263 AC122291.1-201ENSMUST00000228937 5748 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Pou5f1P20263 Reps1-201ENSMUST00000126390 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Pou5f1P20263 Pcdhgb4-202ENSMUST00000195363 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Pou5f1P20263 Lsg1-201ENSMUST00000117363 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Pou5f1P20263 Nol3-201ENSMUST00000014920 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Pou5f1P20263 Dennd4a-201ENSMUST00000038890 8645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Pou5f1P20263 Zfp286-211ENSMUST00000207597 1668 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Pou5f1P20263 5033406O09Rik-201ENSMUST00000221314 1662 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Pou5f1P20263 Btbd9-202ENSMUST00000168787 6857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Pou5f1P20263 Mtm1-203ENSMUST00000061970 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Pou5f1P20263 Cep76-201ENSMUST00000097542 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Pou5f1P20263 D130051D11Rik-201ENSMUST00000189171 6188 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Pou5f1P20263 Gm22323-201ENSMUST00000103832 109 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Pou5f1P20263 Rap1a-ps2-201ENSMUST00000118467 559 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Pou5f1P20263 Gm12012-201ENSMUST00000118857 1066 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Pou5f1P20263 4930483J18Rik-202ENSMUST00000138715 1093 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Pou5f1P20263 Ppp3cb-202ENSMUST00000159027 3831 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Pou5f1P20263 Umad1-206ENSMUST00000160705 624 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Pou5f1P20263 Gm17105-201ENSMUST00000163715 652 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Pou5f1P20263 Rps28-202ENSMUST00000166693 271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Pou5f1P20263 Gm17099-201ENSMUST00000166780 412 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Pou5f1P20263 Rps13-201ENSMUST00000170953 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Pou5f1P20263 Gm43755-201ENSMUST00000200001 408 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Pou5f1P20263 Gm4607-201ENSMUST00000206649 577 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Pou5f1P20263 AC025913.2-202ENSMUST00000219248 605 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Pou5f1P20263 Psma1-201ENSMUST00000033008 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Pou5f1P20263 Lsm7-201ENSMUST00000035775 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Pou5f1P20263 Kifap3-201ENSMUST00000027877 3946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Pou5f1P20263 C2cd5-203ENSMUST00000171349 4292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Pou5f1P20263 Itga4-201ENSMUST00000099972 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Pou5f1P20263 6430571L13Rik-201ENSMUST00000042581 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Pou5f1P20263 Myh2-201ENSMUST00000018641 6018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Pou5f1P20263 Fnbp1-210ENSMUST00000113564 3892 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Pou5f1P20263 Prkag3-201ENSMUST00000081636 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Pou5f1P20263 9330199G10Rik-202ENSMUST00000221607 1728 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Pou5f1P20263 Myo7a-201ENSMUST00000084979 6849 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Pou5f1P20263 1110032A03Rik-201ENSMUST00000042468 2082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Pou5f1P20263 Tmem269-201ENSMUST00000030394 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Pou5f1P20263 Abo-202ENSMUST00000114045 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Pou5f1P20263 Agxt2-204ENSMUST00000110542 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Pou5f1P20263 Fen1-203ENSMUST00000142241 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Pou5f1P20263 Rbl2-210ENSMUST00000211136 4504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Pou5f1P20263 Aebp2-206ENSMUST00000161335 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Pou5f1P20263 Gm5847-201ENSMUST00000178959 1595 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Pou5f1P20263 Gm43172-201ENSMUST00000202139 2137 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Pou5f1P20263 Gm37348-201ENSMUST00000193104 1789 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Pou5f1P20263 Pga5-201ENSMUST00000025647 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Pou5f1P20263 Birc3-201ENSMUST00000013949 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Pou5f1P20263 Cyp4f40-201ENSMUST00000165061 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Pou5f1P20263 AC129931.1-201ENSMUST00000228865 1861 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Pou5f1P20263 Matn2-201ENSMUST00000022947 3551 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Pou5f1P20263 Sparc-201ENSMUST00000018737 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Pou5f1P20263 Poll-201ENSMUST00000026239 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Pou5f1P20263 Ephb2-203ENSMUST00000105846 3653 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Pou5f1P20263 Th-202ENSMUST00000105929 1950 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Pou5f1P20263 L1cam-202ENSMUST00000102871 5113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Pou5f1P20263 Tmem136-201ENSMUST00000061833 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Pou5f1P20263 Txndc5-204ENSMUST00000162075 2619 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Pou5f1P20263 Sypl2-201ENSMUST00000141387 4090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Pou5f1P20263 Abi2-207ENSMUST00000188618 4723 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Pou5f1P20263 Limd2-203ENSMUST00000106875 936 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Pou5f1P20263 Sumo3-203ENSMUST00000124024 776 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Pou5f1P20263 1110028F11Rik-201ENSMUST00000137077 837 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Pou5f1P20263 AA672651-201ENSMUST00000151550 489 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Pou5f1P20263 Gm25668-201ENSMUST00000157700 129 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Pou5f1P20263 Gm35986-201ENSMUST00000197370 655 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Pou5f1P20263 Gm42902-201ENSMUST00000199508 662 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Pou5f1P20263 Aprt-ps-201ENSMUST00000212311 505 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Pou5f1P20263 Galc-201ENSMUST00000021390 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Pou5f1P20263 Gm9803-202ENSMUST00000216543 456 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Pou5f1P20263 Defb22-201ENSMUST00000028966 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Pou5f1P20263 Sema5b-201ENSMUST00000050625 4350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Pou5f1P20263 Galnt11-202ENSMUST00000114950 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Pou5f1P20263 Zfp512-208ENSMUST00000202244 3045 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Pou5f1P20263 Rnf20-210ENSMUST00000167496 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Pou5f1P20263 Bdkrb2-201ENSMUST00000001652 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Pou5f1P20263 Nin-201ENSMUST00000021468 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Pou5f1P20263 Gm17767-201ENSMUST00000189410 1470 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Pou5f1P20263 Hbs1l-201ENSMUST00000020153 2793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Pou5f1P20263 Taf1b-201ENSMUST00000075954 2209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Pou5f1P20263 Parp9-203ENSMUST00000114878 3548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Pou5f1P20263 Slc26a6-201ENSMUST00000098376 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Pou5f1P20263 Gm28036-202ENSMUST00000132494 5505 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Pou5f1P20263 Scn8a-203ENSMUST00000108908 7030 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Pou5f1P20263 Foxn2-201ENSMUST00000112238 5085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Pou5f1P20263 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Pou5f1P20263 Ngef-202ENSMUST00000068681 3109 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Pou5f1P20263 Gm45902-202ENSMUST00000140494 2390 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Pou5f1P20263 Cacng5-201ENSMUST00000039071 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Pou5f1P20263 Tpra1-218ENSMUST00000203185 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Pou5f1P20263 AC173482.6-201ENSMUST00000225889 1741 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Pou5f1P20263 Tcf4-251ENSMUST00000202474 1810 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.7 ms