Protein–RNA interactions for Protein: P19246

Nefh, Neurofilament heavy polypeptide, mousemouse

Predictions only

Length 1,090 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NefhP19246 Car10-201ENSMUST00000042943 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
NefhP19246 Plce1-204ENSMUST00000182481 8357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
NefhP19246 Afg3l1-201ENSMUST00000001520 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
NefhP19246 Setd1a-201ENSMUST00000047075 6487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
NefhP19246 Lrrfip1-202ENSMUST00000068167 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
NefhP19246 Capn3-205ENSMUST00000110719 2778 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
NefhP19246 Ankzf1-208ENSMUST00000152233 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
NefhP19246 Ndel1-202ENSMUST00000101017 1646 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
NefhP19246 Nsmce2-202ENSMUST00000168722 2679 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
NefhP19246 Runx1-202ENSMUST00000113956 4738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
NefhP19246 Ccndbp1-201ENSMUST00000060455 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
NefhP19246 Gm9072-201ENSMUST00000218390 1514 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
NefhP19246 Adam32-202ENSMUST00000121438 2450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
NefhP19246 1200007C13Rik-201ENSMUST00000143649 2455 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
NefhP19246 Tbc1d14-205ENSMUST00000136189 4436 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
NefhP19246 Luc7l2-207ENSMUST00000161227 2405 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
NefhP19246 Gm16364-201ENSMUST00000153722 1313 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
NefhP19246 Armcx2-203ENSMUST00000119010 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
NefhP19246 Cela3b-201ENSMUST00000102522 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
NefhP19246 Ifitm10-203ENSMUST00000105988 824 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
NefhP19246 Mrpl55-202ENSMUST00000108784 729 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
NefhP19246 Rab15-203ENSMUST00000121716 739 ntTSL 3 BASIC14.01□□□□□ -0.17
NefhP19246 Gm11815-201ENSMUST00000139423 708 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
NefhP19246 Cd63-ps-202ENSMUST00000154992 717 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
NefhP19246 Cldn16-202ENSMUST00000161053 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
NefhP19246 Gm20535-201ENSMUST00000173157 1268 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
NefhP19246 Satb2-205ENSMUST00000177424 4694 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
NefhP19246 Gm42629-201ENSMUST00000199063 1102 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
NefhP19246 Gng8-204ENSMUST00000205716 432 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.01□□□□□ -0.17
NefhP19246 Gm9463-201ENSMUST00000206707 601 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
NefhP19246 Fam151b-201ENSMUST00000040106 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
NefhP19246 Sst-201ENSMUST00000004480 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
NefhP19246 Cldn17-201ENSMUST00000069549 1172 ntAPPRIS P1 BASIC14.01□□□□□ -0.17
NefhP19246 Tmem268-201ENSMUST00000077709 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
NefhP19246 Dnajb1-202ENSMUST00000212300 2854 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
NefhP19246 Tspan2-201ENSMUST00000029451 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
NefhP19246 Slc30a3-206ENSMUST00000202740 1989 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
NefhP19246 Grid2ip-201ENSMUST00000010969 3459 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
NefhP19246 Arsa-202ENSMUST00000165199 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
NefhP19246 Apbb2-216ENSMUST00000162366 6540 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
NefhP19246 F7-201ENSMUST00000033820 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
NefhP19246 Rassf8-201ENSMUST00000032388 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
NefhP19246 Gm16907-201ENSMUST00000180734 2317 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
NefhP19246 Limd2-201ENSMUST00000045923 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
NefhP19246 Arap1-202ENSMUST00000084896 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
NefhP19246 Abcc10-201ENSMUST00000047970 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
NefhP19246 Nudt5-205ENSMUST00000179748 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
NefhP19246 Zbtb6-202ENSMUST00000112932 5077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
NefhP19246 Polm-202ENSMUST00000109837 2697 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
NefhP19246 Ptgdr-201ENSMUST00000095959 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
NefhP19246 Cyp2c53-ps-203ENSMUST00000176493 1443 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
NefhP19246 1700003D09Rik-201ENSMUST00000141929 1389 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
NefhP19246 Lrch1-201ENSMUST00000088970 4694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
NefhP19246 Fam234b-202ENSMUST00000111916 2927 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
NefhP19246 Eif5a-206ENSMUST00000108609 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
NefhP19246 Gm11509-201ENSMUST00000117358 325 ntBASIC14□□□□□ -0.17
NefhP19246 Gm11511-201ENSMUST00000118146 540 ntBASIC14□□□□□ -0.17
NefhP19246 4930538E20Rik-202ENSMUST00000146717 497 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
NefhP19246 H1foo-203ENSMUST00000161969 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
NefhP19246 4930562C15Rik-202ENSMUST00000171105 1299 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
NefhP19246 Cyb561-206ENSMUST00000184086 1130 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
NefhP19246 Cbx3-ps8-201ENSMUST00000214564 548 ntBASIC14□□□□□ -0.17
NefhP19246 Gm7395-201ENSMUST00000216059 1045 ntBASIC14□□□□□ -0.17
NefhP19246 Colec11-203ENSMUST00000220836 887 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
NefhP19246 Cox6a2-201ENSMUST00000033049 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
NefhP19246 Slc2a4-203ENSMUST00000141837 1776 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
NefhP19246 Ntrk2-202ENSMUST00000109838 6846 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
NefhP19246 Add2-208ENSMUST00000203786 2289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
NefhP19246 Dmbt1-202ENSMUST00000208311 6272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
NefhP19246 Psap-204ENSMUST00000177779 2657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
NefhP19246 Psap-205ENSMUST00000179238 2657 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
NefhP19246 Psap-201ENSMUST00000004316 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
NefhP19246 Slc44a1-204ENSMUST00000107647 2176 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
NefhP19246 Kcnj11-205ENSMUST00000211674 3142 ntAPPRIS P1 BASIC14□□□□□ -0.17
NefhP19246 Usp5-202ENSMUST00000122110 3076 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
NefhP19246 Hipk4-201ENSMUST00000037134 2926 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
NefhP19246 Ppp3r1-201ENSMUST00000102880 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
NefhP19246 Trpc7-208ENSMUST00000174457 2424 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
NefhP19246 AC166574.4-201ENSMUST00000227165 1937 ntBASIC14□□□□□ -0.17
NefhP19246 Gipc3-201ENSMUST00000045102 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
NefhP19246 G6pdx-201ENSMUST00000004327 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
NefhP19246 Cflar-202ENSMUST00000097722 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
NefhP19246 Myo16-203ENSMUST00000207477 7169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
NefhP19246 Fxr1-204ENSMUST00000197694 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
NefhP19246 Adcyap1r1-203ENSMUST00000165786 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
NefhP19246 Cpsf7-201ENSMUST00000038379 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
NefhP19246 Fitm2-201ENSMUST00000109418 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
NefhP19246 Lig1-210ENSMUST00000165964 3166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
NefhP19246 Axl-202ENSMUST00000085948 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
NefhP19246 E2f8-202ENSMUST00000119223 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
NefhP19246 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
NefhP19246 Zfp433-202ENSMUST00000200889 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
NefhP19246 Gm32687-201ENSMUST00000220314 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
NefhP19246 Ifna15-201ENSMUST00000102809 573 ntAPPRIS P1 BASIC13.99□□□□□ -0.17
NefhP19246 Gm26286-201ENSMUST00000104166 134 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
NefhP19246 Rwdd3-205ENSMUST00000106467 1158 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
NefhP19246 Gm7722-201ENSMUST00000120646 741 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
NefhP19246 Gm15906-201ENSMUST00000124746 323 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
NefhP19246 Gm16195-201ENSMUST00000130607 442 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
NefhP19246 Gm11379-201ENSMUST00000154678 381 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.8 ms