Protein–RNA interactions for Protein: P11531

Dmd, Dystrophin, mousemouse

Predictions only

Length 3,678 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DmdP11531 Gm11993-201ENSMUST00000121861 820 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
DmdP11531 Gm14148-201ENSMUST00000122433 1008 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
DmdP11531 Gm6471-202ENSMUST00000148734 587 ntTSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
DmdP11531 Gm13802-201ENSMUST00000150159 663 ntTSL 3 BASIC11.08□□□□□ -0.64
DmdP11531 Gm23432-201ENSMUST00000157181 131 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
DmdP11531 Gm6946-201ENSMUST00000182237 987 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
DmdP11531 AC129217.1-201ENSMUST00000225181 642 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
DmdP11531 Foxd2os-201ENSMUST00000123272 2908 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
DmdP11531 Osr2-204ENSMUST00000228152 1324 ntAPPRIS P1 BASIC11.08□□□□□ -0.64
DmdP11531 Mcm2-201ENSMUST00000058011 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
DmdP11531 Nsun7-204ENSMUST00000202994 3632 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
DmdP11531 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
DmdP11531 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
DmdP11531 Tmem206-201ENSMUST00000027940 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
DmdP11531 Dclre1b-203ENSMUST00000106832 2299 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
DmdP11531 Gm7168-201ENSMUST00000088809 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
DmdP11531 Gm12200-201ENSMUST00000144876 1858 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
DmdP11531 Cyth4-201ENSMUST00000043069 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
DmdP11531 Gm4755-201ENSMUST00000181803 2647 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
DmdP11531 Hdac5-202ENSMUST00000107150 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
DmdP11531 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
DmdP11531 Ighv1-56-201ENSMUST00000103527 294 ntAPPRIS P1 BASIC11.08□□□□□ -0.64
DmdP11531 Derl2-202ENSMUST00000108523 884 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
DmdP11531 Gm12009-201ENSMUST00000121361 1100 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
DmdP11531 Gm45783-201ENSMUST00000210877 656 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.08□□□□□ -0.64
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DmdP11531 Gm29689-201ENSMUST00000221076 589 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
DmdP11531 AC124356.1-201ENSMUST00000221469 698 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
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DmdP11531 Lnx1-201ENSMUST00000039744 2727 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
DmdP11531 Elmod3-204ENSMUST00000141833 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
DmdP11531 Lsamp-208ENSMUST00000189358 2766 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
DmdP11531 Aknad1-202ENSMUST00000133931 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
DmdP11531 Cops3-201ENSMUST00000019517 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
DmdP11531 Cckar-201ENSMUST00000031093 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
DmdP11531 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
DmdP11531 2410002F23Rik-204ENSMUST00000107948 2908 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
DmdP11531 Olfr29-ps1-201ENSMUST00000117959 963 ntAPPRIS P1 BASIC11.07□□□□□ -0.64
DmdP11531 Slpi-202ENSMUST00000165980 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.07□□□□□ -0.64
DmdP11531 Kdm4dl-201ENSMUST00000184843 1187 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
DmdP11531 Gm6794-201ENSMUST00000203829 457 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
DmdP11531 Rarres2-203ENSMUST00000204182 672 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
DmdP11531 Cd19-201ENSMUST00000032968 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
DmdP11531 Tspear-201ENSMUST00000092366 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
DmdP11531 Sult1a1-201ENSMUST00000106371 1370 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
DmdP11531 Sult1a1-202ENSMUST00000106372 1369 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
DmdP11531 Npr2-201ENSMUST00000030191 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
DmdP11531 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
DmdP11531 Gm20758-201ENSMUST00000220339 2171 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
DmdP11531 Wdr20rt-201ENSMUST00000046331 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
DmdP11531 Klf3-202ENSMUST00000166409 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
DmdP11531 Bpi-201ENSMUST00000065039 1926 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
DmdP11531 Gm6758-201ENSMUST00000119643 1055 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
DmdP11531 Fhit-204ENSMUST00000161302 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
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DmdP11531 Klk1b5-201ENSMUST00000074359 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
DmdP11531 Mybph-201ENSMUST00000038445 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
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DmdP11531 Dlg4-203ENSMUST00000108588 3457 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
DmdP11531 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
DmdP11531 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
DmdP11531 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
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DmdP11531 Gm4778-202ENSMUST00000159517 1241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
DmdP11531 Gm37634-201ENSMUST00000195700 650 ntTSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
DmdP11531 Rassf6-205ENSMUST00000202704 1178 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
DmdP11531 Gm45680-201ENSMUST00000211135 214 ntTSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
DmdP11531 CT009550.1-201ENSMUST00000225750 864 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
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DmdP11531 Gm4778-201ENSMUST00000098878 1098 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
DmdP11531 Tbx4-203ENSMUST00000108047 3153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
DmdP11531 Chtop-201ENSMUST00000001043 3257 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
DmdP11531 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
DmdP11531 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
DmdP11531 4930458D05Rik-201ENSMUST00000142871 3055 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
DmdP11531 Fbxl12os-203ENSMUST00000138471 2127 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
DmdP11531 Arnt-201ENSMUST00000015666 2603 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
DmdP11531 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
DmdP11531 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
DmdP11531 Slc31a2-202ENSMUST00000107467 868 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
DmdP11531 Gm6441-201ENSMUST00000120983 696 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
DmdP11531 Gm20441-201ENSMUST00000173512 756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
DmdP11531 Gm5291-201ENSMUST00000201965 899 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
DmdP11531 Gm43866-201ENSMUST00000203894 839 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
DmdP11531 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
DmdP11531 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC11.06□□□□□ -0.64
DmdP11531 Herc4-208ENSMUST00000219577 3914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
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