Protein–RNA interactions for Protein: P10628

Hoxd4, Homeobox protein Hox-D4, mousemouse

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Length 250 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd4P10628 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Hoxd4P10628 Gm42929-201ENSMUST00000198374 1286 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Hoxd4P10628 Igkv2-116-201ENSMUST00000199327 362 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Hoxd4P10628 Camsap3-209ENSMUST00000207970 3817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Hoxd4P10628 AC073947.1-201ENSMUST00000216991 649 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Hoxd4P10628 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Hoxd4P10628 AC166349.1-201ENSMUST00000220866 695 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Hoxd4P10628 Majin-201ENSMUST00000025699 1239 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Hoxd4P10628 Tnnt3-201ENSMUST00000074187 1007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Hoxd4P10628 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Hoxd4P10628 Sertad1-201ENSMUST00000008528 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Hoxd4P10628 Als2cl-203ENSMUST00000130386 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Hoxd4P10628 Kcnmb3-201ENSMUST00000164954 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Hoxd4P10628 4930488B22Rik-201ENSMUST00000172500 1722 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Hoxd4P10628 Gm9200-201ENSMUST00000118513 1354 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Hoxd4P10628 Magi1-203ENSMUST00000093769 4598 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Hoxd4P10628 Cyb5b-201ENSMUST00000034400 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Hoxd4P10628 Eif4g2-206ENSMUST00000161051 3548 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Hoxd4P10628 Capn15-201ENSMUST00000041641 3520 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Hoxd4P10628 Synpo2l-202ENSMUST00000117386 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Hoxd4P10628 Atg14-202ENSMUST00000226299 3729 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Hoxd4P10628 Flnc-201ENSMUST00000065090 9038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Hoxd4P10628 Scml2-201ENSMUST00000019101 4842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Hoxd4P10628 Zfp518b-203ENSMUST00000179555 6816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Hoxd4P10628 Prorsd1-202ENSMUST00000133103 2126 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Hoxd4P10628 Scn5a-201ENSMUST00000065196 8287 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Hoxd4P10628 Acsl6-208ENSMUST00000108899 1662 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Hoxd4P10628 Slco5a1-201ENSMUST00000115402 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Hoxd4P10628 Acot9-201ENSMUST00000026324 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Hoxd4P10628 Ric8a-201ENSMUST00000026558 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Hoxd4P10628 Gm5740-201ENSMUST00000211003 1857 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Hoxd4P10628 Clcn4-201ENSMUST00000000619 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Hoxd4P10628 Fcrl1-201ENSMUST00000072480 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Hoxd4P10628 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Hoxd4P10628 D130019J16Rik-201ENSMUST00000193261 2158 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Hoxd4P10628 Bicra-204ENSMUST00000210781 5975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Hoxd4P10628 Lin52-201ENSMUST00000137170 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Hoxd4P10628 AC129336.1-201ENSMUST00000220224 2277 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Hoxd4P10628 Dusp19-201ENSMUST00000028384 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Hoxd4P10628 BC034090-201ENSMUST00000035914 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Hoxd4P10628 Rbl2-210ENSMUST00000211136 4504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Hoxd4P10628 Fbrs-201ENSMUST00000048896 2650 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Hoxd4P10628 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Hoxd4P10628 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Hoxd4P10628 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Hoxd4P10628 Cox6c-203ENSMUST00000153512 738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Hoxd4P10628 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Hoxd4P10628 U2af1l4-206ENSMUST00000163654 781 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Hoxd4P10628 U2af1l4-221ENSMUST00000167361 860 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Hoxd4P10628 Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 375 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Hoxd4P10628 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Hoxd4P10628 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Hoxd4P10628 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Hoxd4P10628 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Hoxd4P10628 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Hoxd4P10628 Olfr1423-201ENSMUST00000087831 933 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Hoxd4P10628 Spaca4-201ENSMUST00000094424 707 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Hoxd4P10628 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Hoxd4P10628 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Hoxd4P10628 Lao1-201ENSMUST00000058651 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Hoxd4P10628 Katnal2-207ENSMUST00000137354 1482 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Hoxd4P10628 Prdx2-202ENSMUST00000109733 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Hoxd4P10628 Ppm1l-201ENSMUST00000029355 9417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Hoxd4P10628 Krba1-202ENSMUST00000077093 8380 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Hoxd4P10628 Gm14023-201ENSMUST00000144178 1781 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Hoxd4P10628 Mtss1l-205ENSMUST00000144041 3225 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Hoxd4P10628 Pfkfb3-202ENSMUST00000049849 2076 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Hoxd4P10628 Ldb3-204ENSMUST00000064098 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Hoxd4P10628 Zfp108-202ENSMUST00000205982 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Hoxd4P10628 Hsd17b13-202ENSMUST00000112803 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.71
Hoxd4P10628 Fut4-201ENSMUST00000061498 4074 ntAPPRIS P1 BASIC10.58□□□□□ -0.71
Hoxd4P10628 Gm43447-201ENSMUST00000198471 1535 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Hoxd4P10628 Rims4-201ENSMUST00000044734 4962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Hoxd4P10628 Spdye4a-201ENSMUST00000085733 1819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Hoxd4P10628 Gm5833-202ENSMUST00000190707 1932 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Hoxd4P10628 Pomt1-201ENSMUST00000036473 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Hoxd4P10628 Zmynd11-203ENSMUST00000110634 3824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Hoxd4P10628 Tdrd9-201ENSMUST00000079009 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Hoxd4P10628 Mapk8ip3-204ENSMUST00000117509 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Hoxd4P10628 Rapgef2-202ENSMUST00000118340 6544 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Hoxd4P10628 Atf7ip2-201ENSMUST00000044005 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Hoxd4P10628 Ldb3-202ENSMUST00000022328 2468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Hoxd4P10628 Nrap-203ENSMUST00000095947 5214 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Hoxd4P10628 Gm10912-201ENSMUST00000104891 1661 ntAPPRIS P1 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Hoxd4P10628 Bach2os-201ENSMUST00000126225 1661 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Hoxd4P10628 Gfi1b-201ENSMUST00000028156 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Hoxd4P10628 Plcb2-206ENSMUST00000159756 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Hoxd4P10628 Abca7-201ENSMUST00000043866 6590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Hoxd4P10628 Mrpl40-202ENSMUST00000119273 778 ntTSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Hoxd4P10628 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Hoxd4P10628 Gm11434-201ENSMUST00000122379 629 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Hoxd4P10628 Pisd-ps2-202ENSMUST00000142526 1175 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Hoxd4P10628 Pigyl-202ENSMUST00000148088 676 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Hoxd4P10628 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Hoxd4P10628 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Hoxd4P10628 6430590A07Rik-201ENSMUST00000181813 1032 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Hoxd4P10628 Gm38319-201ENSMUST00000194537 1266 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Hoxd4P10628 AC153974.2-201ENSMUST00000218577 1025 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Hoxd4P10628 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Hoxd4P10628 Ipo4-201ENSMUST00000047131 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
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