Protein–RNA interactions for Protein: O88874

Ccnk, Cyclin-K, mousemouse

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Length 554 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CcnkO88874 Cldn19-202ENSMUST00000094823 4168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
CcnkO88874 Vcan-202ENSMUST00000109544 5702 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
CcnkO88874 Slc6a2-201ENSMUST00000072939 6187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
CcnkO88874 Togaram1-201ENSMUST00000066296 6372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
CcnkO88874 Sap18-204ENSMUST00000128764 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
CcnkO88874 Srgap3-202ENSMUST00000088373 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
CcnkO88874 Gm37827-201ENSMUST00000194486 1542 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
CcnkO88874 CT010488.1-201ENSMUST00000214890 1522 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
CcnkO88874 Gm43823-201ENSMUST00000197391 1808 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
CcnkO88874 Col6a3-201ENSMUST00000056925 10106 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
CcnkO88874 Fcer2a-201ENSMUST00000005678 2242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
CcnkO88874 Spats2l-201ENSMUST00000163239 2313 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
CcnkO88874 Suclg2-201ENSMUST00000079847 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
CcnkO88874 Dclk3-201ENSMUST00000111879 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
CcnkO88874 Ccdc97-201ENSMUST00000002683 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
CcnkO88874 Gm9881-201ENSMUST00000068783 3205 ntAPPRIS P1 BASIC10.58□□□□□ -0.72
CcnkO88874 Itgal-204ENSMUST00000120857 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
CcnkO88874 Glyctk-202ENSMUST00000112543 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
CcnkO88874 Fsd2-201ENSMUST00000042318 3985 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
CcnkO88874 Tspan18-202ENSMUST00000111265 3751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
CcnkO88874 Chd7-206ENSMUST00000170391 3462 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
CcnkO88874 Nol3-201ENSMUST00000014920 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
CcnkO88874 Gm19165-201ENSMUST00000204453 1982 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
CcnkO88874 AC131068.2-201ENSMUST00000226175 1453 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
CcnkO88874 Pnpla6-201ENSMUST00000004681 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
CcnkO88874 Rtl5-204ENSMUST00000188731 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
CcnkO88874 Ctr9-201ENSMUST00000005749 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
CcnkO88874 Usp20-201ENSMUST00000061544 1360 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
CcnkO88874 Rhbdl2-202ENSMUST00000106204 1120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
CcnkO88874 Tmem53-203ENSMUST00000106434 923 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
CcnkO88874 Ict1os-201ENSMUST00000125653 1052 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
CcnkO88874 Gm15420-201ENSMUST00000133274 382 ntTSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
CcnkO88874 Gm11630-201ENSMUST00000152825 382 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
CcnkO88874 Gm7809-201ENSMUST00000153199 742 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
CcnkO88874 Gm24548-201ENSMUST00000158650 108 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
CcnkO88874 AI480526-203ENSMUST00000160099 1017 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
CcnkO88874 Gm8738-201ENSMUST00000172606 329 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
CcnkO88874 Gm26602-201ENSMUST00000181321 285 ntAPPRIS P1 BASIC10.58□□□□□ -0.72
CcnkO88874 Gm6222-202ENSMUST00000182143 629 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
CcnkO88874 Fgfr3-ps-201ENSMUST00000195511 1137 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
CcnkO88874 Tmem176b-206ENSMUST00000203355 1202 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
CcnkO88874 Gm35082-202ENSMUST00000208164 525 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
CcnkO88874 Gm44702-201ENSMUST00000209194 592 ntTSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
CcnkO88874 4933421D24Rik-201ENSMUST00000209302 1286 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
CcnkO88874 AC108416.1-202ENSMUST00000228927 1201 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
CcnkO88874 Prss39-201ENSMUST00000027299 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
CcnkO88874 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
CcnkO88874 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
CcnkO88874 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
CcnkO88874 Inpp4a-203ENSMUST00000114933 3004 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
CcnkO88874 Idi1-201ENSMUST00000169314 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
CcnkO88874 Rnf220-201ENSMUST00000030439 3029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
CcnkO88874 Tut1-201ENSMUST00000096239 2747 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
CcnkO88874 Robo1-201ENSMUST00000023600 7563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
CcnkO88874 Trf-203ENSMUST00000112645 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
CcnkO88874 Il1rap-206ENSMUST00000174202 2306 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
CcnkO88874 Coa5-201ENSMUST00000027286 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
CcnkO88874 Usp2-203ENSMUST00000114830 2122 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
CcnkO88874 Erlin2-201ENSMUST00000033873 4838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
CcnkO88874 Kars-201ENSMUST00000034426 2008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
CcnkO88874 Fam120b-201ENSMUST00000055352 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
CcnkO88874 Caln1-201ENSMUST00000086029 1801 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
CcnkO88874 Pole2-201ENSMUST00000021359 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
CcnkO88874 Sfrp4-203ENSMUST00000222464 4049 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
CcnkO88874 Wdr82-201ENSMUST00000020490 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
CcnkO88874 Dctn4-202ENSMUST00000223590 1530 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
CcnkO88874 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
CcnkO88874 Tmcc2-201ENSMUST00000045473 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
CcnkO88874 Ttc17-202ENSMUST00000094801 3408 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
CcnkO88874 Myh13-203ENSMUST00000180845 5991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
CcnkO88874 Hoxa1-201ENSMUST00000000964 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
CcnkO88874 Tesk2-201ENSMUST00000045542 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
CcnkO88874 Cd6-203ENSMUST00000080292 3032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
CcnkO88874 Umad1-201ENSMUST00000159168 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
CcnkO88874 Prps1-201ENSMUST00000033809 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
CcnkO88874 Ehd2-201ENSMUST00000098799 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
CcnkO88874 Emc1-201ENSMUST00000042096 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
CcnkO88874 Mettl17-206ENSMUST00000164902 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
CcnkO88874 Cbfa2t2-202ENSMUST00000099178 3247 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
CcnkO88874 Rab14-202ENSMUST00000113025 4346 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
CcnkO88874 Nexmif-203ENSMUST00000118314 11476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
CcnkO88874 Abhd1-202ENSMUST00000201125 1352 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
CcnkO88874 Olfr1113-202ENSMUST00000215611 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
CcnkO88874 Myocd-203ENSMUST00000108695 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
CcnkO88874 Kcna1-201ENSMUST00000055168 4031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
CcnkO88874 Abhd18-203ENSMUST00000159774 4455 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
CcnkO88874 Plekhb1-203ENSMUST00000107044 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
CcnkO88874 Thbs2-201ENSMUST00000170872 5922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
CcnkO88874 Wfdc9-202ENSMUST00000109335 547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
CcnkO88874 Myl3-203ENSMUST00000136695 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.57□□□□□ -0.72
CcnkO88874 Pcp2-206ENSMUST00000144977 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.57□□□□□ -0.72
CcnkO88874 Gm14209-201ENSMUST00000154946 462 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
CcnkO88874 C130026I21Rik-205ENSMUST00000161267 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.57□□□□□ -0.72
CcnkO88874 Fhit-206ENSMUST00000162278 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
CcnkO88874 Gm8018-201ENSMUST00000173536 789 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
CcnkO88874 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
CcnkO88874 Gm3890-201ENSMUST00000182416 207 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
CcnkO88874 Gm44405-201ENSMUST00000198952 126 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
CcnkO88874 Msra-205ENSMUST00000210428 1180 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
CcnkO88874 Gm36198-201ENSMUST00000217490 416 ntTSL 3 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.4 ms