Protein–RNA interactions for Protein: O88207

Col5a1, Collagen alpha-1(V) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,838 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col5a1O88207 Gm4930-201ENSMUST00000219926 1087 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Col5a1O88207 CT009527.1-201ENSMUST00000224205 339 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Col5a1O88207 AC134869.4-202ENSMUST00000224350 837 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Col5a1O88207 Lxn-201ENSMUST00000058981 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Col5a1O88207 Prss3-201ENSMUST00000096003 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Col5a1O88207 Eng-202ENSMUST00000113272 3021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Col5a1O88207 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Col5a1O88207 Abcg2-202ENSMUST00000114294 2178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Col5a1O88207 Gm43773-201ENSMUST00000198548 2162 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Col5a1O88207 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Col5a1O88207 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Col5a1O88207 Lysmd1-201ENSMUST00000066386 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Col5a1O88207 Gm9415-201ENSMUST00000200462 1321 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Col5a1O88207 Tmppe-201ENSMUST00000111820 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Col5a1O88207 Gm17276-201ENSMUST00000180839 2782 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Col5a1O88207 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Col5a1O88207 Fgd2-201ENSMUST00000024810 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Col5a1O88207 Zbtb42-203ENSMUST00000174780 3160 ntTSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Col5a1O88207 AC117194.1-201ENSMUST00000224847 3002 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Col5a1O88207 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Col5a1O88207 4921524J17Rik-201ENSMUST00000047749 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Col5a1O88207 BC048403-201ENSMUST00000065600 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Col5a1O88207 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Col5a1O88207 4931406C07Rik-203ENSMUST00000180339 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Col5a1O88207 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Col5a1O88207 Aldh6a1-201ENSMUST00000085192 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Col5a1O88207 Spata20-201ENSMUST00000041705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Col5a1O88207 1700011M02Rik-201ENSMUST00000113602 420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Col5a1O88207 Gm6322-201ENSMUST00000118789 1004 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Col5a1O88207 Gm12791-201ENSMUST00000120788 655 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Col5a1O88207 Utp23-202ENSMUST00000136129 779 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Col5a1O88207 Gm28833-201ENSMUST00000189671 559 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Col5a1O88207 Gm37197-201ENSMUST00000195607 401 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Col5a1O88207 4933430L12Rik-201ENSMUST00000206788 1194 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Col5a1O88207 Folr2-203ENSMUST00000210598 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Col5a1O88207 Psca-201ENSMUST00000023265 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Col5a1O88207 Mitd1-201ENSMUST00000027257 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Col5a1O88207 Ebi3-201ENSMUST00000003274 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Col5a1O88207 1600002K03Rik-201ENSMUST00000041882 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Col5a1O88207 Gm6509-201ENSMUST00000098286 1218 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Col5a1O88207 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Col5a1O88207 Arg1-201ENSMUST00000020161 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Col5a1O88207 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Col5a1O88207 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Col5a1O88207 Tti2-202ENSMUST00000209851 3133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Col5a1O88207 Rbm12b1-201ENSMUST00000050069 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Col5a1O88207 Cpt1c-206ENSMUST00000212836 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Col5a1O88207 Pdhx-201ENSMUST00000011058 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Col5a1O88207 Asz1-201ENSMUST00000010940 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Col5a1O88207 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Col5a1O88207 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Col5a1O88207 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Col5a1O88207 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Col5a1O88207 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Col5a1O88207 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Col5a1O88207 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Col5a1O88207 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Col5a1O88207 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Col5a1O88207 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Col5a1O88207 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Col5a1O88207 Gm8146-201ENSMUST00000192106 1847 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Col5a1O88207 Ctsc-201ENSMUST00000032779 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Col5a1O88207 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Col5a1O88207 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Col5a1O88207 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Col5a1O88207 Fbxo15-201ENSMUST00000037718 1437 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Col5a1O88207 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Col5a1O88207 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Col5a1O88207 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Col5a1O88207 Tex9-209ENSMUST00000184125 2794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Col5a1O88207 Gm26714-201ENSMUST00000181338 1655 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Col5a1O88207 Mpv17-202ENSMUST00000200744 1653 ntTSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Col5a1O88207 Clrn1-203ENSMUST00000072551 1662 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Col5a1O88207 Thtpa-201ENSMUST00000050575 2830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Col5a1O88207 Gm8271-201ENSMUST00000171053 1469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Col5a1O88207 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Col5a1O88207 Gadl1-202ENSMUST00000119291 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Col5a1O88207 Tapbp-201ENSMUST00000025161 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Col5a1O88207 Olfr1267-ps1-201ENSMUST00000118957 930 ntAPPRIS P1 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Col5a1O88207 Gm14395-201ENSMUST00000120494 563 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Col5a1O88207 Tnfrsf14-201ENSMUST00000123514 1018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Col5a1O88207 Kdm6bos-201ENSMUST00000129924 840 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Col5a1O88207 1700021J08Rik-201ENSMUST00000138729 575 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Col5a1O88207 Gm17709-201ENSMUST00000174536 1096 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Col5a1O88207 1600010M07Rik-202ENSMUST00000188662 654 ntTSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Col5a1O88207 Gm7238-201ENSMUST00000206467 973 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Col5a1O88207 Gm2448-201ENSMUST00000207080 559 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Col5a1O88207 Akr1c18-201ENSMUST00000021635 1200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Col5a1O88207 CT010506.1-201ENSMUST00000223673 349 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Col5a1O88207 Olfr314-201ENSMUST00000076393 1131 ntAPPRIS P1 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Col5a1O88207 Tex101-201ENSMUST00000078001 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Col5a1O88207 Sp7-201ENSMUST00000078508 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Col5a1O88207 Ikzf4-203ENSMUST00000221150 2213 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Col5a1O88207 1700010I14Rik-201ENSMUST00000024650 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Col5a1O88207 Cdrt4os1-201ENSMUST00000130177 2090 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Col5a1O88207 Ripor3-201ENSMUST00000099073 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Col5a1O88207 Gm19817-201ENSMUST00000199764 2132 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Col5a1O88207 Slc35a4-202ENSMUST00000050476 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Col5a1O88207 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Col5a1O88207 Qpctl-201ENSMUST00000032566 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.3 ms