Protein–RNA interactions for Protein: O70258

Sgce, Epsilon-sarcoglycan, mousemouse

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Length 437 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SgceO70258 Gm20537-202ENSMUST00000173131 889 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
SgceO70258 Gm13381-202ENSMUST00000177012 640 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
SgceO70258 Gm29054-201ENSMUST00000187589 1185 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
SgceO70258 Gsdmcl-ps-204ENSMUST00000191285 637 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
SgceO70258 Gm44364-201ENSMUST00000198368 141 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
SgceO70258 4930404N11Rik-201ENSMUST00000020456 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
SgceO70258 Colca2-202ENSMUST00000215038 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
SgceO70258 AC153929.1-201ENSMUST00000219009 303 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
SgceO70258 AC125350.2-201ENSMUST00000224737 727 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
SgceO70258 Mrap-201ENSMUST00000038197 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
SgceO70258 Ccdc70-202ENSMUST00000070649 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
SgceO70258 Olfr171-201ENSMUST00000079891 945 ntAPPRIS P2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
SgceO70258 Coq8a-201ENSMUST00000027766 4026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
SgceO70258 Tirap-203ENSMUST00000176531 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
SgceO70258 Ascc1-202ENSMUST00000164083 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
SgceO70258 Dis3l-208ENSMUST00000168844 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
SgceO70258 Nudt15-201ENSMUST00000043813 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
SgceO70258 Gm17746-201ENSMUST00000223429 3772 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
SgceO70258 Gm37849-201ENSMUST00000194722 1881 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
SgceO70258 Qrich1-201ENSMUST00000006851 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
SgceO70258 Tmx2-203ENSMUST00000111665 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
SgceO70258 Cib2-201ENSMUST00000041901 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
SgceO70258 Acsf3-201ENSMUST00000015160 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
SgceO70258 Pars2-202ENSMUST00000106781 3046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
SgceO70258 Telo2-201ENSMUST00000024987 3434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
SgceO70258 Fam160b2-201ENSMUST00000022690 4033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
SgceO70258 Slc6a2-202ENSMUST00000165470 6007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
SgceO70258 Arnt2-213ENSMUST00000209133 6228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
SgceO70258 Gm43720-201ENSMUST00000159067 6411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
SgceO70258 Mtm1-203ENSMUST00000061970 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
SgceO70258 Irak2-201ENSMUST00000059286 3196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
SgceO70258 Olfr283-202ENSMUST00000215830 2392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
SgceO70258 Gm5580-201ENSMUST00000122096 1362 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.71
SgceO70258 Zbtb21-202ENSMUST00000063605 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SgceO70258 Ank1-204ENSMUST00000117270 5652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
SgceO70258 Mrc2-201ENSMUST00000021038 3335 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SgceO70258 C2cd5-203ENSMUST00000171349 4292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
SgceO70258 Cnot10-201ENSMUST00000070117 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SgceO70258 Otub2-202ENSMUST00000101094 3228 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SgceO70258 Gm6189-201ENSMUST00000164487 2082 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
SgceO70258 Gm19692-201ENSMUST00000203856 2084 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
SgceO70258 Smim1-208ENSMUST00000143047 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SgceO70258 Pcdh10-202ENSMUST00000170695 8234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SgceO70258 Ncor2-202ENSMUST00000086083 8575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
SgceO70258 Gm36235-201ENSMUST00000223158 1694 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
SgceO70258 Gfi1b-201ENSMUST00000028156 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SgceO70258 Fibcd1-201ENSMUST00000028188 4751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SgceO70258 Cast-211ENSMUST00000223206 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
SgceO70258 Rab8a-201ENSMUST00000003121 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SgceO70258 Esco2-201ENSMUST00000022613 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SgceO70258 Gm12766-201ENSMUST00000140298 1823 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SgceO70258 Skap1-202ENSMUST00000100519 1100 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SgceO70258 Cstl1-202ENSMUST00000109954 454 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SgceO70258 Nmi-202ENSMUST00000112705 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SgceO70258 Gm12015-201ENSMUST00000117065 843 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
SgceO70258 Gm13376-201ENSMUST00000128743 448 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SgceO70258 Ccdc28a-203ENSMUST00000173243 590 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
SgceO70258 Magohb-205ENSMUST00000173837 897 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
SgceO70258 6530403H02Rik-204ENSMUST00000183276 659 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
SgceO70258 Gm28379-201ENSMUST00000186450 554 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
SgceO70258 Crip2-202ENSMUST00000196015 772 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
SgceO70258 Gm3961-201ENSMUST00000204425 994 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
SgceO70258 Caly-204ENSMUST00000211283 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SgceO70258 AC159896.2-201ENSMUST00000214753 269 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
SgceO70258 AC154319.1-201ENSMUST00000216330 312 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
SgceO70258 AL589735.1-201ENSMUST00000224353 270 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
SgceO70258 Tas2r137-201ENSMUST00000064932 1073 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
SgceO70258 Mirlet7c-2-201ENSMUST00000083674 95 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
SgceO70258 Lgals1-201ENSMUST00000089377 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SgceO70258 Gm16519-201ENSMUST00000092011 489 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
SgceO70258 Zmynd8-220ENSMUST00000170272 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SgceO70258 Fam53b-207ENSMUST00000106169 4536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SgceO70258 Onecut1-201ENSMUST00000056006 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SgceO70258 Gm15326-202ENSMUST00000128198 1422 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SgceO70258 Ggt1-208ENSMUST00000134503 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SgceO70258 Orc5-201ENSMUST00000030872 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SgceO70258 Togaram1-201ENSMUST00000066296 6372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SgceO70258 Hr-205ENSMUST00000163060 5278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
SgceO70258 Gm8522-201ENSMUST00000118416 1929 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
SgceO70258 Cd40-201ENSMUST00000017799 2986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SgceO70258 Gm37131-201ENSMUST00000192502 1561 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
SgceO70258 Myzap-201ENSMUST00000093823 2283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SgceO70258 Morc3-206ENSMUST00000202261 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SgceO70258 Morc3-201ENSMUST00000044068 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
SgceO70258 Smc4-202ENSMUST00000107803 3983 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
SgceO70258 Plekha6-203ENSMUST00000186917 4820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SgceO70258 Gm26516-201ENSMUST00000180943 1397 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SgceO70258 Ncapd2-201ENSMUST00000043848 4629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SgceO70258 Plcxd3-201ENSMUST00000061925 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SgceO70258 Pcdhga4-201ENSMUST00000194418 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SgceO70258 1700082M22Rik-201ENSMUST00000067136 2022 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SgceO70258 Sema3f-201ENSMUST00000080560 3395 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SgceO70258 Fam163a-201ENSMUST00000015628 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SgceO70258 Nr1h3-203ENSMUST00000111355 1672 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
SgceO70258 Triobp-204ENSMUST00000109690 7023 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SgceO70258 Tnc-201ENSMUST00000030056 6833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SgceO70258 Poc1a-201ENSMUST00000072206 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SgceO70258 D930032P07Rik-201ENSMUST00000181393 1314 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SgceO70258 Gm8862-201ENSMUST00000198379 1346 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
SgceO70258 Ddx11-201ENSMUST00000163605 4149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.6 ms