Protein–RNA interactions for Protein: J3QMZ1

Gm21789, Predicted gene, 21789, mousemouse

Predictions only

Length 123 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21789J3QMZ1 Rpl9-ps6-201ENSMUST00000078034 691 ntAPPRIS P1 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm21789J3QMZ1 Krtap19-1-201ENSMUST00000081334 493 ntAPPRIS P1 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm21789J3QMZ1 Gm10288-201ENSMUST00000084614 537 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm21789J3QMZ1 1110025L11Rik-201ENSMUST00000089104 591 ntAPPRIS P1 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm21789J3QMZ1 Lmnb2-204ENSMUST00000179022 3370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm21789J3QMZ1 Chrna10-201ENSMUST00000084830 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm21789J3QMZ1 Slc39a14-202ENSMUST00000068044 4926 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm21789J3QMZ1 Gdap2-202ENSMUST00000106997 2014 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm21789J3QMZ1 Herc3-201ENSMUST00000031823 3596 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm21789J3QMZ1 Atp6v1b1-201ENSMUST00000006431 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm21789J3QMZ1 Kdm2a-201ENSMUST00000047898 8578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm21789J3QMZ1 Arhgap29-201ENSMUST00000037958 5787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm21789J3QMZ1 Psap-204ENSMUST00000177779 2657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm21789J3QMZ1 Psap-205ENSMUST00000179238 2657 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm21789J3QMZ1 Psap-201ENSMUST00000004316 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm21789J3QMZ1 Dab2ip-209ENSMUST00000135741 4128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm21789J3QMZ1 Gm12200-201ENSMUST00000144876 1858 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm21789J3QMZ1 Sema6d-206ENSMUST00000103239 6225 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm21789J3QMZ1 Cc2d1a-202ENSMUST00000117424 3262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm21789J3QMZ1 Pdp1-202ENSMUST00000095144 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm21789J3QMZ1 Hnrnpf-201ENSMUST00000035493 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm21789J3QMZ1 Rbfox2-202ENSMUST00000111581 3072 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm21789J3QMZ1 Krtap10-10-201ENSMUST00000218843 1306 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm21789J3QMZ1 Tubgcp2-201ENSMUST00000026547 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm21789J3QMZ1 Immt-202ENSMUST00000101301 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm21789J3QMZ1 Hoxa1-201ENSMUST00000000964 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm21789J3QMZ1 Frmd8-201ENSMUST00000025728 4504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm21789J3QMZ1 Bpi-201ENSMUST00000065039 1926 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm21789J3QMZ1 Gm24891-201ENSMUST00000104391 136 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm21789J3QMZ1 Gm14058-201ENSMUST00000116082 735 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm21789J3QMZ1 Gm11941-201ENSMUST00000119904 610 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm21789J3QMZ1 Gm14396-201ENSMUST00000126966 548 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm21789J3QMZ1 5730437C11Rik-201ENSMUST00000155540 242 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm21789J3QMZ1 Gm38304-201ENSMUST00000161826 600 ntTSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm21789J3QMZ1 Chtf8-203ENSMUST00000176090 615 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm21789J3QMZ1 Stx5a-219ENSMUST00000177373 995 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm21789J3QMZ1 Hcfc1r1-203ENSMUST00000180140 693 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm21789J3QMZ1 Gm26759-201ENSMUST00000181773 1251 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm21789J3QMZ1 Gm27530-201ENSMUST00000184096 98 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm21789J3QMZ1 Ighv1-48-201ENSMUST00000191795 294 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm21789J3QMZ1 Gm2453-202ENSMUST00000195508 568 ntTSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm21789J3QMZ1 Isg20-206ENSMUST00000205981 834 ntTSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm21789J3QMZ1 Nkg7-203ENSMUST00000206741 686 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm21789J3QMZ1 Nanos3-202ENSMUST00000210202 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm21789J3QMZ1 3300002I08Rik-201ENSMUST00000051153 650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm21789J3QMZ1 Mir219a-1-201ENSMUST00000083621 110 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm21789J3QMZ1 Pip5kl1-201ENSMUST00000055304 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm21789J3QMZ1 1110046J04Rik-202ENSMUST00000180906 2776 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm21789J3QMZ1 Acvr1c-201ENSMUST00000028178 9162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm21789J3QMZ1 Gck-201ENSMUST00000102920 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm21789J3QMZ1 Kalrn-211ENSMUST00000114966 3857 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm21789J3QMZ1 Dis3l-208ENSMUST00000168844 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm21789J3QMZ1 Trpm1-221ENSMUST00000206706 2350 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm21789J3QMZ1 Slc35a4-202ENSMUST00000050476 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm21789J3QMZ1 Pcdhgc4-201ENSMUST00000066140 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm21789J3QMZ1 Nfe2l1-210ENSMUST00000167110 3547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm21789J3QMZ1 Cars-201ENSMUST00000010899 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm21789J3QMZ1 Esco2-201ENSMUST00000022613 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm21789J3QMZ1 Reps1-201ENSMUST00000126390 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm21789J3QMZ1 Gm29771-201ENSMUST00000193142 1423 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm21789J3QMZ1 Epm2aip1-201ENSMUST00000060711 7149 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm21789J3QMZ1 Reln-207ENSMUST00000161356 11699 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm21789J3QMZ1 Fyb2-201ENSMUST00000106803 3136 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm21789J3QMZ1 Tom1l2-202ENSMUST00000093046 4849 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm21789J3QMZ1 Rapgef2-202ENSMUST00000118340 6544 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm21789J3QMZ1 Ajuba-201ENSMUST00000054487 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm21789J3QMZ1 Hook2-204ENSMUST00000210326 3080 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm21789J3QMZ1 Abcd1-201ENSMUST00000002084 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm21789J3QMZ1 Qrich1-201ENSMUST00000006851 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm21789J3QMZ1 Gm6580-201ENSMUST00000117504 1357 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm21789J3QMZ1 Duox2-201ENSMUST00000053734 5744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm21789J3QMZ1 Emp1-201ENSMUST00000032330 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm21789J3QMZ1 Slc39a8-205ENSMUST00000167390 3533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm21789J3QMZ1 Slamf7-204ENSMUST00000194531 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm21789J3QMZ1 Rtp4-202ENSMUST00000209422 1859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm21789J3QMZ1 Birc3-201ENSMUST00000013949 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm21789J3QMZ1 Zfp341-202ENSMUST00000109702 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm21789J3QMZ1 Stxbp6-202ENSMUST00000120531 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm21789J3QMZ1 Nemp1-203ENSMUST00000118728 2362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm21789J3QMZ1 Gm8146-201ENSMUST00000192106 1847 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm21789J3QMZ1 Lhcgr-201ENSMUST00000024916 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm21789J3QMZ1 Arhgef15-203ENSMUST00000108671 4372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm21789J3QMZ1 Tnnt3-206ENSMUST00000105944 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm21789J3QMZ1 Tnnt3-209ENSMUST00000105947 780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm21789J3QMZ1 Tnnt3-210ENSMUST00000105948 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm21789J3QMZ1 Tnnt3-212ENSMUST00000105950 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm21789J3QMZ1 Ifitm10-203ENSMUST00000105988 824 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm21789J3QMZ1 Nrg4-204ENSMUST00000130158 1000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm21789J3QMZ1 Bcas3os2-201ENSMUST00000134305 661 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm21789J3QMZ1 Tnni2-206ENSMUST00000149529 768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm21789J3QMZ1 Gm44805-202ENSMUST00000150569 587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm21789J3QMZ1 Spata3-211ENSMUST00000159876 760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm21789J3QMZ1 Arid3b-204ENSMUST00000164010 1259 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm21789J3QMZ1 Tnnt3-224ENSMUST00000169299 1013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm21789J3QMZ1 Spaca6-209ENSMUST00000172097 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm21789J3QMZ1 Ctdspl-202ENSMUST00000172464 798 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm21789J3QMZ1 Tnnt3-226ENSMUST00000180152 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm21789J3QMZ1 Gm28937-201ENSMUST00000185413 695 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm21789J3QMZ1 Gm19744-202ENSMUST00000186135 948 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm21789J3QMZ1 Gm29400-201ENSMUST00000187208 695 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
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