Protein–RNA interactions for Protein: F7BCN0

Gm28048, Predicted gene, 28048 (Fragment), mousemouse

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Length 99 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28048F7BCN0 Gm8706-201ENSMUST00000197372 1491 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm28048F7BCN0 Ift22-205ENSMUST00000200157 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm28048F7BCN0 Slc12a9-201ENSMUST00000039991 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm28048F7BCN0 Lhx9-205ENSMUST00000112030 4633 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm28048F7BCN0 Gm21939-201ENSMUST00000221137 2773 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm28048F7BCN0 Tubgcp6-201ENSMUST00000041656 5357 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm28048F7BCN0 Gpr155-203ENSMUST00000112043 3284 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm28048F7BCN0 Trmt2a-207ENSMUST00000140206 3520 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm28048F7BCN0 Foxn2-201ENSMUST00000112238 5085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm28048F7BCN0 5330417C22Rik-202ENSMUST00000106625 5836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm28048F7BCN0 Cox15-201ENSMUST00000045562 4798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm28048F7BCN0 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm28048F7BCN0 Ctnnal1-201ENSMUST00000045142 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gm28048F7BCN0 Furin-201ENSMUST00000107362 4166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gm28048F7BCN0 Smarcb1-202ENSMUST00000121304 1622 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gm28048F7BCN0 Ing1-204ENSMUST00000210041 1881 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gm28048F7BCN0 Sdr9c7-201ENSMUST00000047134 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gm28048F7BCN0 Gm43579-201ENSMUST00000202387 1307 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Gm28048F7BCN0 Gm5620-201ENSMUST00000077991 1348 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Gm28048F7BCN0 Ktn1-220ENSMUST00000190252 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gm28048F7BCN0 Ablim1-213ENSMUST00000111559 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gm28048F7BCN0 Gtf2i-224ENSMUST00000174772 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gm28048F7BCN0 Akap10-203ENSMUST00000108710 3394 ntTSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gm28048F7BCN0 Zfp526-201ENSMUST00000055604 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gm28048F7BCN0 Tnfrsf18-202ENSMUST00000103173 1189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gm28048F7BCN0 Fam166b-203ENSMUST00000107929 865 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gm28048F7BCN0 Styxl1-202ENSMUST00000111161 963 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gm28048F7BCN0 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gm28048F7BCN0 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gm28048F7BCN0 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gm28048F7BCN0 Gm12058-201ENSMUST00000118614 437 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Gm28048F7BCN0 Gm11591-201ENSMUST00000120063 702 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Gm28048F7BCN0 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Gm28048F7BCN0 Gm1335-201ENSMUST00000121653 386 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Gm28048F7BCN0 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gm28048F7BCN0 Gm16191-202ENSMUST00000148464 484 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gm28048F7BCN0 Gm16339-201ENSMUST00000160954 929 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gm28048F7BCN0 1810008B01Rik-201ENSMUST00000162325 829 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gm28048F7BCN0 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gm28048F7BCN0 AC112680.3-201ENSMUST00000215297 488 ntTSL 3 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gm28048F7BCN0 AC148335.1-201ENSMUST00000218778 818 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gm28048F7BCN0 Timm9-203ENSMUST00000220482 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gm28048F7BCN0 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gm28048F7BCN0 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gm28048F7BCN0 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gm28048F7BCN0 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gm28048F7BCN0 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gm28048F7BCN0 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gm28048F7BCN0 C030034L19Rik-203ENSMUST00000181930 3133 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gm28048F7BCN0 Mog-201ENSMUST00000102665 1704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gm28048F7BCN0 AU019823-201ENSMUST00000131351 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gm28048F7BCN0 Sell-201ENSMUST00000027871 2199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gm28048F7BCN0 Nedd9-202ENSMUST00000163623 4626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gm28048F7BCN0 Nsd3-210ENSMUST00000153597 1865 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gm28048F7BCN0 Pmp2-201ENSMUST00000029034 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gm28048F7BCN0 Grin2b-202ENSMUST00000111905 7484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gm28048F7BCN0 Trip4-202ENSMUST00000119245 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gm28048F7BCN0 Lin52-201ENSMUST00000137170 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gm28048F7BCN0 Herc3-201ENSMUST00000031823 3596 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gm28048F7BCN0 Gm20427-201ENSMUST00000168978 3703 ntTSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gm28048F7BCN0 Gm34785-201ENSMUST00000222571 4582 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
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Gm28048F7BCN0 Pou2f1-202ENSMUST00000069609 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gm28048F7BCN0 Nop16-201ENSMUST00000026987 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gm28048F7BCN0 Olfr140-202ENSMUST00000111506 3449 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gm28048F7BCN0 Atp4a-204ENSMUST00000170371 3447 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
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Gm28048F7BCN0 Strada-202ENSMUST00000103072 1517 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
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Gm28048F7BCN0 Radil-203ENSMUST00000110784 3106 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gm28048F7BCN0 Add2-207ENSMUST00000203724 3143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gm28048F7BCN0 Mamld1-202ENSMUST00000114629 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gm28048F7BCN0 Astn1-209ENSMUST00000194369 3344 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gm28048F7BCN0 Fbxo40-201ENSMUST00000075869 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gm28048F7BCN0 3425401B19Rik-201ENSMUST00000096038 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gm28048F7BCN0 Ackr3-201ENSMUST00000065587 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gm28048F7BCN0 Scrn3-202ENSMUST00000112050 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gm28048F7BCN0 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gm28048F7BCN0 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gm28048F7BCN0 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gm28048F7BCN0 Psma1-203ENSMUST00000135570 960 ntTSL 3 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gm28048F7BCN0 AI480526-203ENSMUST00000160099 1017 ntTSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gm28048F7BCN0 C1qtnf2-203ENSMUST00000173002 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gm28048F7BCN0 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Gm28048F7BCN0 Gm35986-201ENSMUST00000197370 655 ntTSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gm28048F7BCN0 Camsap3-209ENSMUST00000207970 3817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gm28048F7BCN0 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Gm28048F7BCN0 Spc24-204ENSMUST00000216057 627 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gm28048F7BCN0 AC162938.2-203ENSMUST00000216604 1134 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gm28048F7BCN0 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gm28048F7BCN0 Gm807-202ENSMUST00000224929 408 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Gm28048F7BCN0 4930569F06Rik-201ENSMUST00000036821 433 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Gm28048F7BCN0 Mdk-203ENSMUST00000090602 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gm28048F7BCN0 Gm11559-201ENSMUST00000092694 1096 ntAPPRIS P1 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gm28048F7BCN0 Jade1-201ENSMUST00000026865 5481 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gm28048F7BCN0 Scn8a-203ENSMUST00000108908 7030 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.67
Gm28048F7BCN0 Adra2b-202ENSMUST00000104934 4014 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.9□□□□□ -0.67
Gm28048F7BCN0 Tro-202ENSMUST00000087258 6559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
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