Protein–RNA interactions for Protein: A4UUI3

Gbp4, Guanylate binding protein 4.1, mousemouse

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Length 631 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbp4A4UUI3 Sspn-201ENSMUST00000032383 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gbp4A4UUI3 Pif1-202ENSMUST00000131483 3309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gbp4A4UUI3 Pcdhga4-201ENSMUST00000194418 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gbp4A4UUI3 Rad23a-201ENSMUST00000003911 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gbp4A4UUI3 Mon1b-202ENSMUST00000179926 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gbp4A4UUI3 Gemin4-201ENSMUST00000102500 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gbp4A4UUI3 Dis3l-208ENSMUST00000168844 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gbp4A4UUI3 Abcb9-201ENSMUST00000031354 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gbp4A4UUI3 Padi6-201ENSMUST00000038749 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gbp4A4UUI3 Misp-202ENSMUST00000169041 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gbp4A4UUI3 Ank2-203ENSMUST00000182008 2474 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gbp4A4UUI3 Nxph2-201ENSMUST00000102945 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gbp4A4UUI3 Gm37648-201ENSMUST00000192072 2563 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Gbp4A4UUI3 Vps33b-201ENSMUST00000032749 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gbp4A4UUI3 Gm43051-201ENSMUST00000201096 2678 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Gbp4A4UUI3 Iqsec1-201ENSMUST00000101151 6490 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gbp4A4UUI3 Nek1-208ENSMUST00000211256 4810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gbp4A4UUI3 Lmnb2-204ENSMUST00000179022 3370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gbp4A4UUI3 Evi5l-208ENSMUST00000176825 3728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gbp4A4UUI3 Gm6890-201ENSMUST00000114117 776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gbp4A4UUI3 Gm13996-201ENSMUST00000118456 430 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Gbp4A4UUI3 Gm4760-201ENSMUST00000119663 1030 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Gbp4A4UUI3 Bnip3-203ENSMUST00000130500 719 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gbp4A4UUI3 Immp2l-202ENSMUST00000132121 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
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Gbp4A4UUI3 Gm32999-201ENSMUST00000192693 562 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Gbp4A4UUI3 Rassf4-202ENSMUST00000203029 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gbp4A4UUI3 Gm44710-201ENSMUST00000208885 471 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gbp4A4UUI3 AC110091.1-201ENSMUST00000216004 691 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gbp4A4UUI3 Gm8385-201ENSMUST00000058999 643 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Gbp4A4UUI3 Ccdc28a-202ENSMUST00000080860 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gbp4A4UUI3 Lgals1-201ENSMUST00000089377 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gbp4A4UUI3 Cox5a-201ENSMUST00000000090 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gbp4A4UUI3 Spatc1l-201ENSMUST00000009259 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gbp4A4UUI3 Zfp423-201ENSMUST00000052250 4510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gbp4A4UUI3 Gm10787-201ENSMUST00000099552 1548 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gbp4A4UUI3 Acnat2-201ENSMUST00000081541 1664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gbp4A4UUI3 Olfr222-203ENSMUST00000215339 2166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gbp4A4UUI3 Borcs7-201ENSMUST00000074912 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gbp4A4UUI3 A830082K12Rik-201ENSMUST00000123998 2203 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gbp4A4UUI3 Gm44806-201ENSMUST00000205574 2303 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Gbp4A4UUI3 Astl-201ENSMUST00000059839 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gbp4A4UUI3 4930563D23Rik-201ENSMUST00000062638 2646 ntAPPRIS P1 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gbp4A4UUI3 Tnk1-201ENSMUST00000001626 2778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gbp4A4UUI3 Ebf2-202ENSMUST00000176029 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gbp4A4UUI3 Srrt-212ENSMUST00000199243 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gbp4A4UUI3 Mmab-201ENSMUST00000031560 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gbp4A4UUI3 Rimbp2-204ENSMUST00000198941 6446 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gbp4A4UUI3 Mtm1-203ENSMUST00000061970 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gbp4A4UUI3 Ptger4-202ENSMUST00000120563 3312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gbp4A4UUI3 Spata20-201ENSMUST00000041705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gbp4A4UUI3 Csrnp3-207ENSMUST00000145598 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gbp4A4UUI3 Tirap-203ENSMUST00000176531 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gbp4A4UUI3 Wdr20rt-201ENSMUST00000046331 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gbp4A4UUI3 Serpinf2-202ENSMUST00000108437 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gbp4A4UUI3 Gsdme-205ENSMUST00000170142 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
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Gbp4A4UUI3 Henmt1-205ENSMUST00000196533 1491 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gbp4A4UUI3 Ccr4-202ENSMUST00000215425 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gbp4A4UUI3 Ccr6-203ENSMUST00000166348 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gbp4A4UUI3 Gm20646-201ENSMUST00000176807 1316 ntTSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gbp4A4UUI3 Fam170a-201ENSMUST00000039121 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
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Gbp4A4UUI3 Bmp3-203ENSMUST00000200388 6609 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gbp4A4UUI3 Il21r-201ENSMUST00000033000 2499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gbp4A4UUI3 Pdzrn4-202ENSMUST00000169942 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gbp4A4UUI3 Vmn2r-ps25-201ENSMUST00000202322 2321 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Gbp4A4UUI3 Uprt-201ENSMUST00000087867 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gbp4A4UUI3 Ash2l-210ENSMUST00000166078 2234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gbp4A4UUI3 Slc22a16-201ENSMUST00000019978 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gbp4A4UUI3 Kcnab2-201ENSMUST00000030768 3533 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gbp4A4UUI3 Lta4h-201ENSMUST00000016033 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gbp4A4UUI3 H2-Q1-201ENSMUST00000073208 2024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gbp4A4UUI3 Herpud1-201ENSMUST00000034220 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gbp4A4UUI3 Hnrnpk-202ENSMUST00000116403 2970 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gbp4A4UUI3 Tgfbr1-202ENSMUST00000044234 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gbp4A4UUI3 Gfi1b-201ENSMUST00000028156 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gbp4A4UUI3 Chil1-201ENSMUST00000082060 1687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gbp4A4UUI3 Dlk1-201ENSMUST00000056110 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gbp4A4UUI3 Tgm2-201ENSMUST00000103122 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gbp4A4UUI3 Rab8a-201ENSMUST00000003121 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gbp4A4UUI3 Fam149a-201ENSMUST00000093526 5469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gbp4A4UUI3 Tspan2-201ENSMUST00000029451 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gbp4A4UUI3 Gm43154-214ENSMUST00000211225 1420 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gbp4A4UUI3 Gm36855-203ENSMUST00000216660 1406 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gbp4A4UUI3 Fam206a-201ENSMUST00000045368 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gbp4A4UUI3 Gm26516-201ENSMUST00000180943 1397 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gbp4A4UUI3 Myl4-202ENSMUST00000106956 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gbp4A4UUI3 Rpl28-ps3-201ENSMUST00000116058 393 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Gbp4A4UUI3 Gm12130-201ENSMUST00000133599 639 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
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