Protein–RNA interactions for Protein: A2AJB9

Lcn6, LCN6 isoform alpha, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lcn6A2AJB9 Ephb6-201ENSMUST00000114732 3762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Lcn6A2AJB9 Ppp1r10-202ENSMUST00000087211 4255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Lcn6A2AJB9 Hnrnpk-202ENSMUST00000116403 2970 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Lcn6A2AJB9 Zfp810-201ENSMUST00000086278 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Lcn6A2AJB9 Nr1h3-203ENSMUST00000111355 1672 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Lcn6A2AJB9 Dnaic2-201ENSMUST00000069325 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Lcn6A2AJB9 Slc16a12-201ENSMUST00000009522 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Lcn6A2AJB9 Serpinf2-202ENSMUST00000108437 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Lcn6A2AJB9 Cyp26b1-204ENSMUST00000204146 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Lcn6A2AJB9 Mapk4-202ENSMUST00000159162 3514 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Lcn6A2AJB9 Gipc3-201ENSMUST00000045102 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Lcn6A2AJB9 Cpped1-202ENSMUST00000096272 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Lcn6A2AJB9 Prx-204ENSMUST00000125990 4298 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Lcn6A2AJB9 Bmp7-201ENSMUST00000009143 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Lcn6A2AJB9 Slc6a18-204ENSMUST00000220650 1728 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Lcn6A2AJB9 Trim46-202ENSMUST00000090924 2721 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Lcn6A2AJB9 Pou4f2-201ENSMUST00000034115 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Lcn6A2AJB9 Pcdh8-204ENSMUST00000195355 3704 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Lcn6A2AJB9 Il13ra1-201ENSMUST00000033418 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Lcn6A2AJB9 Pcdhb21-201ENSMUST00000061405 4705 ntAPPRIS P1 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Lcn6A2AJB9 Frmd4a-202ENSMUST00000091497 6208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Lcn6A2AJB9 Got1l1-201ENSMUST00000038174 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Lcn6A2AJB9 Zhx2-201ENSMUST00000096430 4376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Lcn6A2AJB9 S1pr1-201ENSMUST00000055676 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Lcn6A2AJB9 Immt-203ENSMUST00000114151 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Lcn6A2AJB9 Rpl11-201ENSMUST00000102536 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Lcn6A2AJB9 Trav13-1-201ENSMUST00000103651 331 ntAPPRIS P1 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Lcn6A2AJB9 Ccl27a-206ENSMUST00000108037 590 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Lcn6A2AJB9 Gm9062-201ENSMUST00000117712 727 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Lcn6A2AJB9 Gm15207-201ENSMUST00000119259 442 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Lcn6A2AJB9 Pcbd2-202ENSMUST00000124968 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Lcn6A2AJB9 Gm53-203ENSMUST00000143887 757 ntTSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Lcn6A2AJB9 Cryge-202ENSMUST00000161960 690 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Lcn6A2AJB9 Omt2a-203ENSMUST00000166056 1167 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Lcn6A2AJB9 Tmem255b-202ENSMUST00000167505 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Lcn6A2AJB9 Gm8815-201ENSMUST00000173809 620 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Lcn6A2AJB9 Ssty2-201ENSMUST00000179136 684 ntAPPRIS P1 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Lcn6A2AJB9 Cyb561-206ENSMUST00000184086 1130 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Lcn6A2AJB9 Gm5733-201ENSMUST00000190232 939 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Lcn6A2AJB9 Ssty2-202ENSMUST00000190565 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Lcn6A2AJB9 Gm29264-201ENSMUST00000191240 1264 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Lcn6A2AJB9 Gm38117-201ENSMUST00000194653 939 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Lcn6A2AJB9 Gm45781-201ENSMUST00000212860 539 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Lcn6A2AJB9 Gm1821-202ENSMUST00000227415 750 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Lcn6A2AJB9 Cfap52-201ENSMUST00000021287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Lcn6A2AJB9 Prkag3-206ENSMUST00000188073 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Lcn6A2AJB9 Sesn2-201ENSMUST00000030724 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Lcn6A2AJB9 Psmd9-201ENSMUST00000100729 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Lcn6A2AJB9 Hnrnpc-206ENSMUST00000227458 1683 ntAPPRIS ALT1 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Lcn6A2AJB9 Atl3-202ENSMUST00000170373 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Lcn6A2AJB9 Stx11-202ENSMUST00000163425 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Lcn6A2AJB9 Kcnb1-204ENSMUST00000207917 11153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Lcn6A2AJB9 Gfap-201ENSMUST00000067444 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Lcn6A2AJB9 Usp14-201ENSMUST00000092096 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Lcn6A2AJB9 Tead3-207ENSMUST00000219703 1320 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Lcn6A2AJB9 Frmd8-201ENSMUST00000025728 4504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Lcn6A2AJB9 Lrrc3-201ENSMUST00000057608 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Lcn6A2AJB9 Rims4-201ENSMUST00000044734 4962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
Lcn6A2AJB9 Hk2-201ENSMUST00000000642 5513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
Lcn6A2AJB9 Wnt7b-201ENSMUST00000023015 3371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
Lcn6A2AJB9 Git2-202ENSMUST00000086564 2984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.43
Lcn6A2AJB9 Adh5-201ENSMUST00000005964 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
Lcn6A2AJB9 Gemin4-201ENSMUST00000102500 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
Lcn6A2AJB9 Mtr-201ENSMUST00000099856 8294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
Lcn6A2AJB9 Pcdhgc4-201ENSMUST00000066140 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
Lcn6A2AJB9 Gm2238-201ENSMUST00000192074 3669 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Lcn6A2AJB9 Abcb9-201ENSMUST00000031354 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Lcn6A2AJB9 Gm16907-201ENSMUST00000180734 2317 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Lcn6A2AJB9 Papss1-201ENSMUST00000029666 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Lcn6A2AJB9 Zfyve1-203ENSMUST00000221919 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Lcn6A2AJB9 Ndrg2-201ENSMUST00000004673 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Lcn6A2AJB9 Luc7l-201ENSMUST00000025023 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Lcn6A2AJB9 Ppara-203ENSMUST00000109423 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Lcn6A2AJB9 Fndc3b-201ENSMUST00000046157 6875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Lcn6A2AJB9 Trav13d-4-201ENSMUST00000103607 264 ntAPPRIS P1 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Lcn6A2AJB9 Gm11331-201ENSMUST00000119764 288 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Lcn6A2AJB9 Gm8199-201ENSMUST00000121323 823 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Lcn6A2AJB9 4930562C15Rik-202ENSMUST00000171105 1299 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Lcn6A2AJB9 Ctdspl-202ENSMUST00000172464 798 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
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Lcn6A2AJB9 Gm27530-201ENSMUST00000184096 98 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Lcn6A2AJB9 Trav13-4-dv7-202ENSMUST00000184905 264 ntAPPRIS P1 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Lcn6A2AJB9 Atraid-205ENSMUST00000201136 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Lcn6A2AJB9 Isg20-206ENSMUST00000205981 834 ntTSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Lcn6A2AJB9 Gm45575-201ENSMUST00000210283 548 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Lcn6A2AJB9 1700008C04Rik-201ENSMUST00000218606 797 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Lcn6A2AJB9 Gm5537-201ENSMUST00000091117 1252 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Lcn6A2AJB9 Apbb2-216ENSMUST00000162366 6540 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Lcn6A2AJB9 Med12l-201ENSMUST00000029393 2295 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Lcn6A2AJB9 Gjb2-201ENSMUST00000055698 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Lcn6A2AJB9 Med28-205ENSMUST00000156481 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Lcn6A2AJB9 Clpx-201ENSMUST00000015501 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Lcn6A2AJB9 Rad51ap1-202ENSMUST00000112221 1871 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Lcn6A2AJB9 Stat5a-203ENSMUST00000107357 3605 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Lcn6A2AJB9 Gm5859-201ENSMUST00000165401 2324 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Lcn6A2AJB9 Poc1a-201ENSMUST00000072206 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Lcn6A2AJB9 Pex26-201ENSMUST00000088561 4093 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Lcn6A2AJB9 Rbm8a-202ENSMUST00000196456 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Lcn6A2AJB9 Rbm8a-206ENSMUST00000200647 2620 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.6 ms