Protein–RNA interactions for Protein: A2A7B5

Prdm2, PR domain-containing 2, with ZNF domain, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,709 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm2A2A7B5 Isca2-206ENSMUST00000222449 374 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prdm2A2A7B5 Psmb7-201ENSMUST00000028083 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prdm2A2A7B5 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prdm2A2A7B5 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prdm2A2A7B5 Pou6f1-201ENSMUST00000058274 2523 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prdm2A2A7B5 Smap1-202ENSMUST00000129254 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prdm2A2A7B5 Gm42970-201ENSMUST00000196407 1352 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Prdm2A2A7B5 Mest-202ENSMUST00000124665 2665 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prdm2A2A7B5 Astn1-202ENSMUST00000170718 2927 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prdm2A2A7B5 Magee1-201ENSMUST00000033578 3550 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prdm2A2A7B5 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prdm2A2A7B5 Anxa9-202ENSMUST00000107183 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prdm2A2A7B5 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prdm2A2A7B5 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prdm2A2A7B5 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prdm2A2A7B5 Gm12712-201ENSMUST00000120676 801 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Prdm2A2A7B5 Srrm3os-201ENSMUST00000131896 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prdm2A2A7B5 Atad3aos-202ENSMUST00000150777 650 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prdm2A2A7B5 Ppy-202ENSMUST00000170554 487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prdm2A2A7B5 Mmp7-201ENSMUST00000018767 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prdm2A2A7B5 Gm43966-201ENSMUST00000203301 612 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Prdm2A2A7B5 Gm3318-201ENSMUST00000217604 1183 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Prdm2A2A7B5 Mrps11-201ENSMUST00000032840 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prdm2A2A7B5 Wdcp-205ENSMUST00000220215 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prdm2A2A7B5 Dolpp1-203ENSMUST00000123202 2294 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prdm2A2A7B5 Dolpp1-201ENSMUST00000028209 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prdm2A2A7B5 Gm4593-201ENSMUST00000205334 1555 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prdm2A2A7B5 Syt15-202ENSMUST00000119693 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prdm2A2A7B5 Spata7-201ENSMUST00000048402 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prdm2A2A7B5 G630016G05Rik-202ENSMUST00000156095 3398 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prdm2A2A7B5 Wnt7b-201ENSMUST00000023015 3371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prdm2A2A7B5 Polm-202ENSMUST00000109837 2697 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prdm2A2A7B5 Fitm2-201ENSMUST00000109418 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prdm2A2A7B5 Gmeb1-201ENSMUST00000030733 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prdm2A2A7B5 Riox2-202ENSMUST00000120667 2200 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prdm2A2A7B5 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prdm2A2A7B5 Polr1e-203ENSMUST00000107814 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prdm2A2A7B5 Mmel1-204ENSMUST00000105635 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prdm2A2A7B5 A330093E20Rik-202ENSMUST00000184994 2327 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prdm2A2A7B5 1110032A03Rik-201ENSMUST00000042468 2082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prdm2A2A7B5 Schip1-202ENSMUST00000169909 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prdm2A2A7B5 Trim6-206ENSMUST00000214578 1506 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prdm2A2A7B5 Dusp3-207ENSMUST00000176261 496 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prdm2A2A7B5 Gm30731-201ENSMUST00000203909 825 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prdm2A2A7B5 Cklf-210ENSMUST00000212939 737 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prdm2A2A7B5 E230034D01Rik-203ENSMUST00000217357 1159 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prdm2A2A7B5 AC138716.2-201ENSMUST00000226670 1016 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Prdm2A2A7B5 AC142266.1-201ENSMUST00000228107 415 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Prdm2A2A7B5 Pla2g1b-201ENSMUST00000031495 557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prdm2A2A7B5 Kcnj5-203ENSMUST00000216033 2440 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prdm2A2A7B5 Prr3-203ENSMUST00000172429 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prdm2A2A7B5 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prdm2A2A7B5 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prdm2A2A7B5 4932443L11Rik-202ENSMUST00000177130 2827 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prdm2A2A7B5 Anp32e-204ENSMUST00000168106 2890 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prdm2A2A7B5 Palb2-204ENSMUST00000106469 2559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prdm2A2A7B5 Akr1b8-201ENSMUST00000038406 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prdm2A2A7B5 AC022682.1-201ENSMUST00000224624 2023 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Prdm2A2A7B5 Car10-201ENSMUST00000042943 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prdm2A2A7B5 Npl-201ENSMUST00000041874 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prdm2A2A7B5 Eya1-202ENSMUST00000080664 3426 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prdm2A2A7B5 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prdm2A2A7B5 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prdm2A2A7B5 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prdm2A2A7B5 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prdm2A2A7B5 Gm8050-201ENSMUST00000171987 1595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prdm2A2A7B5 Sec14l2-201ENSMUST00000003681 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prdm2A2A7B5 Gm22937-201ENSMUST00000103954 131 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Prdm2A2A7B5 Lrrc75aos2-202ENSMUST00000128647 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prdm2A2A7B5 Gm25343-201ENSMUST00000157460 107 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Prdm2A2A7B5 Gm18733-202ENSMUST00000174447 401 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Prdm2A2A7B5 Gm23400-201ENSMUST00000174994 102 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Prdm2A2A7B5 Gm26463-201ENSMUST00000175065 101 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Prdm2A2A7B5 Gm24332-201ENSMUST00000175102 102 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Prdm2A2A7B5 Gm25959-201ENSMUST00000175112 102 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Prdm2A2A7B5 Gm22475-201ENSMUST00000175169 102 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Prdm2A2A7B5 Gm22903-201ENSMUST00000175193 102 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Prdm2A2A7B5 Gm25070-201ENSMUST00000175237 102 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Prdm2A2A7B5 Gm24159-201ENSMUST00000175264 102 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Prdm2A2A7B5 Gm25299-201ENSMUST00000175283 102 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Prdm2A2A7B5 Gm23798-201ENSMUST00000175560 102 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Prdm2A2A7B5 Gm23802-201ENSMUST00000175565 102 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Prdm2A2A7B5 Gm25708-201ENSMUST00000177687 102 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Prdm2A2A7B5 Gm24370-201ENSMUST00000178007 102 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Prdm2A2A7B5 Gm23049-201ENSMUST00000178068 102 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Prdm2A2A7B5 Gm28019-201ENSMUST00000178138 101 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Prdm2A2A7B5 Gm25571-201ENSMUST00000178322 102 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Prdm2A2A7B5 Gm25355-201ENSMUST00000178456 101 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Prdm2A2A7B5 Gm24975-201ENSMUST00000178492 101 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Prdm2A2A7B5 Gm23189-201ENSMUST00000178954 102 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Prdm2A2A7B5 Gm25100-201ENSMUST00000179750 101 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Prdm2A2A7B5 Gm23064-201ENSMUST00000179866 101 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Prdm2A2A7B5 Gm18010-201ENSMUST00000203553 202 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Prdm2A2A7B5 CT030170.2-201ENSMUST00000223267 126 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Prdm2A2A7B5 Naca-201ENSMUST00000073868 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prdm2A2A7B5 4833422C13Rik-202ENSMUST00000160385 2828 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prdm2A2A7B5 Fga-201ENSMUST00000029630 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prdm2A2A7B5 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prdm2A2A7B5 Chrnd-201ENSMUST00000073252 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prdm2A2A7B5 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms