Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2V5

Hdac6, Histone deacetylase 6, mousemouse

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Length 1,149 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac6Q9Z2V5 Gm17192-201ENSMUST00000169031 511 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Hdac6Q9Z2V5 Ighv1-76-201ENSMUST00000169155 294 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hdac6Q9Z2V5 Ighv1-62-1-202ENSMUST00000171270 90 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hdac6Q9Z2V5 Nudt12-203ENSMUST00000174122 1244 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hdac6Q9Z2V5 Gm28819-201ENSMUST00000186691 572 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hdac6Q9Z2V5 Gm28833-201ENSMUST00000189671 559 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Hdac6Q9Z2V5 Gm28840-208ENSMUST00000191514 738 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hdac6Q9Z2V5 Gm44647-201ENSMUST00000207402 428 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Hdac6Q9Z2V5 Isoc2b-205ENSMUST00000208816 820 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hdac6Q9Z2V5 Gm19640-201ENSMUST00000214849 464 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Hdac6Q9Z2V5 4930449E01Rik-201ENSMUST00000022711 595 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hdac6Q9Z2V5 Olfr1230-201ENSMUST00000099787 918 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hdac6Q9Z2V5 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hdac6Q9Z2V5 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hdac6Q9Z2V5 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hdac6Q9Z2V5 Kcnk2-206ENSMUST00000193319 1548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hdac6Q9Z2V5 Oxsm-202ENSMUST00000112624 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hdac6Q9Z2V5 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hdac6Q9Z2V5 Gm37600-201ENSMUST00000193764 3292 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Hdac6Q9Z2V5 Gabarapl2-201ENSMUST00000034428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hdac6Q9Z2V5 Mdh1b-201ENSMUST00000114094 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hdac6Q9Z2V5 Reep2-201ENSMUST00000043484 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hdac6Q9Z2V5 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hdac6Q9Z2V5 Gm7002-201ENSMUST00000221386 2165 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Hdac6Q9Z2V5 Tmem168-201ENSMUST00000031554 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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Hdac6Q9Z2V5 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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Hdac6Q9Z2V5 Tnnt3-211ENSMUST00000105949 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
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Hdac6Q9Z2V5 Dcaf11-202ENSMUST00000117236 2538 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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Hdac6Q9Z2V5 Tarm1-203ENSMUST00000203821 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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Hdac6Q9Z2V5 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
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Hdac6Q9Z2V5 Fndc8-201ENSMUST00000018988 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Hdac6Q9Z2V5 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
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Hdac6Q9Z2V5 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Hdac6Q9Z2V5 BC004004-203ENSMUST00000149405 1402 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
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Hdac6Q9Z2V5 Gm45833-201ENSMUST00000211931 2730 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
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Hdac6Q9Z2V5 Spag6-201ENSMUST00000095132 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Hdac6Q9Z2V5 Vipr1-201ENSMUST00000035115 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Hdac6Q9Z2V5 Gm38385-201ENSMUST00000194454 2351 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Hdac6Q9Z2V5 2610011E03Rik-201ENSMUST00000200128 2235 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Hdac6Q9Z2V5 Pkib-203ENSMUST00000095668 3311 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
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Hdac6Q9Z2V5 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Hdac6Q9Z2V5 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Hdac6Q9Z2V5 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Hdac6Q9Z2V5 Fbrs-207ENSMUST00000206394 2961 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Hdac6Q9Z2V5 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Hdac6Q9Z2V5 Slc1a2-203ENSMUST00000111212 1957 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Hdac6Q9Z2V5 Gm12200-201ENSMUST00000144876 1858 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Hdac6Q9Z2V5 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Hdac6Q9Z2V5 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Hdac6Q9Z2V5 Tcf4-254ENSMUST00000202674 2615 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Hdac6Q9Z2V5 Aldoc-202ENSMUST00000102478 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
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