Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0S7

Cldn9, Claudin-9, mousemouse

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Length 217 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn9Q9Z0S7 Ehbp1l1-202ENSMUST00000075606 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Cldn9Q9Z0S7 Pcdhb21-201ENSMUST00000061405 4705 ntAPPRIS P1 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Cldn9Q9Z0S7 Krt31-201ENSMUST00000007318 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Cldn9Q9Z0S7 AC124397.2-201ENSMUST00000225575 2215 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Cldn9Q9Z0S7 Mfsd13b-201ENSMUST00000033166 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Cldn9Q9Z0S7 Hyal3-202ENSMUST00000148440 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.59
Cldn9Q9Z0S7 Myo7a-213ENSMUST00000205746 6689 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.59
Cldn9Q9Z0S7 Nfe2l1-211ENSMUST00000167149 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Cldn9Q9Z0S7 Tie1-201ENSMUST00000047421 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Cldn9Q9Z0S7 Cdh22-201ENSMUST00000065438 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cldn9Q9Z0S7 Tmem200a-203ENSMUST00000218232 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cldn9Q9Z0S7 Pcdhga11-201ENSMUST00000061279 4756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cldn9Q9Z0S7 Ablim2-203ENSMUST00000114203 1333 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cldn9Q9Z0S7 Mei1-201ENSMUST00000089178 3974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cldn9Q9Z0S7 Rragd-202ENSMUST00000084747 4295 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cldn9Q9Z0S7 Gm43908-201ENSMUST00000205074 1472 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Cldn9Q9Z0S7 Tcof1-202ENSMUST00000175934 4595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cldn9Q9Z0S7 Xkr5-201ENSMUST00000055503 3176 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cldn9Q9Z0S7 Myoc-201ENSMUST00000028020 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cldn9Q9Z0S7 Rabgef1-203ENSMUST00000119797 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cldn9Q9Z0S7 Cntnap1-201ENSMUST00000103109 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cldn9Q9Z0S7 4931428F04Rik-202ENSMUST00000171788 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cldn9Q9Z0S7 Gm26286-201ENSMUST00000104166 134 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Cldn9Q9Z0S7 Rpl35a-204ENSMUST00000115078 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cldn9Q9Z0S7 Gm15004-201ENSMUST00000119192 630 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Cldn9Q9Z0S7 1300017J02Rik-202ENSMUST00000123530 1874 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cldn9Q9Z0S7 Gm16087-201ENSMUST00000124395 964 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cldn9Q9Z0S7 Lage3-201ENSMUST00000015433 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cldn9Q9Z0S7 9330159M07Rik-202ENSMUST00000180783 1044 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cldn9Q9Z0S7 1700120C18Rik-201ENSMUST00000182952 985 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cldn9Q9Z0S7 Gm27320-201ENSMUST00000184892 109 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Cldn9Q9Z0S7 Gm8856-201ENSMUST00000185254 1144 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Cldn9Q9Z0S7 Gm42797-201ENSMUST00000197573 494 ntTSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cldn9Q9Z0S7 Gm7783-201ENSMUST00000204795 781 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Cldn9Q9Z0S7 Gm44992-206ENSMUST00000209313 1261 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cldn9Q9Z0S7 Gm33104-201ENSMUST00000214178 1010 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
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Cldn9Q9Z0S7 Olfr1347-201ENSMUST00000036357 964 ntAPPRIS P1 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cldn9Q9Z0S7 Arhgap33-201ENSMUST00000044338 4280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cldn9Q9Z0S7 Sin3b-201ENSMUST00000004494 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cldn9Q9Z0S7 Lce3d-201ENSMUST00000059053 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cldn9Q9Z0S7 Slc2a7-201ENSMUST00000059893 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cldn9Q9Z0S7 Cbln3-201ENSMUST00000063871 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cldn9Q9Z0S7 Ccdc28a-202ENSMUST00000080860 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cldn9Q9Z0S7 Susd5-201ENSMUST00000135338 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cldn9Q9Z0S7 Ptchd3-201ENSMUST00000036690 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cldn9Q9Z0S7 Smtn-204ENSMUST00000110011 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cldn9Q9Z0S7 Spred2-201ENSMUST00000093298 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cldn9Q9Z0S7 Rbm10-202ENSMUST00000082089 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cldn9Q9Z0S7 Camta2-205ENSMUST00000119120 4460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cldn9Q9Z0S7 Cux1-204ENSMUST00000175975 10945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cldn9Q9Z0S7 Ccdc151-202ENSMUST00000115336 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cldn9Q9Z0S7 Sgpp2-201ENSMUST00000036172 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cldn9Q9Z0S7 H2-Q1-202ENSMUST00000105041 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
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Cldn9Q9Z0S7 Etfrf1-207ENSMUST00000111726 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cldn9Q9Z0S7 Fcer2a-201ENSMUST00000005678 2242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cldn9Q9Z0S7 Rbm47-209ENSMUST00000201544 5211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cldn9Q9Z0S7 Gabrr2-202ENSMUST00000108162 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cldn9Q9Z0S7 Fbln2-201ENSMUST00000041544 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cldn9Q9Z0S7 Fcrl1-203ENSMUST00000167200 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
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Cldn9Q9Z0S7 Cd19-204ENSMUST00000206325 2452 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
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Cldn9Q9Z0S7 Nek5-202ENSMUST00000209656 2253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
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Cldn9Q9Z0S7 Banp-204ENSMUST00000170857 5444 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cldn9Q9Z0S7 Nme8-202ENSMUST00000091763 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cldn9Q9Z0S7 Zfp597-201ENSMUST00000090522 5668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cldn9Q9Z0S7 Grpel2-201ENSMUST00000062991 4030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cldn9Q9Z0S7 Hbs1l-201ENSMUST00000020153 2793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cldn9Q9Z0S7 Zfp280d-205ENSMUST00000183468 1834 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cldn9Q9Z0S7 Gm22323-201ENSMUST00000103832 109 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Cldn9Q9Z0S7 Ufc1-202ENSMUST00000111302 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cldn9Q9Z0S7 Mogat1-202ENSMUST00000113524 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cldn9Q9Z0S7 Gm13665-201ENSMUST00000120830 528 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Cldn9Q9Z0S7 Pdlim2-205ENSMUST00000129174 729 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cldn9Q9Z0S7 Mrps24-205ENSMUST00000154330 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cldn9Q9Z0S7 Mir1938-201ENSMUST00000158746 100 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Cldn9Q9Z0S7 Armc2-208ENSMUST00000162405 1135 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cldn9Q9Z0S7 Gm20636-201ENSMUST00000176660 707 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cldn9Q9Z0S7 S100a3-205ENSMUST00000200508 587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cldn9Q9Z0S7 Olfr1415-203ENSMUST00000204766 403 ntTSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cldn9Q9Z0S7 Mt2-202ENSMUST00000212806 388 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cldn9Q9Z0S7 1700008C04Rik-201ENSMUST00000218606 797 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cldn9Q9Z0S7 Odf4-201ENSMUST00000038932 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cldn9Q9Z0S7 Cldn17-201ENSMUST00000069549 1172 ntAPPRIS P1 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cldn9Q9Z0S7 Zscan29-201ENSMUST00000079024 2465 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cldn9Q9Z0S7 Hk3-202ENSMUST00000123097 2896 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cldn9Q9Z0S7 Rgr-203ENSMUST00000225070 4704 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Cldn9Q9Z0S7 Tex45-203ENSMUST00000161680 1526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cldn9Q9Z0S7 Gm45776-201ENSMUST00000212366 1522 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Cldn9Q9Z0S7 Serpina1b-203ENSMUST00000186166 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cldn9Q9Z0S7 Gm28719-201ENSMUST00000187779 1757 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.1 ms