Protein–RNA interactions for Protein: Q9WUZ7

Sh3bgr, SH3 domain-binding glutamic acid-rich protein, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bgrQ9WUZ7 H2-T10-202ENSMUST00000174382 1699 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sh3bgrQ9WUZ7 Tgfbr1-201ENSMUST00000007757 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sh3bgrQ9WUZ7 Herc3-201ENSMUST00000031823 3596 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sh3bgrQ9WUZ7 Cxcr5-202ENSMUST00000179828 2824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sh3bgrQ9WUZ7 Adh6a-202ENSMUST00000106247 1341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sh3bgrQ9WUZ7 Fam110b-201ENSMUST00000054857 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sh3bgrQ9WUZ7 Scn10a-202ENSMUST00000213392 6692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sh3bgrQ9WUZ7 Poc5-201ENSMUST00000099295 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sh3bgrQ9WUZ7 Gtf2i-224ENSMUST00000174772 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sh3bgrQ9WUZ7 Cd2bp2-207ENSMUST00000206026 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sh3bgrQ9WUZ7 Zfp629-201ENSMUST00000058038 6120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sh3bgrQ9WUZ7 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sh3bgrQ9WUZ7 Gm18626-201ENSMUST00000221512 1409 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Sh3bgrQ9WUZ7 Gm10277-201ENSMUST00000092883 2295 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sh3bgrQ9WUZ7 Nt5dc2-206ENSMUST00000227794 1858 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sh3bgrQ9WUZ7 Nnt-201ENSMUST00000069902 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sh3bgrQ9WUZ7 Pnck-203ENSMUST00000114473 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sh3bgrQ9WUZ7 AC167022.1-201ENSMUST00000218647 1458 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Sh3bgrQ9WUZ7 Eef2k-201ENSMUST00000047875 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sh3bgrQ9WUZ7 Auts2-209ENSMUST00000161804 5392 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sh3bgrQ9WUZ7 Tax1bp1-201ENSMUST00000080723 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sh3bgrQ9WUZ7 Sdr9c7-201ENSMUST00000047134 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sh3bgrQ9WUZ7 Miga2-201ENSMUST00000077977 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sh3bgrQ9WUZ7 Gm37969-201ENSMUST00000195777 3409 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Sh3bgrQ9WUZ7 Spop-201ENSMUST00000107722 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sh3bgrQ9WUZ7 Nnt-203ENSMUST00000109204 3198 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sh3bgrQ9WUZ7 Taz-204ENSMUST00000124200 1742 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sh3bgrQ9WUZ7 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sh3bgrQ9WUZ7 Mymx-201ENSMUST00000113529 442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sh3bgrQ9WUZ7 Mia-202ENSMUST00000121848 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sh3bgrQ9WUZ7 4930515B02Rik-201ENSMUST00000140588 591 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sh3bgrQ9WUZ7 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sh3bgrQ9WUZ7 Egfl7-211ENSMUST00000152988 723 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sh3bgrQ9WUZ7 Gm38241-201ENSMUST00000192641 898 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Sh3bgrQ9WUZ7 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sh3bgrQ9WUZ7 1700011B04Rik-203ENSMUST00000220654 1033 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sh3bgrQ9WUZ7 1700011B04Rik-209ENSMUST00000221760 779 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sh3bgrQ9WUZ7 Mrto4-201ENSMUST00000030513 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sh3bgrQ9WUZ7 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Sh3bgrQ9WUZ7 Gm37931-201ENSMUST00000194686 2866 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Sh3bgrQ9WUZ7 Col20a1-201ENSMUST00000108856 4489 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sh3bgrQ9WUZ7 Spice1-201ENSMUST00000050897 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sh3bgrQ9WUZ7 F10-201ENSMUST00000033821 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sh3bgrQ9WUZ7 Kcnk18-201ENSMUST00000065204 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sh3bgrQ9WUZ7 Dnajc5-203ENSMUST00000108797 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sh3bgrQ9WUZ7 Lats2-207ENSMUST00000173990 3834 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sh3bgrQ9WUZ7 Dnmt3l-202ENSMUST00000123940 1452 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sh3bgrQ9WUZ7 Tex45-203ENSMUST00000161680 1526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sh3bgrQ9WUZ7 Neurog3-201ENSMUST00000050103 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sh3bgrQ9WUZ7 Cep97-203ENSMUST00000118500 3389 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sh3bgrQ9WUZ7 Nefl-201ENSMUST00000022639 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sh3bgrQ9WUZ7 Srsf5-205ENSMUST00000110356 1568 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sh3bgrQ9WUZ7 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Sh3bgrQ9WUZ7 Pom121l2-201ENSMUST00000017126 2960 ntAPPRIS P4 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sh3bgrQ9WUZ7 Ndufs4-201ENSMUST00000022286 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sh3bgrQ9WUZ7 Abca3-202ENSMUST00000079594 6380 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sh3bgrQ9WUZ7 Rbm4b-201ENSMUST00000036744 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sh3bgrQ9WUZ7 Hdac7-205ENSMUST00000118294 4069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sh3bgrQ9WUZ7 Ces3b-201ENSMUST00000074403 1907 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sh3bgrQ9WUZ7 Akap5-203ENSMUST00000172992 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sh3bgrQ9WUZ7 Upk3b-201ENSMUST00000062606 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sh3bgrQ9WUZ7 Pkp4-201ENSMUST00000037903 4378 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sh3bgrQ9WUZ7 Scpep1-201ENSMUST00000000287 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sh3bgrQ9WUZ7 Sel1l-201ENSMUST00000021347 6300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sh3bgrQ9WUZ7 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sh3bgrQ9WUZ7 Tmsb10-201ENSMUST00000114048 623 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sh3bgrQ9WUZ7 Rhox2c-201ENSMUST00000115190 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
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Sh3bgrQ9WUZ7 Atp6v0e-201ENSMUST00000015719 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sh3bgrQ9WUZ7 Klk11-202ENSMUST00000171458 1260 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sh3bgrQ9WUZ7 Msra-205ENSMUST00000210428 1180 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sh3bgrQ9WUZ7 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Sh3bgrQ9WUZ7 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sh3bgrQ9WUZ7 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sh3bgrQ9WUZ7 Asb8-201ENSMUST00000059112 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sh3bgrQ9WUZ7 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Sh3bgrQ9WUZ7 Bcl2l14-201ENSMUST00000032321 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sh3bgrQ9WUZ7 Immt-202ENSMUST00000101301 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sh3bgrQ9WUZ7 Gabrr1-201ENSMUST00000029947 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sh3bgrQ9WUZ7 Gm43102-201ENSMUST00000201004 2324 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Sh3bgrQ9WUZ7 Svopl-202ENSMUST00000096040 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sh3bgrQ9WUZ7 Telo2-201ENSMUST00000024987 3434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sh3bgrQ9WUZ7 Grin2b-205ENSMUST00000152012 2461 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sh3bgrQ9WUZ7 Zmiz1-208ENSMUST00000162645 7482 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sh3bgrQ9WUZ7 Gper1-201ENSMUST00000066211 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sh3bgrQ9WUZ7 2310043M15Rik-201ENSMUST00000180967 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sh3bgrQ9WUZ7 Myo7a-201ENSMUST00000084979 6849 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sh3bgrQ9WUZ7 Gpr161-201ENSMUST00000111450 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sh3bgrQ9WUZ7 Scml2-206ENSMUST00000112345 4847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sh3bgrQ9WUZ7 Stom-201ENSMUST00000028241 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sh3bgrQ9WUZ7 Nuak2-201ENSMUST00000072177 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sh3bgrQ9WUZ7 Alms1-ps1-201ENSMUST00000159498 2166 ntBASIC13.52□□□□□ -0.24
Sh3bgrQ9WUZ7 Myo18a-222ENSMUST00000168348 6582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Sh3bgrQ9WUZ7 Ldb3-204ENSMUST00000064098 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Sh3bgrQ9WUZ7 3830432H09Rik-202ENSMUST00000188909 2414 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Sh3bgrQ9WUZ7 Gm14169-201ENSMUST00000124676 2519 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Sh3bgrQ9WUZ7 Tcof1-204ENSMUST00000176630 4529 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Sh3bgrQ9WUZ7 Zfyve26-203ENSMUST00000218377 2726 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
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