Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZF2

Gpc1, Glypican-1, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpc1Q9QZF2 AC121567.1-201ENSMUST00000227213 842 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
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Gpc1Q9QZF2 Gfod2-201ENSMUST00000013294 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
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Gpc1Q9QZF2 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Gpc1Q9QZF2 Slc22a5-201ENSMUST00000019044 3062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Gpc1Q9QZF2 Lig1-201ENSMUST00000098814 3091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Gpc1Q9QZF2 Zfp536-201ENSMUST00000056338 4621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Gpc1Q9QZF2 Xpo1-201ENSMUST00000020538 5145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Gpc1Q9QZF2 Cyb561d1-201ENSMUST00000065664 4058 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Gpc1Q9QZF2 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Gpc1Q9QZF2 Apoc1-202ENSMUST00000108451 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Gpc1Q9QZF2 Rhox2c-201ENSMUST00000115190 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Gpc1Q9QZF2 Tex22-201ENSMUST00000012355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Gpc1Q9QZF2 4931428L18Rik-201ENSMUST00000127775 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
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Gpc1Q9QZF2 Etfbkmt-207ENSMUST00000147934 1092 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Gpc1Q9QZF2 Gm16555-201ENSMUST00000159971 1199 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
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Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.6 ms