Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESF1

Otof, Otoferlin, mousemouse

Predictions only

Length 1,997 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OtofQ9ESF1 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
OtofQ9ESF1 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
OtofQ9ESF1 Olfr667-202ENSMUST00000217177 2695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
OtofQ9ESF1 Traf3ip3-212ENSMUST00000192020 1854 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
OtofQ9ESF1 Tmem237-202ENSMUST00000094917 1869 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
OtofQ9ESF1 Gm37165-201ENSMUST00000193815 1463 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
OtofQ9ESF1 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
OtofQ9ESF1 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
OtofQ9ESF1 Oxr1-203ENSMUST00000090096 4515 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
OtofQ9ESF1 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
OtofQ9ESF1 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC11.71□□□□□ -0.54
OtofQ9ESF1 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
OtofQ9ESF1 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC11.71□□□□□ -0.54
OtofQ9ESF1 Pcdhga9-201ENSMUST00000091935 4724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
OtofQ9ESF1 A730020E08Rik-201ENSMUST00000180421 3387 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
OtofQ9ESF1 Cnot7-211ENSMUST00000149992 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
OtofQ9ESF1 Tubgcp2-201ENSMUST00000026547 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
OtofQ9ESF1 Cacna1g-208ENSMUST00000107790 8035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
OtofQ9ESF1 Ift22-205ENSMUST00000200157 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
OtofQ9ESF1 Polm-202ENSMUST00000109837 2697 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
OtofQ9ESF1 Egfl6-201ENSMUST00000000412 2704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
OtofQ9ESF1 AL732309.2-201ENSMUST00000228052 3210 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
OtofQ9ESF1 Abi1-204ENSMUST00000114544 2790 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
OtofQ9ESF1 Nudt6-203ENSMUST00000108117 879 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
OtofQ9ESF1 Gm14585-201ENSMUST00000120713 634 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
OtofQ9ESF1 Gm11675-201ENSMUST00000121873 832 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
OtofQ9ESF1 Gm13166-201ENSMUST00000123828 940 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
OtofQ9ESF1 Gm15507-201ENSMUST00000133523 592 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
OtofQ9ESF1 Gm13236-201ENSMUST00000153010 940 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
OtofQ9ESF1 Rwdd2a-202ENSMUST00000179212 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
OtofQ9ESF1 CT009546.1-201ENSMUST00000222573 1120 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
OtofQ9ESF1 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
OtofQ9ESF1 Alox5-202ENSMUST00000164547 1854 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
OtofQ9ESF1 Gm42890-202ENSMUST00000167642 2566 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
OtofQ9ESF1 Katnal2-207ENSMUST00000137354 1482 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
OtofQ9ESF1 Msh5-202ENSMUST00000097338 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
OtofQ9ESF1 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
OtofQ9ESF1 Mmp19-203ENSMUST00000219404 2236 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
OtofQ9ESF1 Gipc3-201ENSMUST00000045102 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
OtofQ9ESF1 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
OtofQ9ESF1 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
OtofQ9ESF1 Il13ra1-201ENSMUST00000033418 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
OtofQ9ESF1 Gm37600-201ENSMUST00000193764 3292 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
OtofQ9ESF1 6820426E19Rik-201ENSMUST00000204274 1970 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
OtofQ9ESF1 Lamp5-201ENSMUST00000057503 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
OtofQ9ESF1 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
OtofQ9ESF1 Tatdn3-203ENSMUST00000110891 1214 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
OtofQ9ESF1 Tatdn3-204ENSMUST00000110893 1242 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
OtofQ9ESF1 Selenot-ps-201ENSMUST00000119098 593 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
OtofQ9ESF1 Gm1848-201ENSMUST00000120711 789 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
OtofQ9ESF1 Sstr2-203ENSMUST00000146390 2143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
OtofQ9ESF1 Gm26047-201ENSMUST00000157308 113 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
OtofQ9ESF1 Spdye4a-202ENSMUST00000160502 1245 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
OtofQ9ESF1 Gm15978-201ENSMUST00000161043 738 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
OtofQ9ESF1 Tro-208ENSMUST00000164071 891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
OtofQ9ESF1 Gm7137-201ENSMUST00000180161 711 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
OtofQ9ESF1 Gm27232-201ENSMUST00000184373 597 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
OtofQ9ESF1 Gpx1-204ENSMUST00000193987 653 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
OtofQ9ESF1 Gm5100-201ENSMUST00000195631 589 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
OtofQ9ESF1 Gm26047-202ENSMUST00000198840 115 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
OtofQ9ESF1 Cabcoco1-201ENSMUST00000020103 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
OtofQ9ESF1 Cdipt-204ENSMUST00000206346 806 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
OtofQ9ESF1 Gm17825-201ENSMUST00000206836 794 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
OtofQ9ESF1 Gm45338-201ENSMUST00000209198 820 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
OtofQ9ESF1 Olfr567-ps1-201ENSMUST00000210349 857 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
OtofQ9ESF1 Scg5-201ENSMUST00000024005 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
OtofQ9ESF1 Fgfr1op-201ENSMUST00000024636 3077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
OtofQ9ESF1 Ino80c-203ENSMUST00000141489 2207 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
OtofQ9ESF1 Grsf1-202ENSMUST00000113234 2286 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
OtofQ9ESF1 Gm3765-201ENSMUST00000130985 1447 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
OtofQ9ESF1 Ceacam12-203ENSMUST00000108487 1495 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
OtofQ9ESF1 Patj-201ENSMUST00000030290 2495 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
OtofQ9ESF1 Acvrl1-205ENSMUST00000120754 3506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
OtofQ9ESF1 Trpm1-210ENSMUST00000205731 2575 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
OtofQ9ESF1 Sgk3-202ENSMUST00000166384 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
OtofQ9ESF1 Slc25a40-201ENSMUST00000066921 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
OtofQ9ESF1 Colgalt2-201ENSMUST00000044311 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
OtofQ9ESF1 Olfr1419-202ENSMUST00000213954 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
OtofQ9ESF1 Zbtb49-201ENSMUST00000094833 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
OtofQ9ESF1 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
OtofQ9ESF1 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
OtofQ9ESF1 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
OtofQ9ESF1 Zfp94-201ENSMUST00000032673 2529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
OtofQ9ESF1 4930430F08Rik-201ENSMUST00000054471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
OtofQ9ESF1 Fgd2-201ENSMUST00000024810 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
OtofQ9ESF1 St6galnac4-204ENSMUST00000179989 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
OtofQ9ESF1 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
OtofQ9ESF1 Upk3b-201ENSMUST00000062606 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
OtofQ9ESF1 Ralyl-202ENSMUST00000108373 267 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
OtofQ9ESF1 Cetn2-203ENSMUST00000114551 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
OtofQ9ESF1 Gm11211-201ENSMUST00000143618 359 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
OtofQ9ESF1 4930538E20Rik-202ENSMUST00000146717 497 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
OtofQ9ESF1 Gm17798-201ENSMUST00000182282 1035 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
OtofQ9ESF1 Gm43058-201ENSMUST00000197645 625 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
OtofQ9ESF1 Gm42657-201ENSMUST00000201746 211 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
OtofQ9ESF1 Olfr1415-203ENSMUST00000204766 403 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
OtofQ9ESF1 Gm3793-201ENSMUST00000204973 672 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
OtofQ9ESF1 AC027700.1-201ENSMUST00000213965 370 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
OtofQ9ESF1 Gm18856-203ENSMUST00000222015 483 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
OtofQ9ESF1 Lgi3-203ENSMUST00000226548 1001 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
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