Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8T7

Slirp, SRA stem-loop-interacting RNA-binding protein, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 112 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SlirpQ9D8T7 Cops7a-202ENSMUST00000112439 1328 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SlirpQ9D8T7 Als2cl-206ENSMUST00000155014 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SlirpQ9D8T7 Apbb1-201ENSMUST00000081165 2530 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
SlirpQ9D8T7 Myo16-201ENSMUST00000042103 6725 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
SlirpQ9D8T7 Twnk-201ENSMUST00000026227 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SlirpQ9D8T7 Hk3-202ENSMUST00000123097 2896 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SlirpQ9D8T7 Aknad1-202ENSMUST00000133931 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SlirpQ9D8T7 Dgkz-203ENSMUST00000111303 4169 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SlirpQ9D8T7 Nlrx1-202ENSMUST00000168499 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SlirpQ9D8T7 Gm8038-201ENSMUST00000164674 2044 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
SlirpQ9D8T7 Cd40-201ENSMUST00000017799 2986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SlirpQ9D8T7 A430108G06Rik-201ENSMUST00000153461 1428 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SlirpQ9D8T7 Bcar3-201ENSMUST00000029766 3311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SlirpQ9D8T7 Clcnkb-201ENSMUST00000006378 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SlirpQ9D8T7 Serpina11-201ENSMUST00000074693 1447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SlirpQ9D8T7 AC164441.2-201ENSMUST00000220818 2746 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SlirpQ9D8T7 Fen1-202ENSMUST00000116542 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SlirpQ9D8T7 Gm10787-201ENSMUST00000099552 1548 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
SlirpQ9D8T7 Oraov1-204ENSMUST00000128057 2231 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SlirpQ9D8T7 Arhgef28-201ENSMUST00000109426 5387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SlirpQ9D8T7 Lef1-204ENSMUST00000106341 3357 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SlirpQ9D8T7 Mcm8-202ENSMUST00000066559 3397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SlirpQ9D8T7 Lef1-202ENSMUST00000066849 3398 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
SlirpQ9D8T7 Prrt3-204ENSMUST00000205075 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
SlirpQ9D8T7 Plekhn1-203ENSMUST00000217885 1982 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
SlirpQ9D8T7 Ift20-202ENSMUST00000108275 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SlirpQ9D8T7 Gm10714-201ENSMUST00000131346 874 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
SlirpQ9D8T7 Tmem74bos-201ENSMUST00000137422 390 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
SlirpQ9D8T7 Gm17040-202ENSMUST00000170597 889 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
SlirpQ9D8T7 Mob2-203ENSMUST00000209732 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
SlirpQ9D8T7 Abhd14b-210ENSMUST00000217496 631 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
SlirpQ9D8T7 CT025694.1-201ENSMUST00000226188 934 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
SlirpQ9D8T7 Olfr887-201ENSMUST00000074681 930 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
SlirpQ9D8T7 Eef1d-203ENSMUST00000089680 973 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SlirpQ9D8T7 Nek4-201ENSMUST00000050171 2793 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SlirpQ9D8T7 Arhgap1-202ENSMUST00000111329 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SlirpQ9D8T7 Gm26584-201ENSMUST00000180551 3216 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
SlirpQ9D8T7 Slurp1-202ENSMUST00000190433 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SlirpQ9D8T7 Cdc25a-204ENSMUST00000198308 2880 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SlirpQ9D8T7 Adgre5-208ENSMUST00000166939 2980 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SlirpQ9D8T7 Adgre5-201ENSMUST00000002964 2986 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SlirpQ9D8T7 Adora1-203ENSMUST00000169927 4581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
SlirpQ9D8T7 Gm26735-201ENSMUST00000180992 2649 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
SlirpQ9D8T7 Adamtsl3-204ENSMUST00000173828 2292 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
SlirpQ9D8T7 Gsdma-201ENSMUST00000017348 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SlirpQ9D8T7 Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 6941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SlirpQ9D8T7 Gucy2e-203ENSMUST00000108665 3645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
SlirpQ9D8T7 Actb-201ENSMUST00000100497 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SlirpQ9D8T7 Tardbp-204ENSMUST00000105699 1904 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SlirpQ9D8T7 Usp3-211ENSMUST00000174387 1901 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
SlirpQ9D8T7 Gfm1-201ENSMUST00000077271 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SlirpQ9D8T7 Tfr2-204ENSMUST00000196471 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SlirpQ9D8T7 Sirt2-209ENSMUST00000170068 1585 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
SlirpQ9D8T7 Kifap3-201ENSMUST00000027877 3946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SlirpQ9D8T7 Rgma-202ENSMUST00000119206 3481 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SlirpQ9D8T7 Qrich1-202ENSMUST00000112155 3040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SlirpQ9D8T7 Cdip1-203ENSMUST00000118703 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SlirpQ9D8T7 Ndufs4-201ENSMUST00000022286 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SlirpQ9D8T7 Lman1l-202ENSMUST00000093832 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SlirpQ9D8T7 Snap23-201ENSMUST00000028743 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SlirpQ9D8T7 Gm28719-201ENSMUST00000187779 1757 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
SlirpQ9D8T7 Rtbdn-204ENSMUST00000152378 2322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SlirpQ9D8T7 Crkl-201ENSMUST00000006293 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SlirpQ9D8T7 Atl3-202ENSMUST00000170373 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
SlirpQ9D8T7 Mfsd4a-207ENSMUST00000159038 1957 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
SlirpQ9D8T7 Wdr31-201ENSMUST00000030087 1440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SlirpQ9D8T7 Rdh8-201ENSMUST00000066387 1405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
SlirpQ9D8T7 Vps16-201ENSMUST00000028900 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SlirpQ9D8T7 Satb1-208ENSMUST00000144331 6243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SlirpQ9D8T7 Vsx2-201ENSMUST00000021665 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SlirpQ9D8T7 Nynrin-201ENSMUST00000100529 6990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SlirpQ9D8T7 Ccdc159-202ENSMUST00000170304 1519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SlirpQ9D8T7 Nsf-202ENSMUST00000103075 3766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SlirpQ9D8T7 Zfp423-201ENSMUST00000052250 4510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SlirpQ9D8T7 Rit2-203ENSMUST00000153060 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SlirpQ9D8T7 Ap1g2-211ENSMUST00000170285 2596 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
SlirpQ9D8T7 Rgs3-205ENSMUST00000107424 4084 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SlirpQ9D8T7 Vamp1-201ENSMUST00000032487 2772 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SlirpQ9D8T7 Sel1l-210ENSMUST00000178462 6150 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
SlirpQ9D8T7 AC160411.1-201ENSMUST00000218544 4560 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SlirpQ9D8T7 Stab1-201ENSMUST00000036618 7999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SlirpQ9D8T7 Rpl36-ps10-201ENSMUST00000117431 216 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
SlirpQ9D8T7 Gm15711-201ENSMUST00000118889 535 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
SlirpQ9D8T7 Gm12380-201ENSMUST00000119012 544 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
SlirpQ9D8T7 Gm16481-201ENSMUST00000119074 1227 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
SlirpQ9D8T7 BC026585-202ENSMUST00000119891 1125 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SlirpQ9D8T7 Gm15610-201ENSMUST00000120584 195 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
SlirpQ9D8T7 Tnni2-206ENSMUST00000149529 768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
SlirpQ9D8T7 Prox2os-201ENSMUST00000177043 1133 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SlirpQ9D8T7 Tnnt1-213ENSMUST00000178163 934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
SlirpQ9D8T7 Gm20033-203ENSMUST00000180912 796 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
SlirpQ9D8T7 Zfp229-206ENSMUST00000183192 653 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SlirpQ9D8T7 1110008E08Rik-202ENSMUST00000183621 723 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
SlirpQ9D8T7 Mir6927-201ENSMUST00000184494 71 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
SlirpQ9D8T7 Ip6k2-202ENSMUST00000192028 1199 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SlirpQ9D8T7 Gm7003-201ENSMUST00000195089 312 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
SlirpQ9D8T7 Gm43184-201ENSMUST00000197247 542 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
SlirpQ9D8T7 Gm8956-201ENSMUST00000203939 825 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
SlirpQ9D8T7 Gm4607-201ENSMUST00000206649 577 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
SlirpQ9D8T7 Prr15l-202ENSMUST00000062172 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.3 ms