Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2R4

Tmed11, Transmembrane emp24 domain-containing protein 11, mousemouse

Predictions only

Length 215 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed11Q9D2R4 Rad51b-202ENSMUST00000171210 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Tmed11Q9D2R4 Gm21136-201ENSMUST00000186812 2575 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Tmed11Q9D2R4 Gm6605-201ENSMUST00000031488 2574 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Tmed11Q9D2R4 Tdrd3-202ENSMUST00000168275 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Tmed11Q9D2R4 Ctnnal1-201ENSMUST00000045142 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Tmed11Q9D2R4 Scn9a-201ENSMUST00000100063 9813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Tmed11Q9D2R4 Scn9a-202ENSMUST00000100064 9840 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Tmed11Q9D2R4 Ank3-204ENSMUST00000092432 5832 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Tmed11Q9D2R4 Esco1-201ENSMUST00000025142 4433 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Tmed11Q9D2R4 Myo15b-201ENSMUST00000040703 2825 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Tmed11Q9D2R4 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Tmed11Q9D2R4 Os9-202ENSMUST00000164259 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Tmed11Q9D2R4 Poc1a-201ENSMUST00000072206 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Tmed11Q9D2R4 Pex3-201ENSMUST00000019945 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Tmed11Q9D2R4 Pdcd1-201ENSMUST00000027507 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Tmed11Q9D2R4 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Tmed11Q9D2R4 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Tmed11Q9D2R4 Thrap3-201ENSMUST00000080919 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Tmed11Q9D2R4 Dlgap4-201ENSMUST00000000094 1411 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Tmed11Q9D2R4 Cacna1c-226ENSMUST00000219833 7591 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.67
Tmed11Q9D2R4 Ctcfl-202ENSMUST00000179693 3174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Tmed11Q9D2R4 Arid2-201ENSMUST00000096250 8507 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Tmed11Q9D2R4 Zfp384-205ENSMUST00000112424 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Tmed11Q9D2R4 Dao-202ENSMUST00000112292 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Tmed11Q9D2R4 Mamld1-201ENSMUST00000082088 4796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Tmed11Q9D2R4 Tacc2-217ENSMUST00000209108 3310 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Tmed11Q9D2R4 Atad5-202ENSMUST00000108239 7266 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Tmed11Q9D2R4 Rasal1-201ENSMUST00000031606 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Tmed11Q9D2R4 Tcn2-201ENSMUST00000020710 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Tmed11Q9D2R4 Fcrl1-203ENSMUST00000167200 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Tmed11Q9D2R4 Apc-203ENSMUST00000115781 12346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Tmed11Q9D2R4 Gm44929-202ENSMUST00000209134 1653 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Tmed11Q9D2R4 4930423D22Rik-201ENSMUST00000221909 1674 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Tmed11Q9D2R4 Ablim1-210ENSMUST00000111550 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Tmed11Q9D2R4 Gm14608-201ENSMUST00000120030 1553 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Tmed11Q9D2R4 Art3-206ENSMUST00000120416 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Tmed11Q9D2R4 Tie1-203ENSMUST00000184261 4234 ntTSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Tmed11Q9D2R4 Gm10646-201ENSMUST00000213227 3293 ntTSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Tmed11Q9D2R4 Foxn2-201ENSMUST00000112238 5085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Tmed11Q9D2R4 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Tmed11Q9D2R4 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Tmed11Q9D2R4 Rai2-201ENSMUST00000061514 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
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Tmed11Q9D2R4 Sumo3-206ENSMUST00000141228 772 ntTSL 3 BASIC10.83□□□□□ -0.68
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Tmed11Q9D2R4 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
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Tmed11Q9D2R4 Gm5741-201ENSMUST00000177563 328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
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Tmed11Q9D2R4 Lats2-202ENSMUST00000038381 933 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Tmed11Q9D2R4 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Tmed11Q9D2R4 Treh-201ENSMUST00000034609 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Tmed11Q9D2R4 Phactr1-201ENSMUST00000066928 2013 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Tmed11Q9D2R4 Lysmd4-202ENSMUST00000179106 3319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Tmed11Q9D2R4 Rnf41-201ENSMUST00000096386 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Tmed11Q9D2R4 Aldoc-202ENSMUST00000102478 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Tmed11Q9D2R4 H2-T24-201ENSMUST00000113760 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Tmed11Q9D2R4 Adck1-202ENSMUST00000166940 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Tmed11Q9D2R4 Cyp2t4-202ENSMUST00000164093 1512 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
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Tmed11Q9D2R4 Fntb-201ENSMUST00000041008 2613 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Tmed11Q9D2R4 Arhgap11a-202ENSMUST00000110947 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Tmed11Q9D2R4 Jade1-201ENSMUST00000026865 5481 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Tmed11Q9D2R4 Fyb2-202ENSMUST00000106804 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Tmed11Q9D2R4 Rad1-202ENSMUST00000100775 4085 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Tmed11Q9D2R4 Vipas39-203ENSMUST00000179379 2418 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Tmed11Q9D2R4 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Tmed11Q9D2R4 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Tmed11Q9D2R4 Map4-206ENSMUST00000169851 3446 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Tmed11Q9D2R4 Prrx1-201ENSMUST00000027878 4952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Tmed11Q9D2R4 Mtmr11-201ENSMUST00000054356 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Tmed11Q9D2R4 Ikzf4-203ENSMUST00000221150 2213 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Tmed11Q9D2R4 Tesk2-201ENSMUST00000045542 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Tmed11Q9D2R4 Chrnb2-203ENSMUST00000200558 3482 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Tmed11Q9D2R4 Limd1-201ENSMUST00000026269 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Tmed11Q9D2R4 Olfr1490-202ENSMUST00000213900 5165 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Tmed11Q9D2R4 Mindy4-201ENSMUST00000053094 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Tmed11Q9D2R4 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Tmed11Q9D2R4 Sept11-201ENSMUST00000074733 5028 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Tmed11Q9D2R4 Suclg2-201ENSMUST00000079847 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Tmed11Q9D2R4 Smpd4-206ENSMUST00000163997 1722 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Tmed11Q9D2R4 Gm5441-201ENSMUST00000186454 5181 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Tmed11Q9D2R4 Jmjd4-202ENSMUST00000108777 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Tmed11Q9D2R4 Sp140-201ENSMUST00000080204 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Tmed11Q9D2R4 Arhgef7-203ENSMUST00000098938 4628 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Tmed11Q9D2R4 Nnt-201ENSMUST00000069902 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Tmed11Q9D2R4 Ighv2-9-201ENSMUST00000103451 362 ntAPPRIS P1 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Tmed11Q9D2R4 Derl2-202ENSMUST00000108523 884 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Tmed11Q9D2R4 Gm14921-201ENSMUST00000118643 908 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Tmed11Q9D2R4 Gm11637-201ENSMUST00000120601 592 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Tmed11Q9D2R4 Gm16479-201ENSMUST00000121706 932 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.9 ms