Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0D5

Gtf2e1, General transcription factor IIE subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2e1Q9D0D5 Scd2-201ENSMUST00000026221 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gtf2e1Q9D0D5 Psmd9-201ENSMUST00000100729 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gtf2e1Q9D0D5 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gtf2e1Q9D0D5 Rps9-203ENSMUST00000108624 478 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gtf2e1Q9D0D5 Agbl3-201ENSMUST00000115009 806 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gtf2e1Q9D0D5 Gm11451-201ENSMUST00000118946 630 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Gtf2e1Q9D0D5 Gm14942-201ENSMUST00000119642 336 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Gtf2e1Q9D0D5 Gm15856-201ENSMUST00000124853 1162 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gtf2e1Q9D0D5 Smim5-202ENSMUST00000142089 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gtf2e1Q9D0D5 4930471C06Rik-202ENSMUST00000143070 579 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gtf2e1Q9D0D5 Gm37981-201ENSMUST00000194280 535 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Gtf2e1Q9D0D5 Gm44329-201ENSMUST00000197469 112 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Gtf2e1Q9D0D5 Chn2-212ENSMUST00000204115 783 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gtf2e1Q9D0D5 Gm8342-201ENSMUST00000209839 757 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Gtf2e1Q9D0D5 Colca2-202ENSMUST00000215038 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gtf2e1Q9D0D5 AC154257.1-202ENSMUST00000224729 843 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Gtf2e1Q9D0D5 Ccdc28b-201ENSMUST00000030586 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gtf2e1Q9D0D5 BC004004-203ENSMUST00000149405 1402 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gtf2e1Q9D0D5 Tssk4-201ENSMUST00000007735 1420 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gtf2e1Q9D0D5 Sv2b-202ENSMUST00000165175 5524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gtf2e1Q9D0D5 Lrrc3-201ENSMUST00000057608 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gtf2e1Q9D0D5 H2-Q1-202ENSMUST00000105041 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gtf2e1Q9D0D5 Lcp2-202ENSMUST00000109329 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gtf2e1Q9D0D5 H2afv-202ENSMUST00000109737 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gtf2e1Q9D0D5 Jpt2-201ENSMUST00000024981 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gtf2e1Q9D0D5 Abca7-203ENSMUST00000171637 6638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gtf2e1Q9D0D5 Akr1b10-202ENSMUST00000115051 1022 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gtf2e1Q9D0D5 Mrps17-204ENSMUST00000119604 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gtf2e1Q9D0D5 Psma1-203ENSMUST00000135570 960 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gtf2e1Q9D0D5 4930583K01Rik-201ENSMUST00000138180 925 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gtf2e1Q9D0D5 Siglech-205ENSMUST00000165045 1062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gtf2e1Q9D0D5 Gm10320-201ENSMUST00000170205 527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gtf2e1Q9D0D5 Tmem40-206ENSMUST00000170625 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gtf2e1Q9D0D5 Nlrp5-ps-202ENSMUST00000173220 1294 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Gtf2e1Q9D0D5 Gm33201-201ENSMUST00000204791 855 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gtf2e1Q9D0D5 Gm45219-201ENSMUST00000205602 465 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Gtf2e1Q9D0D5 Polb-201ENSMUST00000033938 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gtf2e1Q9D0D5 Rpl15-201ENSMUST00000079419 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gtf2e1Q9D0D5 Gm10775-201ENSMUST00000099425 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gtf2e1Q9D0D5 Th-202ENSMUST00000105929 1950 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gtf2e1Q9D0D5 Elf1-201ENSMUST00000040131 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gtf2e1Q9D0D5 Tcf4-210ENSMUST00000128706 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gtf2e1Q9D0D5 Adcyap1-201ENSMUST00000064775 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gtf2e1Q9D0D5 Nrg1-206ENSMUST00000208205 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gtf2e1Q9D0D5 Herc3-201ENSMUST00000031823 3596 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gtf2e1Q9D0D5 CT009757.3-201ENSMUST00000223367 2320 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Gtf2e1Q9D0D5 Abhd14b-207ENSMUST00000213179 1627 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gtf2e1Q9D0D5 5033428I22Rik-201ENSMUST00000181638 2040 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gtf2e1Q9D0D5 Ttll12-201ENSMUST00000016901 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gtf2e1Q9D0D5 Tcea3-201ENSMUST00000102533 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gtf2e1Q9D0D5 Olfr22-ps1-201ENSMUST00000115991 1237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gtf2e1Q9D0D5 Gm12899-201ENSMUST00000120565 551 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Gtf2e1Q9D0D5 Cdpf1-205ENSMUST00000150995 566 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gtf2e1Q9D0D5 Tmem242-203ENSMUST00000188282 822 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gtf2e1Q9D0D5 Cbx3-ps8-201ENSMUST00000214564 548 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Gtf2e1Q9D0D5 AC165260.2-203ENSMUST00000224237 336 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Gtf2e1Q9D0D5 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gtf2e1Q9D0D5 Ntrk2-204ENSMUST00000224259 3049 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Gtf2e1Q9D0D5 Slc39a8-206ENSMUST00000180196 3383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gtf2e1Q9D0D5 Cyb5rl-201ENSMUST00000030364 2360 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gtf2e1Q9D0D5 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gtf2e1Q9D0D5 Oit3-201ENSMUST00000009798 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gtf2e1Q9D0D5 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gtf2e1Q9D0D5 Nxph2-201ENSMUST00000102945 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gtf2e1Q9D0D5 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gtf2e1Q9D0D5 Slc29a1-213ENSMUST00000167692 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gtf2e1Q9D0D5 Wnt16-202ENSMUST00000128245 3285 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gtf2e1Q9D0D5 Lyplal1-201ENSMUST00000045388 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gtf2e1Q9D0D5 G630016G05Rik-202ENSMUST00000156095 3398 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gtf2e1Q9D0D5 Cd55b-201ENSMUST00000112488 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gtf2e1Q9D0D5 Ccdc42os-201ENSMUST00000148019 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gtf2e1Q9D0D5 4933427G23Rik-201ENSMUST00000122963 2515 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gtf2e1Q9D0D5 Capn3-203ENSMUST00000090028 2640 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gtf2e1Q9D0D5 Clcn3-201ENSMUST00000004430 4175 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gtf2e1Q9D0D5 Dcaf10-204ENSMUST00000155551 7250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gtf2e1Q9D0D5 Rsrc1-206ENSMUST00000162036 1406 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gtf2e1Q9D0D5 Pnpla6-211ENSMUST00000207941 4263 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gtf2e1Q9D0D5 Ralgps2-207ENSMUST00000188656 2481 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gtf2e1Q9D0D5 Sept8-204ENSMUST00000121334 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gtf2e1Q9D0D5 Thtpa-201ENSMUST00000050575 2830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gtf2e1Q9D0D5 Bysl-201ENSMUST00000024783 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gtf2e1Q9D0D5 Srsf5-201ENSMUST00000094693 1527 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gtf2e1Q9D0D5 Tfcp2-201ENSMUST00000009877 3250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gtf2e1Q9D0D5 Armcx2-203ENSMUST00000119010 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gtf2e1Q9D0D5 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gtf2e1Q9D0D5 Gm12516-201ENSMUST00000120819 385 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Gtf2e1Q9D0D5 Gm11960-201ENSMUST00000122068 925 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Gtf2e1Q9D0D5 Gm14397-201ENSMUST00000124728 576 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gtf2e1Q9D0D5 B230119M05Rik-201ENSMUST00000154072 979 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gtf2e1Q9D0D5 Spdye4c-203ENSMUST00000178601 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gtf2e1Q9D0D5 Gm6408-201ENSMUST00000179032 1171 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gtf2e1Q9D0D5 Gm28262-201ENSMUST00000185463 477 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gtf2e1Q9D0D5 Gm19744-202ENSMUST00000186135 948 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gtf2e1Q9D0D5 Gm28215-201ENSMUST00000186146 346 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gtf2e1Q9D0D5 Gm34023-201ENSMUST00000195539 217 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Gtf2e1Q9D0D5 Abhd4-208ENSMUST00000199338 868 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gtf2e1Q9D0D5 6430531B16Rik-204ENSMUST00000209335 898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gtf2e1Q9D0D5 AC140293.1-201ENSMUST00000225626 1247 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Gtf2e1Q9D0D5 BC048507-201ENSMUST00000078471 600 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gtf2e1Q9D0D5 Rai1-202ENSMUST00000090806 7217 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.1 ms