Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWM4

Pfdn1, Prefoldin subunit 1, mousemouse

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Length 122 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pfdn1Q9CWM4 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Pfdn1Q9CWM4 St5-204ENSMUST00000168005 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Pfdn1Q9CWM4 Ntrk3-206ENSMUST00000195262 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Pfdn1Q9CWM4 Itgb8-201ENSMUST00000026360 8403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Pfdn1Q9CWM4 Scn4a-201ENSMUST00000021056 6598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Pfdn1Q9CWM4 Fyco1-201ENSMUST00000084715 7949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Pfdn1Q9CWM4 Ints10-201ENSMUST00000034328 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Pfdn1Q9CWM4 Ppp1r17-201ENSMUST00000052827 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Pfdn1Q9CWM4 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Pfdn1Q9CWM4 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Pfdn1Q9CWM4 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Pfdn1Q9CWM4 Prkaca-ps1-201ENSMUST00000120823 919 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Pfdn1Q9CWM4 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Pfdn1Q9CWM4 Prr13-204ENSMUST00000164957 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Pfdn1Q9CWM4 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Pfdn1Q9CWM4 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Pfdn1Q9CWM4 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Pfdn1Q9CWM4 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Pfdn1Q9CWM4 Fn3k-201ENSMUST00000026175 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Pfdn1Q9CWM4 Rab27a-201ENSMUST00000034722 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Pfdn1Q9CWM4 Arhgap45-202ENSMUST00000099501 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Pfdn1Q9CWM4 Cntn4-203ENSMUST00000113258 2464 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Pfdn1Q9CWM4 Mab21l1-201ENSMUST00000075422 2492 ntAPPRIS P1 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Pfdn1Q9CWM4 D630003M21Rik-202ENSMUST00000103121 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Pfdn1Q9CWM4 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Pfdn1Q9CWM4 Ciapin1-209ENSMUST00000162538 4359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Pfdn1Q9CWM4 Abhd6-203ENSMUST00000225234 1958 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Pfdn1Q9CWM4 Rreb1-207ENSMUST00000128570 8436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Pfdn1Q9CWM4 Olfr6-203ENSMUST00000213651 4457 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Pfdn1Q9CWM4 Kalrn-211ENSMUST00000114966 3857 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Pfdn1Q9CWM4 Poc1a-201ENSMUST00000072206 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Pfdn1Q9CWM4 Abhd18-201ENSMUST00000108077 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Pfdn1Q9CWM4 Ano1-202ENSMUST00000118556 4566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Pfdn1Q9CWM4 Lhx9-201ENSMUST00000019374 4937 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Pfdn1Q9CWM4 Nrg1-211ENSMUST00000208497 2096 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Pfdn1Q9CWM4 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Pfdn1Q9CWM4 N6amt1-204ENSMUST00000120284 3473 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Pfdn1Q9CWM4 Zbtb26-201ENSMUST00000067043 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Pfdn1Q9CWM4 Abcc4-201ENSMUST00000036554 5715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Pfdn1Q9CWM4 Oxct1-201ENSMUST00000110690 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Pfdn1Q9CWM4 Ptbp1-206ENSMUST00000165704 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Pfdn1Q9CWM4 Nmral1-203ENSMUST00000115851 1306 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Pfdn1Q9CWM4 Sh2d7-202ENSMUST00000118413 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Pfdn1Q9CWM4 Mybl1-202ENSMUST00000115468 2493 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Pfdn1Q9CWM4 AC115891.3-201ENSMUST00000219161 2472 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Pfdn1Q9CWM4 Pex3-201ENSMUST00000019945 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Pfdn1Q9CWM4 Gm38194-201ENSMUST00000194529 2211 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Pfdn1Q9CWM4 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Pfdn1Q9CWM4 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Pfdn1Q9CWM4 Saxo2-201ENSMUST00000056728 2783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Pfdn1Q9CWM4 Lyar-202ENSMUST00000114106 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Pfdn1Q9CWM4 A1cf-201ENSMUST00000075838 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Pfdn1Q9CWM4 Mettl17-201ENSMUST00000047899 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Pfdn1Q9CWM4 Togaram2-201ENSMUST00000097284 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Pfdn1Q9CWM4 Aldoc-202ENSMUST00000102478 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Pfdn1Q9CWM4 Ccdc93-201ENSMUST00000036025 7274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Pfdn1Q9CWM4 Dysf-204ENSMUST00000113821 6803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Pfdn1Q9CWM4 Arpc3-202ENSMUST00000102525 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Pfdn1Q9CWM4 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Pfdn1Q9CWM4 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Pfdn1Q9CWM4 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Pfdn1Q9CWM4 Gm16202-201ENSMUST00000117532 544 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Pfdn1Q9CWM4 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Pfdn1Q9CWM4 Gm14230-202ENSMUST00000137463 874 ntTSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Pfdn1Q9CWM4 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Pfdn1Q9CWM4 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Pfdn1Q9CWM4 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Pfdn1Q9CWM4 Cux1-211ENSMUST00000176745 2831 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Pfdn1Q9CWM4 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Pfdn1Q9CWM4 Grik1-201ENSMUST00000023652 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Pfdn1Q9CWM4 Casz1-201ENSMUST00000094464 4349 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Pfdn1Q9CWM4 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Pfdn1Q9CWM4 Rapgef4os2-201ENSMUST00000128165 2116 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Pfdn1Q9CWM4 Sema3b-203ENSMUST00000102530 3410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Pfdn1Q9CWM4 Olfr77-202ENSMUST00000217347 5980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Pfdn1Q9CWM4 Rnf2-201ENSMUST00000076110 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Pfdn1Q9CWM4 Dph6-203ENSMUST00000102542 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Pfdn1Q9CWM4 Ints6l-201ENSMUST00000039374 3766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Pfdn1Q9CWM4 Epb41l4a-201ENSMUST00000025234 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.75
Pfdn1Q9CWM4 Cfap61-204ENSMUST00000126415 2256 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Pfdn1Q9CWM4 Kcnj15-206ENSMUST00000113859 5046 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Pfdn1Q9CWM4 Mospd2-203ENSMUST00000112248 2487 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Pfdn1Q9CWM4 Gpat4-201ENSMUST00000167004 5518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Pfdn1Q9CWM4 Gm21964-203ENSMUST00000219454 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Pfdn1Q9CWM4 Smpd4-206ENSMUST00000163997 1722 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Pfdn1Q9CWM4 A830010M20Rik-208ENSMUST00000211896 5256 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Pfdn1Q9CWM4 Zmiz2-205ENSMUST00000109787 4116 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Pfdn1Q9CWM4 Zbtb43-203ENSMUST00000113156 1828 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Pfdn1Q9CWM4 Ccdc136-202ENSMUST00000115275 3279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Pfdn1Q9CWM4 Dqx1-201ENSMUST00000077502 3257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Pfdn1Q9CWM4 Ddr1-202ENSMUST00000097333 3593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Pfdn1Q9CWM4 Ces2h-201ENSMUST00000172032 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Pfdn1Q9CWM4 Ncbp3-201ENSMUST00000021135 12106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Pfdn1Q9CWM4 Olfr1349-207ENSMUST00000216447 2448 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Pfdn1Q9CWM4 Zfp957-201ENSMUST00000040802 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Pfdn1Q9CWM4 Ank3-242ENSMUST00000183261 4999 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Pfdn1Q9CWM4 Zfp280b-201ENSMUST00000061617 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Pfdn1Q9CWM4 Trmt2a-207ENSMUST00000140206 3520 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Pfdn1Q9CWM4 Thbd-201ENSMUST00000099270 3723 ntAPPRIS P1 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Pfdn1Q9CWM4 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
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