Protein–RNA interactions for Protein: Q99LH9

Sh3bp5l, SH3 domain-binding protein 5-like, mousemouse

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Length 392 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp5lQ99LH9 Chil1-201ENSMUST00000082060 1687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Sh3bp5lQ99LH9 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Sh3bp5lQ99LH9 Lsamp-208ENSMUST00000189358 2766 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Sh3bp5lQ99LH9 Brd4-202ENSMUST00000114475 2731 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Sh3bp5lQ99LH9 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Sh3bp5lQ99LH9 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Sh3bp5lQ99LH9 Ceacam12-203ENSMUST00000108487 1495 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Sh3bp5lQ99LH9 Kiss1r-201ENSMUST00000045529 3163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Sh3bp5lQ99LH9 Hist1h3d-201ENSMUST00000105105 1249 ntAPPRIS P1 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Sh3bp5lQ99LH9 Gm15374-201ENSMUST00000119313 844 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
Sh3bp5lQ99LH9 4631405J19Rik-204ENSMUST00000145926 936 ntTSL 3 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Sh3bp5lQ99LH9 Gm20420-201ENSMUST00000173178 639 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Sh3bp5lQ99LH9 Isl1-202ENSMUST00000176044 1198 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Sh3bp5lQ99LH9 1600010M07Rik-202ENSMUST00000188662 654 ntTSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Sh3bp5lQ99LH9 Myl6-211ENSMUST00000219236 692 ntTSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Sh3bp5lQ99LH9 AC136376.2-201ENSMUST00000228819 490 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
Sh3bp5lQ99LH9 Ndufb4-201ENSMUST00000023514 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Sh3bp5lQ99LH9 Scg5-201ENSMUST00000024005 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Sh3bp5lQ99LH9 Gm23680-201ENSMUST00000083162 164 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
Sh3bp5lQ99LH9 Gm4950-201ENSMUST00000091905 618 ntAPPRIS P1 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Sh3bp5lQ99LH9 Phyhipl-201ENSMUST00000046513 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Sh3bp5lQ99LH9 Dner-201ENSMUST00000049126 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Sh3bp5lQ99LH9 Tcf4-243ENSMUST00000202057 1941 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Sh3bp5lQ99LH9 Nt5dc2-206ENSMUST00000227794 1858 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Sh3bp5lQ99LH9 Gm10305-201ENSMUST00000195331 2475 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
Sh3bp5lQ99LH9 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Sh3bp5lQ99LH9 Coasy-202ENSMUST00000107308 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Sh3bp5lQ99LH9 Cln3-201ENSMUST00000032962 2386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Sh3bp5lQ99LH9 Mpv17-202ENSMUST00000200744 1653 ntTSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Sh3bp5lQ99LH9 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Sh3bp5lQ99LH9 Sh3kbp1-201ENSMUST00000073094 2280 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Sh3bp5lQ99LH9 Cnot10-201ENSMUST00000070117 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Sh3bp5lQ99LH9 Nrg1-206ENSMUST00000208205 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Sh3bp5lQ99LH9 Capn3-203ENSMUST00000090028 2640 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Sh3bp5lQ99LH9 Mmel1-204ENSMUST00000105635 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Sh3bp5lQ99LH9 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
Sh3bp5lQ99LH9 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Sh3bp5lQ99LH9 Fancc-217ENSMUST00000163091 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Sh3bp5lQ99LH9 4732414G09Rik-201ENSMUST00000156243 2422 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Sh3bp5lQ99LH9 Anxa8-201ENSMUST00000022519 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Sh3bp5lQ99LH9 Aurkc-203ENSMUST00000207711 1320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Sh3bp5lQ99LH9 Opcml-201ENSMUST00000073822 2378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Sh3bp5lQ99LH9 Gm8146-201ENSMUST00000192106 1847 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Sh3bp5lQ99LH9 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Sh3bp5lQ99LH9 Krtap4-6-201ENSMUST00000100476 918 ntAPPRIS P1 BASIC14□□□□□ -0.17
Sh3bp5lQ99LH9 Gm12247-201ENSMUST00000117585 670 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Sh3bp5lQ99LH9 Gm14395-201ENSMUST00000120494 563 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Sh3bp5lQ99LH9 Vps25-205ENSMUST00000121331 790 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
Sh3bp5lQ99LH9 Gm16001-201ENSMUST00000127989 875 ntTSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
Sh3bp5lQ99LH9 Lyzl4os-202ENSMUST00000156364 726 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Sh3bp5lQ99LH9 Slpi-202ENSMUST00000165980 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
Sh3bp5lQ99LH9 A430105J06Rik-201ENSMUST00000180869 1275 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Sh3bp5lQ99LH9 Vmn1r205-201ENSMUST00000185475 951 ntAPPRIS P1 BASIC14□□□□□ -0.17
Sh3bp5lQ99LH9 Gm19744-202ENSMUST00000186135 948 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Sh3bp5lQ99LH9 Pdcd5-ps-201ENSMUST00000191699 381 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Sh3bp5lQ99LH9 Gpx1-204ENSMUST00000193987 653 ntTSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
Sh3bp5lQ99LH9 Nutf2-202ENSMUST00000212042 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
Sh3bp5lQ99LH9 AC114645.1-201ENSMUST00000215831 187 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Sh3bp5lQ99LH9 Gm3619-201ENSMUST00000219947 775 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Sh3bp5lQ99LH9 Chmp3-202ENSMUST00000065364 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Sh3bp5lQ99LH9 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Sh3bp5lQ99LH9 Draxin-201ENSMUST00000030862 5200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Sh3bp5lQ99LH9 Otx2-202ENSMUST00000119070 1708 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Sh3bp5lQ99LH9 Herc3-201ENSMUST00000031823 3596 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Sh3bp5lQ99LH9 Sstr2-203ENSMUST00000146390 2143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Sh3bp5lQ99LH9 Orc5-201ENSMUST00000030872 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Sh3bp5lQ99LH9 Nicn1-201ENSMUST00000035227 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Sh3bp5lQ99LH9 Trpm1-210ENSMUST00000205731 2575 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Sh3bp5lQ99LH9 Slc9a3-204ENSMUST00000225423 2589 ntAPPRIS ALT2 BASIC14□□□□□ -0.17
Sh3bp5lQ99LH9 Slc38a6-206ENSMUST00000140523 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Sh3bp5lQ99LH9 Arid5a-204ENSMUST00000115032 4640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Sh3bp5lQ99LH9 Galnt9-202ENSMUST00000165856 1541 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Sh3bp5lQ99LH9 Pdlim2-201ENSMUST00000022681 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Sh3bp5lQ99LH9 Thtpa-201ENSMUST00000050575 2830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Sh3bp5lQ99LH9 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Sh3bp5lQ99LH9 Gm11413-201ENSMUST00000155822 1461 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Sh3bp5lQ99LH9 Arg1-201ENSMUST00000020161 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Sh3bp5lQ99LH9 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Sh3bp5lQ99LH9 Elk1-201ENSMUST00000009550 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Sh3bp5lQ99LH9 Fam60a-201ENSMUST00000054080 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Sh3bp5lQ99LH9 Rbak-202ENSMUST00000165318 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Sh3bp5lQ99LH9 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Sh3bp5lQ99LH9 Wnt7b-201ENSMUST00000023015 3371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Sh3bp5lQ99LH9 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Sh3bp5lQ99LH9 Uap1l1-201ENSMUST00000102925 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Sh3bp5lQ99LH9 Gm37600-201ENSMUST00000193764 3292 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Sh3bp5lQ99LH9 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Sh3bp5lQ99LH9 1200007C13Rik-201ENSMUST00000143649 2455 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Sh3bp5lQ99LH9 Trit1-201ENSMUST00000102649 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Sh3bp5lQ99LH9 5930412G12Rik-201ENSMUST00000091324 2403 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Sh3bp5lQ99LH9 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Sh3bp5lQ99LH9 Grin1-201ENSMUST00000028335 4238 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Sh3bp5lQ99LH9 Nudt6-203ENSMUST00000108117 879 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Sh3bp5lQ99LH9 Gm12990-201ENSMUST00000120372 468 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Sh3bp5lQ99LH9 Olfr269-ps1-201ENSMUST00000120783 302 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Sh3bp5lQ99LH9 Gm15549-201ENSMUST00000121595 622 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Sh3bp5lQ99LH9 Bach2it1-201ENSMUST00000133451 481 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Sh3bp5lQ99LH9 Gm21972-201ENSMUST00000135197 776 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Sh3bp5lQ99LH9 Cideb-201ENSMUST00000001497 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Sh3bp5lQ99LH9 Gm13703-201ENSMUST00000150705 449 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.1 ms