Protein–RNA interactions for Protein: Q99K10

Nlgn1, Neuroligin-1, mousemouse

Predictions only

Length 843 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlgn1Q99K10 Gm7082-201ENSMUST00000209880 969 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Nlgn1Q99K10 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nlgn1Q99K10 Tmc4-201ENSMUST00000038743 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nlgn1Q99K10 Chrd-201ENSMUST00000007171 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nlgn1Q99K10 Tarm1-203ENSMUST00000203821 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nlgn1Q99K10 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nlgn1Q99K10 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nlgn1Q99K10 Nubp2-201ENSMUST00000044252 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nlgn1Q99K10 Zfp809-201ENSMUST00000072465 1425 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nlgn1Q99K10 Limd2-201ENSMUST00000045923 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nlgn1Q99K10 Herc3-201ENSMUST00000031823 3596 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nlgn1Q99K10 Tuft1-201ENSMUST00000006123 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nlgn1Q99K10 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nlgn1Q99K10 Eno1-201ENSMUST00000080149 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nlgn1Q99K10 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nlgn1Q99K10 Zfp809-206ENSMUST00000215902 1800 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nlgn1Q99K10 Slc29a1-213ENSMUST00000167692 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nlgn1Q99K10 Trpm1-210ENSMUST00000205731 2575 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nlgn1Q99K10 Gm13814-201ENSMUST00000141341 3077 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nlgn1Q99K10 Tpra1-218ENSMUST00000203185 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nlgn1Q99K10 Gm1110-201ENSMUST00000115261 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nlgn1Q99K10 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nlgn1Q99K10 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nlgn1Q99K10 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nlgn1Q99K10 Col15a1-203ENSMUST00000107730 1755 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nlgn1Q99K10 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nlgn1Q99K10 Gm15528-201ENSMUST00000117821 864 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Nlgn1Q99K10 Gm6322-201ENSMUST00000118789 1004 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Nlgn1Q99K10 Gm16219-201ENSMUST00000120096 274 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Nlgn1Q99K10 Mrpl20-202ENSMUST00000130188 442 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nlgn1Q99K10 Gm15726-201ENSMUST00000144738 509 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nlgn1Q99K10 Vmn1r205-201ENSMUST00000185475 951 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nlgn1Q99K10 Gm29083-201ENSMUST00000189205 733 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nlgn1Q99K10 Mpv17-206ENSMUST00000201353 846 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nlgn1Q99K10 Fkbpl-201ENSMUST00000036720 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nlgn1Q99K10 Mnd1-201ENSMUST00000047368 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nlgn1Q99K10 Smg8-201ENSMUST00000020801 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nlgn1Q99K10 Mbnl2-208ENSMUST00000227594 2334 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nlgn1Q99K10 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nlgn1Q99K10 Drc1-201ENSMUST00000101448 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nlgn1Q99K10 Slc24a5-201ENSMUST00000070353 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nlgn1Q99K10 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nlgn1Q99K10 Slc25a22-203ENSMUST00000106007 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nlgn1Q99K10 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nlgn1Q99K10 Dlg4-203ENSMUST00000108588 3457 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nlgn1Q99K10 Gdap2-202ENSMUST00000106997 2014 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nlgn1Q99K10 Ces1d-201ENSMUST00000034172 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nlgn1Q99K10 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nlgn1Q99K10 Mpv17l-204ENSMUST00000141971 2155 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nlgn1Q99K10 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nlgn1Q99K10 Slc29a1-204ENSMUST00000163492 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nlgn1Q99K10 Trpv4-201ENSMUST00000071968 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nlgn1Q99K10 Gm8146-201ENSMUST00000192106 1847 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Nlgn1Q99K10 6820426E19Rik-201ENSMUST00000204274 1970 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nlgn1Q99K10 Cdc42se1-203ENSMUST00000107200 637 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nlgn1Q99K10 Uqcc1-202ENSMUST00000109631 1091 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nlgn1Q99K10 Gm9673-201ENSMUST00000119287 781 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Nlgn1Q99K10 Gm12274-201ENSMUST00000120062 385 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Nlgn1Q99K10 C1qtnf7-202ENSMUST00000121872 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nlgn1Q99K10 1700123M08Rik-202ENSMUST00000146154 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nlgn1Q99K10 Ndufc2-202ENSMUST00000149122 470 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nlgn1Q99K10 Gm14275-201ENSMUST00000152112 430 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nlgn1Q99K10 Gm45716-203ENSMUST00000153734 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nlgn1Q99K10 Gm22379-201ENSMUST00000157480 131 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Nlgn1Q99K10 Gm17709-201ENSMUST00000174536 1096 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Nlgn1Q99K10 Iqcf3-202ENSMUST00000186668 633 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nlgn1Q99K10 Gm43695-201ENSMUST00000196545 196 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nlgn1Q99K10 Gm42953-201ENSMUST00000199363 581 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nlgn1Q99K10 Gm43912-201ENSMUST00000204352 538 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Nlgn1Q99K10 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nlgn1Q99K10 Gm13556-201ENSMUST00000132692 1412 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nlgn1Q99K10 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nlgn1Q99K10 Xkr6-202ENSMUST00000120820 1702 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nlgn1Q99K10 5033428I22Rik-201ENSMUST00000181638 2040 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nlgn1Q99K10 Rnf133-202ENSMUST00000115354 1333 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nlgn1Q99K10 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nlgn1Q99K10 Wdr25-202ENSMUST00000167816 2657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nlgn1Q99K10 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nlgn1Q99K10 Cog6-201ENSMUST00000036665 3182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nlgn1Q99K10 Dync1i2-208ENSMUST00000112144 2565 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nlgn1Q99K10 Fut1-201ENSMUST00000008605 2580 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nlgn1Q99K10 Adamtsl3-204ENSMUST00000173828 2292 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nlgn1Q99K10 Rxfp3-201ENSMUST00000058007 4275 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nlgn1Q99K10 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nlgn1Q99K10 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nlgn1Q99K10 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Nlgn1Q99K10 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nlgn1Q99K10 Slc35a4-202ENSMUST00000050476 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nlgn1Q99K10 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nlgn1Q99K10 2900097C17Rik-202ENSMUST00000192863 4915 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Nlgn1Q99K10 Prkcd-204ENSMUST00000112206 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nlgn1Q99K10 Rpl23-201ENSMUST00000103146 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nlgn1Q99K10 Oprl1-204ENSMUST00000108767 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nlgn1Q99K10 Ice2-202ENSMUST00000117246 1201 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nlgn1Q99K10 Prr33-202ENSMUST00000151580 399 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nlgn1Q99K10 Dydc1-202ENSMUST00000161837 829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nlgn1Q99K10 Gm17192-201ENSMUST00000169031 511 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Nlgn1Q99K10 Gm20392-201ENSMUST00000173047 701 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Nlgn1Q99K10 1110059E24Rik-205ENSMUST00000178523 629 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nlgn1Q99K10 Gm21778-201ENSMUST00000178779 471 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms