Protein–RNA interactions for Protein: Q925F3

Rnf144a, E3 ubiquitin-protein ligase RNF144A, mousemouse

Predictions only

Length 292 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf144aQ925F3 Gm454-201ENSMUST00000160126 751 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Rnf144aQ925F3 1810008B01Rik-201ENSMUST00000162325 829 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Rnf144aQ925F3 2010110E17Rik-201ENSMUST00000184161 879 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Rnf144aQ925F3 Mir6927-201ENSMUST00000184494 71 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Rnf144aQ925F3 Gm29208-205ENSMUST00000214517 1056 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Rnf144aQ925F3 Abhd14b-210ENSMUST00000217496 631 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Rnf144aQ925F3 Abhd11os-203ENSMUST00000222613 363 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Rnf144aQ925F3 Tm2d3-201ENSMUST00000032726 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Rnf144aQ925F3 Rab13-201ENSMUST00000065418 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Rnf144aQ925F3 Elovl1-202ENSMUST00000067896 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Rnf144aQ925F3 Olfr887-201ENSMUST00000074681 930 ntAPPRIS P1 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Rnf144aQ925F3 Gm6994-201ENSMUST00000088880 1163 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Rnf144aQ925F3 Psap-201ENSMUST00000004316 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Rnf144aQ925F3 Actb-201ENSMUST00000100497 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Rnf144aQ925F3 D330041H03Rik-205ENSMUST00000181014 1903 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Rnf144aQ925F3 Rspo2-201ENSMUST00000063492 3338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Rnf144aQ925F3 Tspan32-201ENSMUST00000009396 1582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Rnf144aQ925F3 Camsap3-202ENSMUST00000171962 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Rnf144aQ925F3 Plcxd3-201ENSMUST00000061925 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Rnf144aQ925F3 Lyar-202ENSMUST00000114106 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Rnf144aQ925F3 Tbl1xr1-211ENSMUST00000202747 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Rnf144aQ925F3 Camsap3-209ENSMUST00000207970 3817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Rnf144aQ925F3 Abo-202ENSMUST00000114045 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Rnf144aQ925F3 Gm17767-201ENSMUST00000189410 1470 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Rnf144aQ925F3 Gm18983-201ENSMUST00000222884 2729 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Rnf144aQ925F3 Arfgap1-201ENSMUST00000029092 2714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Rnf144aQ925F3 Clcnkb-201ENSMUST00000006378 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Rnf144aQ925F3 Ankrd33-201ENSMUST00000070875 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Rnf144aQ925F3 Adamts1-201ENSMUST00000023610 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Rnf144aQ925F3 Dlgap1-210ENSMUST00000146730 3936 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Rnf144aQ925F3 Trp63-204ENSMUST00000115305 1729 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Rnf144aQ925F3 Strc-201ENSMUST00000038389 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Rnf144aQ925F3 Gm44806-201ENSMUST00000205574 2303 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Rnf144aQ925F3 Tmc4-201ENSMUST00000038743 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Rnf144aQ925F3 Olfr658-202ENSMUST00000210641 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Rnf144aQ925F3 Olfr658-201ENSMUST00000089296 2912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Rnf144aQ925F3 Gm26584-201ENSMUST00000180551 3216 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Rnf144aQ925F3 A630076J17Rik-201ENSMUST00000179399 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Rnf144aQ925F3 Bub1-201ENSMUST00000028858 3421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Rnf144aQ925F3 Gm20646-201ENSMUST00000176807 1316 ntTSL 3 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Rnf144aQ925F3 Herc4-201ENSMUST00000020258 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Rnf144aQ925F3 Pax5-204ENSMUST00000107826 1228 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Rnf144aQ925F3 Ift20-202ENSMUST00000108275 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Rnf144aQ925F3 Tcf7l2-205ENSMUST00000111651 1127 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Rnf144aQ925F3 Mcpt8-201ENSMUST00000015594 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Rnf144aQ925F3 Rps28-202ENSMUST00000166693 271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Rnf144aQ925F3 1700121N20Rik-201ENSMUST00000167922 1027 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Rnf144aQ925F3 Gm25732-201ENSMUST00000175168 60 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Rnf144aQ925F3 1700095B10Rik-201ENSMUST00000182349 978 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Rnf144aQ925F3 Gm27390-201ENSMUST00000184516 176 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Rnf144aQ925F3 Gm9230-201ENSMUST00000188228 532 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Rnf144aQ925F3 Gm2453-202ENSMUST00000195508 568 ntTSL 3 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Rnf144aQ925F3 Gm26953-204ENSMUST00000212526 553 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Rnf144aQ925F3 Agrp-201ENSMUST00000005849 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Rnf144aQ925F3 Eif5-213ENSMUST00000222388 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Rnf144aQ925F3 Lhfpl1-201ENSMUST00000040084 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Rnf144aQ925F3 Hk3-202ENSMUST00000123097 2896 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Rnf144aQ925F3 2900026A02Rik-203ENSMUST00000212276 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Rnf144aQ925F3 Hr-205ENSMUST00000163060 5278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Rnf144aQ925F3 Ces1d-201ENSMUST00000034172 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Rnf144aQ925F3 Sppl2b-211ENSMUST00000220091 3629 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Rnf144aQ925F3 1700030J22Rik-202ENSMUST00000213068 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Rnf144aQ925F3 Hs6st2-202ENSMUST00000114871 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Rnf144aQ925F3 Galc-201ENSMUST00000021390 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Rnf144aQ925F3 Abcc10-201ENSMUST00000047970 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Rnf144aQ925F3 Slc25a45-206ENSMUST00000155697 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Rnf144aQ925F3 Tie1-201ENSMUST00000047421 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Rnf144aQ925F3 Olfr1420-201ENSMUST00000072784 1444 ntAPPRIS P1 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Rnf144aQ925F3 Cd163l1-201ENSMUST00000084460 3454 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Rnf144aQ925F3 Mrvi1-202ENSMUST00000125758 5953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Rnf144aQ925F3 Tbcd-201ENSMUST00000103013 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Rnf144aQ925F3 Aire-202ENSMUST00000105395 1630 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Rnf144aQ925F3 Nemp1-203ENSMUST00000118728 2362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Rnf144aQ925F3 Gm5580-201ENSMUST00000122096 1362 ntAPPRIS P1 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Rnf144aQ925F3 Gm16168-201ENSMUST00000161091 1359 ntTSL 3 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Rnf144aQ925F3 Lrrc27-201ENSMUST00000016124 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Rnf144aQ925F3 Tsku-202ENSMUST00000164726 2620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Rnf144aQ925F3 Nrg1-206ENSMUST00000208205 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Rnf144aQ925F3 Sec14l5-201ENSMUST00000165810 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Rnf144aQ925F3 LMLN2-201ENSMUST00000224691 2342 ntAPPRIS P5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Rnf144aQ925F3 Gm10767-202ENSMUST00000168767 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Rnf144aQ925F3 Frmd4a-202ENSMUST00000091497 6208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Rnf144aQ925F3 Nfatc4-202ENSMUST00000172271 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Rnf144aQ925F3 Etfrf1-203ENSMUST00000111721 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Rnf144aQ925F3 Ubap1-201ENSMUST00000072866 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Rnf144aQ925F3 Dbf4-204ENSMUST00000168500 2000 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Rnf144aQ925F3 Src-201ENSMUST00000029175 3906 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Rnf144aQ925F3 Gdpd5-208ENSMUST00000213887 2711 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Rnf144aQ925F3 Zmym3-205ENSMUST00000119699 1750 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Rnf144aQ925F3 Ptchd3-201ENSMUST00000036690 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Rnf144aQ925F3 Gm16066-201ENSMUST00000118575 1086 ntTSL 3 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Rnf144aQ925F3 Mettl1-202ENSMUST00000120542 1044 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Rnf144aQ925F3 Anapc16-202ENSMUST00000182116 581 ntTSL 3 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Rnf144aQ925F3 Pmvk-203ENSMUST00000184515 1156 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Rnf144aQ925F3 Gm45224-201ENSMUST00000208203 414 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Rnf144aQ925F3 AC163667.3-201ENSMUST00000225774 222 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Rnf144aQ925F3 Psma7-201ENSMUST00000029082 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Rnf144aQ925F3 Calca-201ENSMUST00000032906 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Rnf144aQ925F3 Flrt1-201ENSMUST00000113383 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Rnf144aQ925F3 Traf3ip2-201ENSMUST00000019987 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms