Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDN8

Ccdc38, Coiled-coil domain-containing protein 38, mousemouse

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Length 563 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc38Q8CDN8 Gm5070-201ENSMUST00000177599 862 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Ccdc38Q8CDN8 Gm26740-201ENSMUST00000180456 358 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ccdc38Q8CDN8 Gm28511-201ENSMUST00000191594 450 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ccdc38Q8CDN8 Gm36937-201ENSMUST00000192957 429 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ccdc38Q8CDN8 Gm44066-201ENSMUST00000203263 519 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ccdc38Q8CDN8 Gm44710-201ENSMUST00000208885 471 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ccdc38Q8CDN8 Rsph1-201ENSMUST00000024832 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ccdc38Q8CDN8 Gm6169-201ENSMUST00000071118 1030 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ccdc38Q8CDN8 Olfr667-201ENSMUST00000071362 981 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ccdc38Q8CDN8 Olfr666-201ENSMUST00000081116 957 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ccdc38Q8CDN8 Rgs11-201ENSMUST00000025020 2006 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ccdc38Q8CDN8 Apold1-201ENSMUST00000167323 3567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ccdc38Q8CDN8 Nudt15-201ENSMUST00000043813 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ccdc38Q8CDN8 Irak2-201ENSMUST00000059286 3196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ccdc38Q8CDN8 Acvr1c-201ENSMUST00000028178 9162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ccdc38Q8CDN8 Mob3a-201ENSMUST00000003438 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ccdc38Q8CDN8 Sorcs1-203ENSMUST00000164039 7241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ccdc38Q8CDN8 Gm20658-201ENSMUST00000175871 1489 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ccdc38Q8CDN8 Plekha5-201ENSMUST00000087622 7382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ccdc38Q8CDN8 Rnf170-201ENSMUST00000014022 3929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ccdc38Q8CDN8 Nhlrc2-201ENSMUST00000071423 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ccdc38Q8CDN8 Gm15326-202ENSMUST00000128198 1422 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ccdc38Q8CDN8 Setdb1-202ENSMUST00000107170 4622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ccdc38Q8CDN8 Sh3tc1-201ENSMUST00000070203 4549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ccdc38Q8CDN8 Ercc4-201ENSMUST00000023206 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ccdc38Q8CDN8 Wdr53-201ENSMUST00000023474 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ccdc38Q8CDN8 Dlc1-201ENSMUST00000033923 6159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ccdc38Q8CDN8 Pla2g15-201ENSMUST00000034377 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ccdc38Q8CDN8 Tmem92-201ENSMUST00000100554 2043 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ccdc38Q8CDN8 Aldh4a1-201ENSMUST00000039818 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ccdc38Q8CDN8 Smtn-204ENSMUST00000110011 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ccdc38Q8CDN8 Chchd7-202ENSMUST00000108386 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ccdc38Q8CDN8 Rbm3-204ENSMUST00000115617 1152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ccdc38Q8CDN8 Chchd7-206ENSMUST00000121110 381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ccdc38Q8CDN8 Gm15501-201ENSMUST00000133910 849 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ccdc38Q8CDN8 4930515B02Rik-201ENSMUST00000140588 591 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ccdc38Q8CDN8 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ccdc38Q8CDN8 Gm20470-201ENSMUST00000174654 331 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ccdc38Q8CDN8 Gm3893-201ENSMUST00000178882 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ccdc38Q8CDN8 AC125206.1-201ENSMUST00000214070 739 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ccdc38Q8CDN8 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ccdc38Q8CDN8 Ifi30-202ENSMUST00000222087 981 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ccdc38Q8CDN8 CT010486.3-201ENSMUST00000224555 811 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Ccdc38Q8CDN8 Cga-201ENSMUST00000029975 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ccdc38Q8CDN8 Tsc22d4-201ENSMUST00000031738 1043 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ccdc38Q8CDN8 Gm11562-201ENSMUST00000073853 817 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ccdc38Q8CDN8 Serpina16-202ENSMUST00000164148 1582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ccdc38Q8CDN8 Sema6d-207ENSMUST00000103240 4372 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ccdc38Q8CDN8 AC129931.1-201ENSMUST00000228865 1861 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Ccdc38Q8CDN8 Zmiz1-208ENSMUST00000162645 7482 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ccdc38Q8CDN8 Gm26737-201ENSMUST00000181106 2151 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ccdc38Q8CDN8 Cfap52-201ENSMUST00000021287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ccdc38Q8CDN8 AI314180-202ENSMUST00000102889 7045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ccdc38Q8CDN8 Sppl2b-211ENSMUST00000220091 3629 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ccdc38Q8CDN8 Lipe-201ENSMUST00000003207 3613 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ccdc38Q8CDN8 Patl1-201ENSMUST00000061618 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ccdc38Q8CDN8 Pitpnm2-201ENSMUST00000086123 6620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ccdc38Q8CDN8 AC174678.2-201ENSMUST00000156420 3275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ccdc38Q8CDN8 Gm38100-202ENSMUST00000201297 1789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ccdc38Q8CDN8 H2-T10-201ENSMUST00000166442 1481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ccdc38Q8CDN8 Sh3pxd2a-202ENSMUST00000111800 10380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ccdc38Q8CDN8 Gm35040-201ENSMUST00000206829 5094 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ccdc38Q8CDN8 Pars2-202ENSMUST00000106781 3046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ccdc38Q8CDN8 Ccr4-202ENSMUST00000215425 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ccdc38Q8CDN8 Bmp5-201ENSMUST00000012281 3822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ccdc38Q8CDN8 Abi1-203ENSMUST00000093171 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ccdc38Q8CDN8 Ptprh-201ENSMUST00000049113 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ccdc38Q8CDN8 Abca7-203ENSMUST00000171637 6638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ccdc38Q8CDN8 Ptchd3-201ENSMUST00000036690 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ccdc38Q8CDN8 Hk3-202ENSMUST00000123097 2896 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ccdc38Q8CDN8 Gm8146-201ENSMUST00000192106 1847 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Ccdc38Q8CDN8 Epb41l1-203ENSMUST00000103136 6249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ccdc38Q8CDN8 Tnnt3-211ENSMUST00000105949 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ccdc38Q8CDN8 Gm14109-201ENSMUST00000118814 309 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Ccdc38Q8CDN8 Mogat1-201ENSMUST00000012331 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ccdc38Q8CDN8 Gm9192-201ENSMUST00000183221 985 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Ccdc38Q8CDN8 Gm2164-201ENSMUST00000184062 424 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ccdc38Q8CDN8 Gm27516-201ENSMUST00000184237 98 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Ccdc38Q8CDN8 Abhd14b-202ENSMUST00000185347 1200 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ccdc38Q8CDN8 2010106C02Rik-201ENSMUST00000191222 660 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ccdc38Q8CDN8 Gm19710-201ENSMUST00000200257 640 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ccdc38Q8CDN8 Ube2a-202ENSMUST00000200835 911 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ccdc38Q8CDN8 Gm2420-203ENSMUST00000202748 447 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ccdc38Q8CDN8 Ube2a-209ENSMUST00000202991 715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ccdc38Q8CDN8 Gm45691-201ENSMUST00000206905 1120 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Ccdc38Q8CDN8 Gm6334-201ENSMUST00000207083 228 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Ccdc38Q8CDN8 Gm44632-201ENSMUST00000207245 474 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ccdc38Q8CDN8 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ccdc38Q8CDN8 Ndufb3-201ENSMUST00000027193 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ccdc38Q8CDN8 Mrap-201ENSMUST00000038197 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ccdc38Q8CDN8 Strada-202ENSMUST00000103072 1517 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ccdc38Q8CDN8 Gpr45-201ENSMUST00000114761 1546 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ccdc38Q8CDN8 Gm13264-201ENSMUST00000138416 2011 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ccdc38Q8CDN8 Ldb3-204ENSMUST00000064098 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ccdc38Q8CDN8 Setd1a-201ENSMUST00000047075 6487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ccdc38Q8CDN8 Amotl2-211ENSMUST00000153965 4222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ccdc38Q8CDN8 Dbx2-201ENSMUST00000054244 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ccdc38Q8CDN8 Vezt-202ENSMUST00000118077 2223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ccdc38Q8CDN8 Pdxk-201ENSMUST00000041616 5124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Ccdc38Q8CDN8 Adamts14-202ENSMUST00000120336 3645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
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