Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCH2

Nhlrc3, NHL repeat-containing protein 3, mousemouse

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Length 347 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nhlrc3Q8CCH2 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Nhlrc3Q8CCH2 AC154462.2-201ENSMUST00000227519 370 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Nhlrc3Q8CCH2 Tm2d3-201ENSMUST00000032726 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Nhlrc3Q8CCH2 Mtm1-203ENSMUST00000061970 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Nhlrc3Q8CCH2 Uprt-201ENSMUST00000087867 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Nhlrc3Q8CCH2 Gnb1l-202ENSMUST00000090086 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Nhlrc3Q8CCH2 Fbn1-202ENSMUST00000103234 11971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Nhlrc3Q8CCH2 Pitpnm2-201ENSMUST00000086123 6620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Nhlrc3Q8CCH2 Hs6st2-202ENSMUST00000114871 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Nhlrc3Q8CCH2 Fggy-201ENSMUST00000043335 1910 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Nhlrc3Q8CCH2 Cyp11b1-201ENSMUST00000170259 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Nhlrc3Q8CCH2 Snx33-201ENSMUST00000050916 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Nhlrc3Q8CCH2 Gm19221-201ENSMUST00000221827 1477 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Nhlrc3Q8CCH2 Gm6211-201ENSMUST00000147973 4275 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Nhlrc3Q8CCH2 Rgs7bp-201ENSMUST00000063551 7077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Nhlrc3Q8CCH2 Gm26660-202ENSMUST00000223620 4112 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Nhlrc3Q8CCH2 Ltbp2-202ENSMUST00000110254 6602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Nhlrc3Q8CCH2 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Nhlrc3Q8CCH2 4732490B19Rik-201ENSMUST00000130373 2446 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Nhlrc3Q8CCH2 Duox2-201ENSMUST00000053734 5744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Nhlrc3Q8CCH2 Rapgef2-202ENSMUST00000118340 6544 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Nhlrc3Q8CCH2 Plxna4os1-201ENSMUST00000150314 1977 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Nhlrc3Q8CCH2 Uimc1-201ENSMUST00000026997 2931 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Nhlrc3Q8CCH2 E030013I19Rik-201ENSMUST00000148089 2754 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Nhlrc3Q8CCH2 0610038B21Rik-201ENSMUST00000181420 1687 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Nhlrc3Q8CCH2 Dctn4-202ENSMUST00000223590 1530 ntBASIC10.02□□□□□ -0.8
Nhlrc3Q8CCH2 Nhlh2-201ENSMUST00000066187 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Nhlrc3Q8CCH2 Hyal3-202ENSMUST00000148440 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.8
Nhlrc3Q8CCH2 Nfic-201ENSMUST00000020461 3348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Nhlrc3Q8CCH2 Plekhg4-206ENSMUST00000214056 3654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.8
Nhlrc3Q8CCH2 Pla2g16-202ENSMUST00000136465 3048 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Nhlrc3Q8CCH2 Sord-201ENSMUST00000110551 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Nhlrc3Q8CCH2 Gm26640-201ENSMUST00000180809 3524 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Nhlrc3Q8CCH2 Sdr9c7-201ENSMUST00000047134 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Nhlrc3Q8CCH2 Golga2-202ENSMUST00000100194 4373 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Nhlrc3Q8CCH2 Bmp3-201ENSMUST00000031278 6548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Nhlrc3Q8CCH2 Gm10767-202ENSMUST00000168767 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Nhlrc3Q8CCH2 Siglech-206ENSMUST00000171077 1934 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Nhlrc3Q8CCH2 Shbg-201ENSMUST00000005334 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Nhlrc3Q8CCH2 Gm10434-201ENSMUST00000101158 471 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Nhlrc3Q8CCH2 6030468B19Rik-201ENSMUST00000106331 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Nhlrc3Q8CCH2 Gm15610-201ENSMUST00000120584 195 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Nhlrc3Q8CCH2 Gm14832-201ENSMUST00000121289 322 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
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Nhlrc3Q8CCH2 Nkg7-203ENSMUST00000206741 686 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
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Nhlrc3Q8CCH2 Tmem247-201ENSMUST00000042172 752 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
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Nhlrc3Q8CCH2 Trem3-201ENSMUST00000048065 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
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Nhlrc3Q8CCH2 Tmem40-201ENSMUST00000072933 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Nhlrc3Q8CCH2 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Nhlrc3Q8CCH2 Trim56-201ENSMUST00000054384 9279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Nhlrc3Q8CCH2 Ckmt1-201ENSMUST00000000317 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Nhlrc3Q8CCH2 Lynx1-201ENSMUST00000023259 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Nhlrc3Q8CCH2 Gucy1a3-204ENSMUST00000193924 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Nhlrc3Q8CCH2 Sez6l-206ENSMUST00000212758 2664 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Nhlrc3Q8CCH2 A830018L16Rik-202ENSMUST00000135014 6451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Nhlrc3Q8CCH2 Dnmt3l-202ENSMUST00000123940 1452 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
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Nhlrc3Q8CCH2 Matn2-201ENSMUST00000022947 3551 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Nhlrc3Q8CCH2 Fn1-201ENSMUST00000055226 8315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Nhlrc3Q8CCH2 Camkk1-201ENSMUST00000092937 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Nhlrc3Q8CCH2 Yipf1-201ENSMUST00000075693 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Nhlrc3Q8CCH2 Vmn1r38-202ENSMUST00000227493 3486 ntAPPRIS P1 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Nhlrc3Q8CCH2 Gm21319-201ENSMUST00000164517 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Nhlrc3Q8CCH2 Cox17-202ENSMUST00000120495 3690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
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Nhlrc3Q8CCH2 2210406O10Rik-202ENSMUST00000122882 1743 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Nhlrc3Q8CCH2 Vasn-201ENSMUST00000038770 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Nhlrc3Q8CCH2 Srrt-201ENSMUST00000040873 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
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Nhlrc3Q8CCH2 Col18a1-203ENSMUST00000105409 4791 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Nhlrc3Q8CCH2 AU019823-201ENSMUST00000131351 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Nhlrc3Q8CCH2 AU019823-205ENSMUST00000171462 3339 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Nhlrc3Q8CCH2 Gm18626-201ENSMUST00000221512 1409 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Nhlrc3Q8CCH2 Smim1-214ENSMUST00000182191 3535 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Nhlrc3Q8CCH2 Ror2-202ENSMUST00000130235 3730 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Nhlrc3Q8CCH2 Hmga1-203ENSMUST00000117600 1635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Nhlrc3Q8CCH2 Ddx11-201ENSMUST00000163605 4149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Nhlrc3Q8CCH2 Gdap2-202ENSMUST00000106997 2014 ntTSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Nhlrc3Q8CCH2 Nell2-202ENSMUST00000166170 3366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Nhlrc3Q8CCH2 Dcaf4-201ENSMUST00000021645 2008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Nhlrc3Q8CCH2 Ctif-201ENSMUST00000165559 6173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Nhlrc3Q8CCH2 Txn2-202ENSMUST00000100486 676 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Nhlrc3Q8CCH2 Pin4-201ENSMUST00000113627 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Nhlrc3Q8CCH2 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Nhlrc3Q8CCH2 Gm6023-201ENSMUST00000118217 606 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Nhlrc3Q8CCH2 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Nhlrc3Q8CCH2 Nrg4-204ENSMUST00000130158 1000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Nhlrc3Q8CCH2 Serf1-203ENSMUST00000132053 516 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Nhlrc3Q8CCH2 Gm13832-202ENSMUST00000151159 370 ntTSL 3 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Nhlrc3Q8CCH2 Usp46os2-201ENSMUST00000152787 831 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
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Nhlrc3Q8CCH2 H2afz-206ENSMUST00000173790 437 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.9 ms