Protein–RNA interactions for Protein: Q8CBG9

Rnf170, E3 ubiquitin-protein ligase RNF170, mousemouse

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Length 286 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf170Q8CBG9 Hhip-201ENSMUST00000079038 9074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
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Rnf170Q8CBG9 Erlin2-201ENSMUST00000033873 4838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Rnf170Q8CBG9 Fam110a-203ENSMUST00000109864 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
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Rnf170Q8CBG9 Sncb-202ENSMUST00000134110 722 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.07□□□□□ -0.8
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Rnf170Q8CBG9 Rrp36-201ENSMUST00000024766 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
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Rnf170Q8CBG9 Calm1-201ENSMUST00000001204 3987 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Rnf170Q8CBG9 Myo18a-224ENSMUST00000172303 6339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
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Rnf170Q8CBG9 Txndc5-204ENSMUST00000162075 2619 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
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