Protein–RNA interactions for Protein: Q8BXS2

Tnfsfm13, Tumor necrosis factor (ligand) superfamily, membrane-bound member 13, mousemouse

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Length 410 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsfm13Q8BXS2 Zmynd8-203ENSMUST00000099084 5232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tnfsfm13Q8BXS2 Mtap-201ENSMUST00000058030 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tnfsfm13Q8BXS2 Camkk1-201ENSMUST00000092937 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tnfsfm13Q8BXS2 Nacc2-202ENSMUST00000114159 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tnfsfm13Q8BXS2 Tgm2-201ENSMUST00000103122 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tnfsfm13Q8BXS2 1700019D03Rik-202ENSMUST00000114492 3565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tnfsfm13Q8BXS2 Dcun1d3-202ENSMUST00000098080 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tnfsfm13Q8BXS2 Sh3tc1-201ENSMUST00000070203 4549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tnfsfm13Q8BXS2 Hmg20a-204ENSMUST00000214869 1782 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tnfsfm13Q8BXS2 Olfr288-202ENSMUST00000165379 2083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tnfsfm13Q8BXS2 Ncapd2-201ENSMUST00000043848 4629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tnfsfm13Q8BXS2 Pla2g10-202ENSMUST00000115807 964 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tnfsfm13Q8BXS2 Aif1-203ENSMUST00000172693 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tnfsfm13Q8BXS2 1700040D17Rik-201ENSMUST00000181305 998 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tnfsfm13Q8BXS2 2010106C02Rik-201ENSMUST00000191222 660 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm18711-201ENSMUST00000199341 750 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm44066-201ENSMUST00000203263 519 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm44974-201ENSMUST00000206387 1279 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Tnfsfm13Q8BXS2 Phgdh-ps1-201ENSMUST00000207540 754 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Tnfsfm13Q8BXS2 Ndufb3-201ENSMUST00000027193 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tnfsfm13Q8BXS2 Zdhhc12-201ENSMUST00000081838 1187 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tnfsfm13Q8BXS2 Ccdc33-202ENSMUST00000098681 1093 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tnfsfm13Q8BXS2 5930430L01Rik-201ENSMUST00000145042 3994 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tnfsfm13Q8BXS2 4933431M02Rik-201ENSMUST00000203905 1432 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tnfsfm13Q8BXS2 Neu2-201ENSMUST00000070898 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tnfsfm13Q8BXS2 Tubgcp2-201ENSMUST00000026547 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm42913-201ENSMUST00000197936 1853 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Tnfsfm13Q8BXS2 Plekha6-203ENSMUST00000186917 4820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tnfsfm13Q8BXS2 Zdhhc20-205ENSMUST00000226057 2179 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tnfsfm13Q8BXS2 Jak3-203ENSMUST00000110013 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tnfsfm13Q8BXS2 Jak3-201ENSMUST00000051995 4019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tnfsfm13Q8BXS2 Sass6-204ENSMUST00000197335 2458 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tnfsfm13Q8BXS2 Setdb1-202ENSMUST00000107170 4622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tnfsfm13Q8BXS2 Pde6b-201ENSMUST00000031456 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tnfsfm13Q8BXS2 Cbx7-201ENSMUST00000089293 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tnfsfm13Q8BXS2 Allc-202ENSMUST00000110917 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tnfsfm13Q8BXS2 Slc3a2-207ENSMUST00000206598 1393 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tnfsfm13Q8BXS2 Lrrfip2-213ENSMUST00000216430 1525 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tnfsfm13Q8BXS2 H2-T10-202ENSMUST00000174382 1699 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tnfsfm13Q8BXS2 Spr-ps1-203ENSMUST00000187705 2892 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Tnfsfm13Q8BXS2 Trpv1-203ENSMUST00000108470 2667 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tnfsfm13Q8BXS2 Cyb5r3-202ENSMUST00000162178 2547 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tnfsfm13Q8BXS2 Cln3-201ENSMUST00000032962 2386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tnfsfm13Q8BXS2 Asb8-204ENSMUST00000143400 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tnfsfm13Q8BXS2 Ash2l-210ENSMUST00000166078 2234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tnfsfm13Q8BXS2 Tpd52l2-202ENSMUST00000069712 1799 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tnfsfm13Q8BXS2 Usp22-201ENSMUST00000041683 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tnfsfm13Q8BXS2 Tsga10-202ENSMUST00000088072 3837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tnfsfm13Q8BXS2 Fam110b-201ENSMUST00000054857 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tnfsfm13Q8BXS2 Ppil2-203ENSMUST00000115721 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tnfsfm13Q8BXS2 Epb41l3-202ENSMUST00000112680 4073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
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Tnfsfm13Q8BXS2 Rdh13-201ENSMUST00000008579 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tnfsfm13Q8BXS2 Sgpp2-201ENSMUST00000036172 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tnfsfm13Q8BXS2 Cdh20-201ENSMUST00000062528 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tnfsfm13Q8BXS2 Tspan32-201ENSMUST00000009396 1582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tnfsfm13Q8BXS2 Mknk1-202ENSMUST00000106513 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tnfsfm13Q8BXS2 Paqr5-201ENSMUST00000034817 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tnfsfm13Q8BXS2 Pmp2-201ENSMUST00000029034 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tnfsfm13Q8BXS2 Cdc7-204ENSMUST00000118261 3129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
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Tnfsfm13Q8BXS2 Spata3-210ENSMUST00000153247 884 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
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Tnfsfm13Q8BXS2 Gm19710-201ENSMUST00000200257 640 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tnfsfm13Q8BXS2 Svip-203ENSMUST00000209193 487 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm45892-201ENSMUST00000212627 273 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tnfsfm13Q8BXS2 Tpd52l1-203ENSMUST00000213639 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tnfsfm13Q8BXS2 AC166344.1-202ENSMUST00000224139 234 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Tnfsfm13Q8BXS2 AC154222.2-201ENSMUST00000225848 607 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Tnfsfm13Q8BXS2 Ercc8-201ENSMUST00000054835 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tnfsfm13Q8BXS2 Ppp1r2-ps3-201ENSMUST00000078012 627 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm10312-201ENSMUST00000078515 489 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Tnfsfm13Q8BXS2 Igsf1-204ENSMUST00000114893 2671 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm28578-201ENSMUST00000187727 2698 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tnfsfm13Q8BXS2 Gng7-203ENSMUST00000117805 3382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tnfsfm13Q8BXS2 Sec16a-202ENSMUST00000114082 8797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tnfsfm13Q8BXS2 Cyp26b1-202ENSMUST00000168003 4170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tnfsfm13Q8BXS2 Cyp26b1-201ENSMUST00000077705 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tnfsfm13Q8BXS2 Dpep1-201ENSMUST00000019422 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tnfsfm13Q8BXS2 Eya2-201ENSMUST00000063433 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tnfsfm13Q8BXS2 Fbxo18-201ENSMUST00000071564 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tnfsfm13Q8BXS2 4632404M16Rik-201ENSMUST00000197326 2882 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Tnfsfm13Q8BXS2 Cnot10-201ENSMUST00000070117 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tnfsfm13Q8BXS2 Lnx1-206ENSMUST00000121690 2302 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tnfsfm13Q8BXS2 Vmn1r193-202ENSMUST00000227457 6429 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tnfsfm13Q8BXS2 Fnip1-201ENSMUST00000046835 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tnfsfm13Q8BXS2 Tmcc2-203ENSMUST00000132435 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tnfsfm13Q8BXS2 Tmem215-201ENSMUST00000049655 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tnfsfm13Q8BXS2 Zfp568-201ENSMUST00000074322 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tnfsfm13Q8BXS2 Abcb8-201ENSMUST00000073076 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Tnfsfm13Q8BXS2 Aldoc-202ENSMUST00000102478 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
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