Protein–RNA interactions for Protein: Q8BW70

Usp38, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 38, mousemouse

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Length 1,042 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp38Q8BW70 Gm8100-201ENSMUST00000182906 988 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
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Usp38Q8BW70 Gm5733-201ENSMUST00000190232 939 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
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Usp38Q8BW70 Gm43610-201ENSMUST00000199117 365 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Usp38Q8BW70 Gm43778-201ENSMUST00000199438 199 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Usp38Q8BW70 S100a3-205ENSMUST00000200508 587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Usp38Q8BW70 Gm35960-201ENSMUST00000202712 767 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Usp38Q8BW70 Gm44711-201ENSMUST00000205414 1264 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Usp38Q8BW70 4930578I06Rik-201ENSMUST00000022532 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Usp38Q8BW70 Ddx55-202ENSMUST00000111438 2737 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Usp38Q8BW70 Phyhd1-212ENSMUST00000154647 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Usp38Q8BW70 Fam234b-202ENSMUST00000111916 2927 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Usp38Q8BW70 Slc6a9-210ENSMUST00000169885 1876 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Usp38Q8BW70 Pcdhga11-201ENSMUST00000061279 4756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Usp38Q8BW70 Prkch-201ENSMUST00000021527 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Usp38Q8BW70 Sdc4-201ENSMUST00000017153 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Usp38Q8BW70 AC154517.2-201ENSMUST00000220829 2458 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Usp38Q8BW70 Eif1a-201ENSMUST00000078079 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Usp38Q8BW70 Smarcb1-202ENSMUST00000121304 1622 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Usp38Q8BW70 Dram1-201ENSMUST00000020249 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Usp38Q8BW70 Ppp3cb-202ENSMUST00000159027 3831 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Usp38Q8BW70 Gga3-201ENSMUST00000019135 3816 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
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Usp38Q8BW70 B230398E01Rik-201ENSMUST00000125186 1958 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Usp38Q8BW70 Pstpip2-201ENSMUST00000114741 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
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Usp38Q8BW70 Sorcs1-205ENSMUST00000209413 4398 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Usp38Q8BW70 Rfx1-201ENSMUST00000005600 4172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Usp38Q8BW70 Fmo2-202ENSMUST00000111510 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
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Usp38Q8BW70 Gm45278-201ENSMUST00000209650 2414 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
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Usp38Q8BW70 A830082K12Rik-201ENSMUST00000123998 2203 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Usp38Q8BW70 Cyp2j13-203ENSMUST00000107078 1493 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Usp38Q8BW70 Fam114a2-201ENSMUST00000020831 2557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Usp38Q8BW70 Ppil6-201ENSMUST00000105507 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
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Usp38Q8BW70 Tnnt3-210ENSMUST00000105948 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Usp38Q8BW70 Tnnt3-212ENSMUST00000105950 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
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Usp38Q8BW70 Tnnt3-224ENSMUST00000169299 1013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Usp38Q8BW70 Tnnt3-226ENSMUST00000180152 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
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Usp38Q8BW70 Cd1d2-202ENSMUST00000192481 1131 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
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Usp38Q8BW70 Arid5a-204ENSMUST00000115032 4640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Usp38Q8BW70 Pou2f2-203ENSMUST00000108415 7095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
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Usp38Q8BW70 Pi16-202ENSMUST00000114701 2756 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
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Usp38Q8BW70 Vps33b-201ENSMUST00000032749 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Usp38Q8BW70 Eogt-201ENSMUST00000054344 4424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
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Usp38Q8BW70 Rbm47-204ENSMUST00000113726 4703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Usp38Q8BW70 Eif2ak1-201ENSMUST00000100487 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Usp38Q8BW70 Chit1-202ENSMUST00000159963 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Usp38Q8BW70 Sppl2a-201ENSMUST00000028844 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Usp38Q8BW70 4930563D23Rik-201ENSMUST00000062638 2646 ntAPPRIS P1 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Usp38Q8BW70 Rab11fip3-203ENSMUST00000122103 5015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Usp38Q8BW70 Vsx2-202ENSMUST00000169934 3249 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Usp38Q8BW70 Samd4-202ENSMUST00000100672 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Usp38Q8BW70 Gsdmcl2-203ENSMUST00000185431 1911 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Usp38Q8BW70 Adck2-204ENSMUST00000140364 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Usp38Q8BW70 Gm15573-201ENSMUST00000119487 540 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Usp38Q8BW70 Prdx5-203ENSMUST00000149261 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Usp38Q8BW70 D630008O14Rik-202ENSMUST00000149909 1043 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Usp38Q8BW70 Gm12951-201ENSMUST00000150216 434 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Usp38Q8BW70 Cd63-ps-202ENSMUST00000154992 717 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Usp38Q8BW70 Gm15996-201ENSMUST00000161925 762 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Usp38Q8BW70 Agtpbp1-216ENSMUST00000168821 721 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Usp38Q8BW70 Gm26782-202ENSMUST00000181697 971 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Usp38Q8BW70 Gm4131-201ENSMUST00000186010 1264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Usp38Q8BW70 Gm29292-201ENSMUST00000186169 766 ntTSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Usp38Q8BW70 Gm5621-201ENSMUST00000187303 640 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Usp38Q8BW70 Gm42599-201ENSMUST00000201308 469 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Usp38Q8BW70 Gm45285-201ENSMUST00000210418 749 ntTSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Usp38Q8BW70 Gm45717-201ENSMUST00000211129 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
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