Protein–RNA interactions for Protein: Q80VM8

Pnma8a, Paraneoplastic antigen-like protein 8A, mousemouse

Predictions only

Length 430 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pnma8aQ80VM8 Rpl19-201ENSMUST00000017548 751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Pnma8aQ80VM8 Gm8546-201ENSMUST00000178288 1264 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Pnma8aQ80VM8 1110002L01Rik-203ENSMUST00000179637 586 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Pnma8aQ80VM8 Rps13-ps2-201ENSMUST00000182017 453 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Pnma8aQ80VM8 Gm35986-201ENSMUST00000197370 655 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Pnma8aQ80VM8 Fxr1-204ENSMUST00000197694 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Pnma8aQ80VM8 AY036118-201ENSMUST00000200021 923 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Pnma8aQ80VM8 C530044C16Rik-202ENSMUST00000205217 1239 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Pnma8aQ80VM8 Olfr1347-205ENSMUST00000220413 964 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Pnma8aQ80VM8 Ankrd2-201ENSMUST00000026172 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Pnma8aQ80VM8 Olfr1347-201ENSMUST00000036357 964 ntAPPRIS P1 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Pnma8aQ80VM8 Mrpl41-201ENSMUST00000045604 776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Pnma8aQ80VM8 Cldn17-201ENSMUST00000069549 1172 ntAPPRIS P1 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Pnma8aQ80VM8 Mill2-201ENSMUST00000072386 1121 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Pnma8aQ80VM8 Rpl19-202ENSMUST00000092425 737 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Pnma8aQ80VM8 Ercc4-201ENSMUST00000023206 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Pnma8aQ80VM8 Etaa1-201ENSMUST00000076661 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Pnma8aQ80VM8 AC129931.1-201ENSMUST00000228865 1861 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Pnma8aQ80VM8 Dnmbp-201ENSMUST00000026209 4882 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Pnma8aQ80VM8 Tuft1-201ENSMUST00000006123 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Pnma8aQ80VM8 Chtop-201ENSMUST00000001043 3257 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Pnma8aQ80VM8 Gm28719-201ENSMUST00000187779 1757 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Pnma8aQ80VM8 Gm45428-201ENSMUST00000209619 1789 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Pnma8aQ80VM8 Rtbdn-204ENSMUST00000152378 2322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Pnma8aQ80VM8 Myo18a-210ENSMUST00000130305 5450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Pnma8aQ80VM8 Cmklr1-201ENSMUST00000047936 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Pnma8aQ80VM8 Cacna1g-205ENSMUST00000107786 7984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Pnma8aQ80VM8 Myo18a-220ENSMUST00000164334 5381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Pnma8aQ80VM8 Cdh18-204ENSMUST00000165614 2162 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Pnma8aQ80VM8 Rabgef1-203ENSMUST00000119797 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Pnma8aQ80VM8 Cacna1g-210ENSMUST00000107792 7981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Pnma8aQ80VM8 Hrct1-201ENSMUST00000095109 1452 ntAPPRIS P1 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Pnma8aQ80VM8 Kif28-202ENSMUST00000211943 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Pnma8aQ80VM8 1700082M22Rik-201ENSMUST00000067136 2022 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Pnma8aQ80VM8 6030466F02Rik-201ENSMUST00000212339 1434 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Pnma8aQ80VM8 AC108858.2-201ENSMUST00000228186 1425 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Pnma8aQ80VM8 Nlrx1-202ENSMUST00000168499 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Pnma8aQ80VM8 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Pnma8aQ80VM8 Hnrnph2-202ENSMUST00000059297 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Pnma8aQ80VM8 Tacc2-201ENSMUST00000033141 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Pnma8aQ80VM8 Zfp1-201ENSMUST00000077791 1811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Pnma8aQ80VM8 Atp1b2-201ENSMUST00000047889 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Pnma8aQ80VM8 Gm11568-201ENSMUST00000107434 1145 ntAPPRIS P1 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Pnma8aQ80VM8 Gm11509-201ENSMUST00000117358 325 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Pnma8aQ80VM8 Rpl36-ps10-201ENSMUST00000117431 216 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Pnma8aQ80VM8 Gm13611-201ENSMUST00000118269 318 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Pnma8aQ80VM8 BC026585-202ENSMUST00000119891 1125 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Pnma8aQ80VM8 Gm12266-201ENSMUST00000120311 962 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Pnma8aQ80VM8 Gsto2-202ENSMUST00000120645 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Pnma8aQ80VM8 Pabpc1l2a-ps-201ENSMUST00000128361 513 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Pnma8aQ80VM8 Lsm10-203ENSMUST00000179323 808 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Pnma8aQ80VM8 Gm28262-201ENSMUST00000185463 477 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Pnma8aQ80VM8 Lysmd4-208ENSMUST00000208698 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Pnma8aQ80VM8 AC154680.1-201ENSMUST00000224376 859 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Pnma8aQ80VM8 Ly6g5c-201ENSMUST00000037849 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Pnma8aQ80VM8 S100a1-201ENSMUST00000060738 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Pnma8aQ80VM8 Rpl34-202ENSMUST00000079085 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Pnma8aQ80VM8 Zfp341-201ENSMUST00000081926 3299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Pnma8aQ80VM8 Arfgap1-201ENSMUST00000029092 2714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Pnma8aQ80VM8 Lsp1-205ENSMUST00000105968 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Pnma8aQ80VM8 Rfx1-201ENSMUST00000005600 4172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Pnma8aQ80VM8 Frmd3-201ENSMUST00000084474 4136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Pnma8aQ80VM8 Ambra1-204ENSMUST00000111316 5063 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Pnma8aQ80VM8 Atl3-202ENSMUST00000170373 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Pnma8aQ80VM8 Gm37648-201ENSMUST00000192072 2563 ntBASIC11.96□□□□□ -0.5
Pnma8aQ80VM8 Rgs6-211ENSMUST00000191107 1621 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Pnma8aQ80VM8 Dync1i2-202ENSMUST00000100028 2097 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Pnma8aQ80VM8 Bub1-201ENSMUST00000028858 3421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Pnma8aQ80VM8 4930563E18Rik-201ENSMUST00000180948 1553 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Pnma8aQ80VM8 Aars2-201ENSMUST00000024733 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Pnma8aQ80VM8 Sept8-204ENSMUST00000121334 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Pnma8aQ80VM8 Nemp1-203ENSMUST00000118728 2362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Pnma8aQ80VM8 Mtap-201ENSMUST00000058030 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Pnma8aQ80VM8 Gabbr1-203ENSMUST00000172792 4036 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pnma8aQ80VM8 Nol3-201ENSMUST00000014920 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pnma8aQ80VM8 Gm12915-201ENSMUST00000131381 1499 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pnma8aQ80VM8 Tut1-201ENSMUST00000096239 2747 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pnma8aQ80VM8 Sema4a-215ENSMUST00000169222 3084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pnma8aQ80VM8 Tgfb2-206ENSMUST00000195201 3485 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pnma8aQ80VM8 Tbc1d1-204ENSMUST00000121370 5419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pnma8aQ80VM8 Snx33-201ENSMUST00000050916 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pnma8aQ80VM8 Adamts16-202ENSMUST00000109694 3378 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pnma8aQ80VM8 6430571L13Rik-201ENSMUST00000042581 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pnma8aQ80VM8 Fndc8-201ENSMUST00000018988 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pnma8aQ80VM8 Lck-201ENSMUST00000067240 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pnma8aQ80VM8 Eogt-201ENSMUST00000054344 4424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pnma8aQ80VM8 Dars2-201ENSMUST00000035430 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pnma8aQ80VM8 Gm17518-201ENSMUST00000181232 1346 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pnma8aQ80VM8 Slc29a1-213ENSMUST00000167692 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pnma8aQ80VM8 Ndrg2-201ENSMUST00000004673 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pnma8aQ80VM8 Nr1h3-203ENSMUST00000111355 1672 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pnma8aQ80VM8 Gemin4-201ENSMUST00000102500 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pnma8aQ80VM8 Mark4-201ENSMUST00000085715 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pnma8aQ80VM8 Trav13d-4-201ENSMUST00000103607 264 ntAPPRIS P1 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pnma8aQ80VM8 Gm23949-201ENSMUST00000104027 127 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Pnma8aQ80VM8 Gm12036-201ENSMUST00000120008 530 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Pnma8aQ80VM8 5730416F02Rik-201ENSMUST00000120648 812 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Pnma8aQ80VM8 n-R5s14-201ENSMUST00000122688 107 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Pnma8aQ80VM8 Sumo3-203ENSMUST00000124024 776 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pnma8aQ80VM8 Pcbd2-202ENSMUST00000124968 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.7 ms