Protein–RNA interactions for Protein: Q6P5D8

Smchd1, Structural maintenance of chromosomes flexible hinge domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,007 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smchd1Q6P5D8 Ndufb4-201ENSMUST00000023514 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Smchd1Q6P5D8 Sst-201ENSMUST00000004480 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Smchd1Q6P5D8 Samd11-204ENSMUST00000218788 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Smchd1Q6P5D8 Prkaca-202ENSMUST00000211558 1399 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Smchd1Q6P5D8 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Smchd1Q6P5D8 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Smchd1Q6P5D8 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Smchd1Q6P5D8 AU022754-201ENSMUST00000180441 2976 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Smchd1Q6P5D8 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Smchd1Q6P5D8 Pcdhga9-201ENSMUST00000091935 4724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Smchd1Q6P5D8 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Smchd1Q6P5D8 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Smchd1Q6P5D8 Asic5-201ENSMUST00000029641 1657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Smchd1Q6P5D8 Cpa5-202ENSMUST00000115138 1778 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Smchd1Q6P5D8 2900041M22Rik-201ENSMUST00000155384 1784 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Smchd1Q6P5D8 Fcer2a-201ENSMUST00000005678 2242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Smchd1Q6P5D8 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Smchd1Q6P5D8 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Smchd1Q6P5D8 Rspo2-201ENSMUST00000063492 3338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Smchd1Q6P5D8 Clec16a-203ENSMUST00000115823 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Smchd1Q6P5D8 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Smchd1Q6P5D8 Gm34023-201ENSMUST00000195539 217 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Smchd1Q6P5D8 Gm6108-201ENSMUST00000208365 367 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Smchd1Q6P5D8 Gm7600-201ENSMUST00000209657 785 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Smchd1Q6P5D8 Pbld1-204ENSMUST00000219045 602 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Smchd1Q6P5D8 Krtap4-2-201ENSMUST00000058987 974 ntAPPRIS P1 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Smchd1Q6P5D8 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Smchd1Q6P5D8 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Smchd1Q6P5D8 Ces2e-201ENSMUST00000034355 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Smchd1Q6P5D8 Arhgef2-219ENSMUST00000176500 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Smchd1Q6P5D8 Srr-201ENSMUST00000065211 3699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Smchd1Q6P5D8 Gpr176-201ENSMUST00000039160 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Smchd1Q6P5D8 Tcf25-202ENSMUST00000108840 2582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Smchd1Q6P5D8 Sncaip-209ENSMUST00000179625 2568 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Smchd1Q6P5D8 Mdga2-201ENSMUST00000037181 9833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Smchd1Q6P5D8 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Smchd1Q6P5D8 Ptchd3-201ENSMUST00000036690 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Smchd1Q6P5D8 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Smchd1Q6P5D8 Gm15856-201ENSMUST00000124853 1162 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Smchd1Q6P5D8 Rpl9-ps7-201ENSMUST00000140507 579 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Smchd1Q6P5D8 Mrpl23-ps1-201ENSMUST00000173086 580 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Smchd1Q6P5D8 Slc2a4rg-ps-202ENSMUST00000176590 1143 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Smchd1Q6P5D8 Mir8093-201ENSMUST00000185043 137 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Smchd1Q6P5D8 Gm33979-201ENSMUST00000219486 691 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Smchd1Q6P5D8 Gm36423-202ENSMUST00000222215 1298 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Smchd1Q6P5D8 Taar9-201ENSMUST00000041180 1047 ntAPPRIS P1 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Smchd1Q6P5D8 Rpl9-ps4-201ENSMUST00000075549 579 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Smchd1Q6P5D8 Gm5451-201ENSMUST00000080545 579 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Smchd1Q6P5D8 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Smchd1Q6P5D8 Yaf2-201ENSMUST00000080299 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Smchd1Q6P5D8 Bbip1-201ENSMUST00000135402 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Smchd1Q6P5D8 Zfp125-201ENSMUST00000079237 2488 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Smchd1Q6P5D8 Ildr1-203ENSMUST00000119464 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Smchd1Q6P5D8 Ankzf1-208ENSMUST00000152233 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Smchd1Q6P5D8 C1qtnf3-201ENSMUST00000022853 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Smchd1Q6P5D8 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Smchd1Q6P5D8 Mon1b-202ENSMUST00000179926 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Smchd1Q6P5D8 Cisd2-201ENSMUST00000029815 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Smchd1Q6P5D8 Trmt61b-202ENSMUST00000137830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Smchd1Q6P5D8 Psg23-201ENSMUST00000057810 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Smchd1Q6P5D8 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Smchd1Q6P5D8 Qrich1-201ENSMUST00000006851 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Smchd1Q6P5D8 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Smchd1Q6P5D8 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Smchd1Q6P5D8 Axl-202ENSMUST00000085948 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Smchd1Q6P5D8 Spdye4a-203ENSMUST00000195900 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Smchd1Q6P5D8 Coro6-202ENSMUST00000052515 1476 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Smchd1Q6P5D8 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Smchd1Q6P5D8 Gm23272-201ENSMUST00000104053 129 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Smchd1Q6P5D8 4930535L15Rik-201ENSMUST00000175891 536 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Smchd1Q6P5D8 Stx5a-219ENSMUST00000177373 995 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Smchd1Q6P5D8 Gm6408-201ENSMUST00000179032 1171 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Smchd1Q6P5D8 Gm4654-201ENSMUST00000183305 982 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Smchd1Q6P5D8 Gm42599-201ENSMUST00000201308 469 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Smchd1Q6P5D8 Ddo-207ENSMUST00000216830 806 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Smchd1Q6P5D8 Gm40578-201ENSMUST00000220837 390 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Smchd1Q6P5D8 AC134869.3-201ENSMUST00000225581 343 ntAPPRIS P1 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Smchd1Q6P5D8 E030013I19Rik-201ENSMUST00000148089 2754 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Smchd1Q6P5D8 Olfr707-203ENSMUST00000210644 1817 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Smchd1Q6P5D8 Gm807-201ENSMUST00000181742 1723 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Smchd1Q6P5D8 Mirt1-202ENSMUST00000180667 1633 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Smchd1Q6P5D8 Lrp2-203ENSMUST00000100051 4359 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Smchd1Q6P5D8 Awat2-202ENSMUST00000147103 1984 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Smchd1Q6P5D8 Cd33-202ENSMUST00000039861 1791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Smchd1Q6P5D8 Vps4b-202ENSMUST00000112736 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Smchd1Q6P5D8 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Smchd1Q6P5D8 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Smchd1Q6P5D8 Snhg18-201ENSMUST00000181536 1486 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Smchd1Q6P5D8 Eif5-212ENSMUST00000222375 3547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Smchd1Q6P5D8 Eif5-213ENSMUST00000222388 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Smchd1Q6P5D8 Pip4k2c-201ENSMUST00000013970 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Smchd1Q6P5D8 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Smchd1Q6P5D8 Apoo-202ENSMUST00000113896 1032 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Smchd1Q6P5D8 Gm8342-201ENSMUST00000209839 757 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Smchd1Q6P5D8 AC164618.2-201ENSMUST00000224770 573 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Smchd1Q6P5D8 Hils1-201ENSMUST00000038928 864 ntAPPRIS P1 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Smchd1Q6P5D8 4930596D02Rik-201ENSMUST00000043266 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Smchd1Q6P5D8 Gm5879-201ENSMUST00000089501 1209 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Smchd1Q6P5D8 Fdxacb1-201ENSMUST00000042391 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Smchd1Q6P5D8 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.8 ms