Protein–RNA interactions for Protein: Q6DFW0

Guanine nucleotide exchange C9orf72 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q6DFW0 Pla2g15-201ENSMUST00000034377 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Q6DFW0 Lrrc52-201ENSMUST00000036643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Q6DFW0 Gm3402-201ENSMUST00000036715 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Q6DFW0 Ggact-201ENSMUST00000038075 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Q6DFW0 Strc-201ENSMUST00000038389 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Q6DFW0 Aicda-201ENSMUST00000043301 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Q6DFW0 Gmppb-201ENSMUST00000047947 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Q6DFW0 Olfr524-201ENSMUST00000051943 1058 ntAPPRIS P1 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Q6DFW0 Fam110b-201ENSMUST00000054857 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Q6DFW0 Spdye4a-201ENSMUST00000085733 1819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Q6DFW0 Cryge-201ENSMUST00000087359 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Q6DFW0 Rpl19-202ENSMUST00000092425 737 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Q6DFW0 Adgrl3-214ENSMUST00000120445 5230 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Q6DFW0 Tmcc2-203ENSMUST00000132435 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Q6DFW0 Qsox1-201ENSMUST00000035325 3348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Q6DFW0 Cdc37-201ENSMUST00000019615 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Q6DFW0 Meaf6-205ENSMUST00000154689 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Q6DFW0 Ttc17-203ENSMUST00000111237 4409 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Q6DFW0 Caln1-202ENSMUST00000111287 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Q6DFW0 Esam-201ENSMUST00000002011 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Q6DFW0 Nefm-202ENSMUST00000111089 3680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Q6DFW0 Cyp2d26-201ENSMUST00000006094 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Q6DFW0 Unkl-204ENSMUST00000160896 4787 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Q6DFW0 Fam107b-201ENSMUST00000027965 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Q6DFW0 AC154671.1-201ENSMUST00000228617 1578 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Q6DFW0 Sel1l-210ENSMUST00000178462 6150 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Q6DFW0 Lrrfip2-213ENSMUST00000216430 1525 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Q6DFW0 Prpf40b-208ENSMUST00000136980 3047 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Q6DFW0 Fxyd5-212ENSMUST00000162733 2998 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Q6DFW0 D730001G18Rik-202ENSMUST00000191407 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Q6DFW0 Gm14025-201ENSMUST00000145798 4242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Q6DFW0 Dna2-203ENSMUST00000131422 4122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Q6DFW0 Zfp108-203ENSMUST00000206777 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Q6DFW0 Fthl17d-201ENSMUST00000105004 856 ntAPPRIS P1 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Q6DFW0 Pole-203ENSMUST00000112482 747 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Q6DFW0 Gm12058-201ENSMUST00000118614 437 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Q6DFW0 4933407E24Rik-201ENSMUST00000133499 969 ntTSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Q6DFW0 Gm12395-201ENSMUST00000144765 536 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Q6DFW0 2310057J18Rik-201ENSMUST00000015663 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Q6DFW0 Rprl1-201ENSMUST00000158050 327 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Q6DFW0 Gm20482-202ENSMUST00000174729 825 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Q6DFW0 Anapc16-205ENSMUST00000182912 566 ntTSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Q6DFW0 Ccl4-201ENSMUST00000019074 660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Q6DFW0 Lypd2-201ENSMUST00000023260 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Q6DFW0 Txn2-201ENSMUST00000005487 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Q6DFW0 Ifi27-203ENSMUST00000076788 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Q6DFW0 Zdhhc12-201ENSMUST00000081838 1187 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Q6DFW0 Olfr366-201ENSMUST00000091001 930 ntAPPRIS P1 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Q6DFW0 4933434E20Rik-206ENSMUST00000160640 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Q6DFW0 Hhipl2-201ENSMUST00000065900 2525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Q6DFW0 Traf7-202ENSMUST00000088464 2504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Q6DFW0 Gm20696-201ENSMUST00000155466 3560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Q6DFW0 A430033K04Rik-203ENSMUST00000198958 2264 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Q6DFW0 Gm9796-201ENSMUST00000062249 2250 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Q6DFW0 Gm38055-201ENSMUST00000195353 2217 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Q6DFW0 Pla2g7-201ENSMUST00000024706 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Q6DFW0 Rims1-206ENSMUST00000115273 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Q6DFW0 Nek3-201ENSMUST00000033865 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Q6DFW0 P2ry1-201ENSMUST00000029331 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Q6DFW0 Acadl-201ENSMUST00000027153 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Q6DFW0 Rtp4-202ENSMUST00000209422 1859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Q6DFW0 Oscar-203ENSMUST00000148012 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Q6DFW0 Gm26510-201ENSMUST00000180468 1796 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Q6DFW0 Ccdc190-201ENSMUST00000094348 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Q6DFW0 Gm3836-201ENSMUST00000211377 1613 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Q6DFW0 Gm8155-201ENSMUST00000216363 1612 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Q6DFW0 Tcp11l1-202ENSMUST00000111118 5474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Q6DFW0 Spop-201ENSMUST00000107722 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Q6DFW0 Galnt9-202ENSMUST00000165856 1541 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Q6DFW0 BC024139-202ENSMUST00000089654 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Q6DFW0 Pacsin1-201ENSMUST00000045896 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Q6DFW0 Epb41l1-203ENSMUST00000103136 6249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Q6DFW0 Nek1-208ENSMUST00000211256 4810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Q6DFW0 Palm-204ENSMUST00000218631 2725 ntTSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Q6DFW0 Cntnap1-201ENSMUST00000103109 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Q6DFW0 Nefl-201ENSMUST00000022639 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Q6DFW0 Kifc5b-201ENSMUST00000078961 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Q6DFW0 Topbp1-201ENSMUST00000035164 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Q6DFW0 Gm14247-201ENSMUST00000120950 237 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Q6DFW0 Serf1-203ENSMUST00000132053 516 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Q6DFW0 Crb3-205ENSMUST00000169543 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Q6DFW0 Gm38000-201ENSMUST00000192390 1215 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Q6DFW0 AC166095.1-201ENSMUST00000223731 1241 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Q6DFW0 Rps3a1-201ENSMUST00000029722 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Q6DFW0 Lgals1-201ENSMUST00000089377 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Q6DFW0 Tcn2-201ENSMUST00000020710 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Q6DFW0 Ripk3-201ENSMUST00000022830 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Q6DFW0 Entpd5-203ENSMUST00000110272 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Q6DFW0 C2cd5-203ENSMUST00000171349 4292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Q6DFW0 Pom121l2-201ENSMUST00000017126 2960 ntAPPRIS P4 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Q6DFW0 Cln3-201ENSMUST00000032962 2386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Q6DFW0 B930036N10Rik-202ENSMUST00000181170 3544 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Q6DFW0 Nuak2-201ENSMUST00000072177 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Q6DFW0 Dab2ip-201ENSMUST00000065001 6392 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Q6DFW0 Dzip1l-201ENSMUST00000078367 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Q6DFW0 Cstf3-201ENSMUST00000028599 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Q6DFW0 Tbc1d14-204ENSMUST00000130417 2665 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Q6DFW0 Cyb561d1-203ENSMUST00000106655 4275 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Q6DFW0 Oxsm-202ENSMUST00000112624 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Q6DFW0 Frmpd2-203ENSMUST00000208577 5192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.3 ms