Protein–RNA interactions for Protein: Q61457

Ccne1, G1/S-specific cyclin-E1, mousemouse

Predictions only

Length 408 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccne1Q61457 Gm17825-201ENSMUST00000206836 794 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccne1Q61457 Gm45338-206ENSMUST00000211460 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccne1Q61457 AC164437.3-201ENSMUST00000228323 347 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccne1Q61457 Mgp-201ENSMUST00000032342 617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccne1Q61457 Olfr1047-201ENSMUST00000099901 960 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccne1Q61457 Phykpl-206ENSMUST00000167797 3116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccne1Q61457 Gpr176-201ENSMUST00000039160 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccne1Q61457 Ino80c-203ENSMUST00000141489 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccne1Q61457 Cr1l-201ENSMUST00000075451 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccne1Q61457 Gm19692-201ENSMUST00000203856 2084 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccne1Q61457 Cd55b-201ENSMUST00000112488 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccne1Q61457 Drc1-201ENSMUST00000101448 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccne1Q61457 Zbtb7b-202ENSMUST00000107432 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccne1Q61457 Otx2-202ENSMUST00000119070 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccne1Q61457 Rapgef3-203ENSMUST00000126854 4005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccne1Q61457 Ptpru-201ENSMUST00000030741 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccne1Q61457 F10-201ENSMUST00000033821 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccne1Q61457 Cyb5rl-203ENSMUST00000106758 2516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccne1Q61457 Nfatc2-209ENSMUST00000171689 2742 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccne1Q61457 Gm17213-201ENSMUST00000165161 1360 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccne1Q61457 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccne1Q61457 Plekhn1-203ENSMUST00000217885 1982 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccne1Q61457 Zfp810-201ENSMUST00000086278 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccne1Q61457 A830082K12Rik-201ENSMUST00000123998 2203 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccne1Q61457 Gm4900-201ENSMUST00000222046 1628 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccne1Q61457 Ccndbp1-203ENSMUST00000099489 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccne1Q61457 Ly6e-210ENSMUST00000188866 2068 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccne1Q61457 Coro6-202ENSMUST00000052515 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccne1Q61457 Angpt4-201ENSMUST00000028955 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccne1Q61457 Gm25880-201ENSMUST00000104331 132 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
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Ccne1Q61457 Rbm3-205ENSMUST00000115619 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccne1Q61457 Gm13791-201ENSMUST00000123263 608 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccne1Q61457 Gm15507-201ENSMUST00000133523 592 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccne1Q61457 Gm14154-201ENSMUST00000142642 579 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccne1Q61457 AC124457.1-201ENSMUST00000198845 120 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccne1Q61457 Fxyd4-202ENSMUST00000203066 522 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccne1Q61457 Gm45120-201ENSMUST00000208880 408 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccne1Q61457 Ifi27-203ENSMUST00000076788 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccne1Q61457 Olfr1411-203ENSMUST00000216444 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccne1Q61457 Rpl15-202ENSMUST00000080281 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccne1Q61457 4930555B11Rik-201ENSMUST00000123210 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccne1Q61457 Tfcp2-201ENSMUST00000009877 3250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccne1Q61457 Gm5592-202ENSMUST00000206490 2623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccne1Q61457 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccne1Q61457 1700010I14Rik-201ENSMUST00000024650 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccne1Q61457 Ikzf4-203ENSMUST00000221150 2213 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccne1Q61457 Wdr25-202ENSMUST00000167816 2657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccne1Q61457 Unk-202ENSMUST00000106452 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccne1Q61457 Rpl22-204ENSMUST00000139685 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccne1Q61457 Ubxn10-201ENSMUST00000105809 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccne1Q61457 B4galt4-201ENSMUST00000023482 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccne1Q61457 Txndc5-203ENSMUST00000160653 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccne1Q61457 6430571L13Rik-201ENSMUST00000042581 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccne1Q61457 Alg12-204ENSMUST00000162183 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
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Ccne1Q61457 Actb-201ENSMUST00000100497 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccne1Q61457 Kdm4a-202ENSMUST00000097911 4550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccne1Q61457 G630016G05Rik-202ENSMUST00000156095 3398 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccne1Q61457 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccne1Q61457 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccne1Q61457 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccne1Q61457 Atp13a1-201ENSMUST00000034326 3915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccne1Q61457 Sgk3-202ENSMUST00000166384 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
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Ccne1Q61457 Ly6i-201ENSMUST00000023250 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccne1Q61457 Gm10135-201ENSMUST00000043711 252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccne1Q61457 Chmp3-202ENSMUST00000065364 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccne1Q61457 Gm4978-201ENSMUST00000071565 801 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccne1Q61457 Chpf2-201ENSMUST00000088295 5371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccne1Q61457 Poc1a-201ENSMUST00000072206 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccne1Q61457 Egr2-202ENSMUST00000105438 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccne1Q61457 Afdn-216ENSMUST00000170827 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccne1Q61457 Papss1-201ENSMUST00000029666 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccne1Q61457 Sec14l2-201ENSMUST00000003681 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccne1Q61457 Tuft1-201ENSMUST00000006123 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccne1Q61457 Gm12200-201ENSMUST00000144876 1858 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccne1Q61457 Traf3ip3-212ENSMUST00000192020 1854 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccne1Q61457 Cbfa2t2-202ENSMUST00000099178 3247 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccne1Q61457 Elk1-201ENSMUST00000009550 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccne1Q61457 Ubqln5-201ENSMUST00000053743 1915 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccne1Q61457 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccne1Q61457 Odf2l-201ENSMUST00000029920 2239 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccne1Q61457 Dctn1-205ENSMUST00000113919 4292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccne1Q61457 Gm18642-201ENSMUST00000206642 1400 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccne1Q61457 Klhl8-203ENSMUST00000112815 2898 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccne1Q61457 Gm13288-201ENSMUST00000094977 2850 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccne1Q61457 Rgs12-201ENSMUST00000030984 5472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccne1Q61457 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccne1Q61457 Armc5-201ENSMUST00000044660 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccne1Q61457 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccne1Q61457 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccne1Q61457 Fastkd3-201ENSMUST00000051784 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
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