Protein–RNA interactions for Protein: Q5U4D8

Slc5a6, Sodium-dependent multivitamin transporter, mousemouse

Predictions only

Length 634 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc5a6Q5U4D8 Rpap1-203ENSMUST00000110793 5458 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Slc5a6Q5U4D8 Ikzf4-203ENSMUST00000221150 2213 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Slc5a6Q5U4D8 A630076J17Rik-201ENSMUST00000179399 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Slc5a6Q5U4D8 Nrde2-201ENSMUST00000021596 3718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Slc5a6Q5U4D8 Thegl-201ENSMUST00000031161 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Slc5a6Q5U4D8 Cd163l1-204ENSMUST00000209637 3210 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Slc5a6Q5U4D8 Slc9a1-201ENSMUST00000030669 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Slc5a6Q5U4D8 Hnrnpc-206ENSMUST00000227458 1683 ntAPPRIS ALT1 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Slc5a6Q5U4D8 Myo7a-204ENSMUST00000107128 7506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Slc5a6Q5U4D8 Sectm1a-204ENSMUST00000106120 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Slc5a6Q5U4D8 Gm14017-201ENSMUST00000121934 386 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Slc5a6Q5U4D8 Cmtm1-201ENSMUST00000159039 1130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Slc5a6Q5U4D8 Gm454-201ENSMUST00000160126 751 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Slc5a6Q5U4D8 Ly6g6c-201ENSMUST00000173207 598 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Slc5a6Q5U4D8 Ly6g6c-202ENSMUST00000173478 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Slc5a6Q5U4D8 Igfbp4-201ENSMUST00000017637 3831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Slc5a6Q5U4D8 Gm27627-201ENSMUST00000183644 150 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Slc5a6Q5U4D8 Gm27239-201ENSMUST00000184638 642 ntTSL 3 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Slc5a6Q5U4D8 Ip6k2-202ENSMUST00000192028 1199 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Slc5a6Q5U4D8 Gm35409-201ENSMUST00000196412 1102 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Slc5a6Q5U4D8 Vdac1-201ENSMUST00000020673 891 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Slc5a6Q5U4D8 Gm45186-201ENSMUST00000206874 478 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Slc5a6Q5U4D8 Gm32850-202ENSMUST00000209149 732 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Slc5a6Q5U4D8 Gm8913-201ENSMUST00000209491 641 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Slc5a6Q5U4D8 Gm18212-201ENSMUST00000211678 889 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Slc5a6Q5U4D8 AC159747.1-201ENSMUST00000219903 265 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Slc5a6Q5U4D8 AC124171.1-201ENSMUST00000221151 567 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Slc5a6Q5U4D8 Asb18-202ENSMUST00000097656 788 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Slc5a6Q5U4D8 Gck-201ENSMUST00000102920 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Slc5a6Q5U4D8 Nfatc2-209ENSMUST00000171689 2742 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Slc5a6Q5U4D8 Sgk1-204ENSMUST00000120509 3096 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Slc5a6Q5U4D8 Adamts16-202ENSMUST00000109694 3378 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Slc5a6Q5U4D8 Pag1-201ENSMUST00000108384 3729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Slc5a6Q5U4D8 Fam45a-202ENSMUST00000119633 2267 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Slc5a6Q5U4D8 Tbata-201ENSMUST00000035894 1506 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Slc5a6Q5U4D8 Aebp2-206ENSMUST00000161335 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Slc5a6Q5U4D8 Sh3tc1-201ENSMUST00000070203 4549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Slc5a6Q5U4D8 Ddx11-205ENSMUST00000224497 4141 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Slc5a6Q5U4D8 Ndst1-201ENSMUST00000169273 6070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Slc5a6Q5U4D8 Fxr1-204ENSMUST00000197694 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Slc5a6Q5U4D8 Nicn1-201ENSMUST00000035227 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Slc5a6Q5U4D8 Rbm10-207ENSMUST00000177738 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Slc5a6Q5U4D8 Rbm10-201ENSMUST00000064911 2793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Slc5a6Q5U4D8 Rab14-202ENSMUST00000113025 4346 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Slc5a6Q5U4D8 Pomgnt1-205ENSMUST00000121052 2693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Slc5a6Q5U4D8 Atp8a2-202ENSMUST00000131670 1725 ntTSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Slc5a6Q5U4D8 Eif4enif1-204ENSMUST00000120721 2952 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Slc5a6Q5U4D8 Pacsin1-201ENSMUST00000045896 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Slc5a6Q5U4D8 4931409K22Rik-201ENSMUST00000088302 2613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Slc5a6Q5U4D8 Ninl-201ENSMUST00000109896 5093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Slc5a6Q5U4D8 Fam118b-202ENSMUST00000063782 1662 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Slc5a6Q5U4D8 2810407A14Rik-201ENSMUST00000069809 1699 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Slc5a6Q5U4D8 Gm5936-201ENSMUST00000114116 2857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Slc5a6Q5U4D8 Gm5640-201ENSMUST00000114119 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Slc5a6Q5U4D8 DXBay18-201ENSMUST00000080324 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Slc5a6Q5U4D8 Gm14685-201ENSMUST00000088459 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Slc5a6Q5U4D8 Aplp2-209ENSMUST00000217641 3462 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Slc5a6Q5U4D8 Ercc4-201ENSMUST00000023206 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Slc5a6Q5U4D8 Gm14698-201ENSMUST00000096420 4226 ntAPPRIS P1 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Slc5a6Q5U4D8 Src-201ENSMUST00000029175 3906 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Slc5a6Q5U4D8 Myo1b-201ENSMUST00000018561 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Slc5a6Q5U4D8 Sirt2-209ENSMUST00000170068 1585 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Slc5a6Q5U4D8 Nlrx1-202ENSMUST00000168499 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Slc5a6Q5U4D8 Fam71e1-201ENSMUST00000107927 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Slc5a6Q5U4D8 Tax1bp3-202ENSMUST00000108477 1153 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Slc5a6Q5U4D8 Gm13996-201ENSMUST00000118456 430 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Slc5a6Q5U4D8 AA672651-201ENSMUST00000151550 489 ntTSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Slc5a6Q5U4D8 Tepp-204ENSMUST00000161029 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Slc5a6Q5U4D8 9330159M07Rik-202ENSMUST00000180783 1044 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Slc5a6Q5U4D8 Gm29615-201ENSMUST00000185371 697 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Slc5a6Q5U4D8 Gm28224-201ENSMUST00000186078 697 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Slc5a6Q5U4D8 Gm29001-201ENSMUST00000186177 697 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Slc5a6Q5U4D8 Gm28292-201ENSMUST00000186593 697 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Slc5a6Q5U4D8 Gm28101-201ENSMUST00000187608 697 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Slc5a6Q5U4D8 Gm29076-201ENSMUST00000187689 697 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Slc5a6Q5U4D8 Gm28302-201ENSMUST00000187931 697 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Slc5a6Q5U4D8 Gm28646-201ENSMUST00000188220 697 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Slc5a6Q5U4D8 Gm28205-201ENSMUST00000189177 697 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Slc5a6Q5U4D8 Gm29032-201ENSMUST00000189797 697 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Slc5a6Q5U4D8 Gm28695-201ENSMUST00000190300 697 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Slc5a6Q5U4D8 Rpl7a-ps10-201ENSMUST00000190579 798 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Slc5a6Q5U4D8 Gm37448-201ENSMUST00000192795 697 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Slc5a6Q5U4D8 Gm9136-201ENSMUST00000193368 454 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Slc5a6Q5U4D8 Gm43356-201ENSMUST00000196582 609 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Slc5a6Q5U4D8 Gm35986-201ENSMUST00000197370 655 ntTSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Slc5a6Q5U4D8 Gm43936-201ENSMUST00000203987 490 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Slc5a6Q5U4D8 Gm32468-201ENSMUST00000214199 1040 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Slc5a6Q5U4D8 Nit2-201ENSMUST00000023432 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Slc5a6Q5U4D8 Fam25c-201ENSMUST00000052126 408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Slc5a6Q5U4D8 Rps15-202ENSMUST00000068408 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Slc5a6Q5U4D8 Rpl7a-ps3-201ENSMUST00000090170 796 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Slc5a6Q5U4D8 Rpl7a-ps5-201ENSMUST00000095218 807 ntAPPRIS P1 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Slc5a6Q5U4D8 Rbm47-209ENSMUST00000201544 5211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Slc5a6Q5U4D8 Hnrnph2-202ENSMUST00000059297 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Slc5a6Q5U4D8 Kcnk2-206ENSMUST00000193319 1548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Slc5a6Q5U4D8 Lmna-201ENSMUST00000029699 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Slc5a6Q5U4D8 Alpi-201ENSMUST00000113270 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Slc5a6Q5U4D8 Ldb3-204ENSMUST00000064098 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Slc5a6Q5U4D8 Elmod3-204ENSMUST00000141833 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Slc5a6Q5U4D8 AC173482.6-201ENSMUST00000225889 1741 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.5 ms