Protein–RNA interactions for Protein: Q5SZ99

Trim38, Tripartite motif-containing 38, mousemouse

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Length 471 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Trim38Q5SZ99 Ctsd-201ENSMUST00000066401 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Trim38Q5SZ99 Snx29-203ENSMUST00000122168 2096 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Trim38Q5SZ99 Gm38194-201ENSMUST00000194529 2211 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Trim38Q5SZ99 Olfr140-202ENSMUST00000111506 3449 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Trim38Q5SZ99 Cyth3-202ENSMUST00000116456 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Trim38Q5SZ99 Zfp597-201ENSMUST00000090522 5668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
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Trim38Q5SZ99 Cttnbp2nl-201ENSMUST00000077548 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
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Trim38Q5SZ99 Timd2-201ENSMUST00000055102 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
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Trim38Q5SZ99 F730043M19Rik-204ENSMUST00000148740 3312 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
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Trim38Q5SZ99 Timd4-201ENSMUST00000068877 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
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Trim38Q5SZ99 Ldb3-204ENSMUST00000064098 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Trim38Q5SZ99 Crybg2-201ENSMUST00000121391 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
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Trim38Q5SZ99 Gm15587-201ENSMUST00000146326 3493 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
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Trim38Q5SZ99 Mdh1b-201ENSMUST00000114094 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Trim38Q5SZ99 Rtbdn-204ENSMUST00000152378 2322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Trim38Q5SZ99 Prkag3-201ENSMUST00000081636 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Trim38Q5SZ99 Hyal3-202ENSMUST00000148440 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Trim38Q5SZ99 Rps6ka6-202ENSMUST00000082034 4170 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Trim38Q5SZ99 Cars-201ENSMUST00000010899 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Trim38Q5SZ99 Umod-201ENSMUST00000033263 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Trim38Q5SZ99 Med1-202ENSMUST00000092735 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Trim38Q5SZ99 Spata13-207ENSMUST00000160973 7467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Trim38Q5SZ99 Gm8146-201ENSMUST00000192106 1847 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Trim38Q5SZ99 Frmpd2-203ENSMUST00000208577 5192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Trim38Q5SZ99 Sp6-201ENSMUST00000047997 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Trim38Q5SZ99 Paqr5-201ENSMUST00000034817 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Trim38Q5SZ99 4833439L19Rik-208ENSMUST00000153065 2502 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Trim38Q5SZ99 Arg1-201ENSMUST00000020161 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
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