Protein–RNA interactions for Protein: Q3UZ01

Rnpc3, RNA-binding protein 40, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 514 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnpc3Q3UZ01 Cep164-201ENSMUST00000117194 5541 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rnpc3Q3UZ01 Usp14-201ENSMUST00000092096 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rnpc3Q3UZ01 Pdxdc1-201ENSMUST00000023361 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rnpc3Q3UZ01 Myo3b-202ENSMUST00000112241 1319 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rnpc3Q3UZ01 Aldh3b2-201ENSMUST00000143380 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rnpc3Q3UZ01 Rnf223-201ENSMUST00000209248 2908 ntAPPRIS P1 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rnpc3Q3UZ01 Egfem1-202ENSMUST00000119598 2687 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rnpc3Q3UZ01 Gng5-202ENSMUST00000118280 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rnpc3Q3UZ01 Yae1d1-204ENSMUST00000222796 1382 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rnpc3Q3UZ01 Lsp1-201ENSMUST00000018963 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rnpc3Q3UZ01 Gm26819-201ENSMUST00000180656 5128 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rnpc3Q3UZ01 Gm36855-203ENSMUST00000216660 1406 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rnpc3Q3UZ01 Arl6ip5-201ENSMUST00000044681 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rnpc3Q3UZ01 Bach2-202ENSMUST00000108180 8882 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rnpc3Q3UZ01 Gm28719-201ENSMUST00000187779 1757 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Rnpc3Q3UZ01 Axl-202ENSMUST00000085948 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rnpc3Q3UZ01 Slc38a6-206ENSMUST00000140523 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rnpc3Q3UZ01 Zfp64-201ENSMUST00000087971 2438 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rnpc3Q3UZ01 Wfdc8-201ENSMUST00000094351 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rnpc3Q3UZ01 P2rx1-201ENSMUST00000021141 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rnpc3Q3UZ01 Lynx1-201ENSMUST00000023259 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rnpc3Q3UZ01 Bub1-201ENSMUST00000028858 3421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rnpc3Q3UZ01 Ifitm10-203ENSMUST00000105988 824 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rnpc3Q3UZ01 Ccl27a-204ENSMUST00000108035 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rnpc3Q3UZ01 Ccl27a-205ENSMUST00000108036 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rnpc3Q3UZ01 Ccl27a-206ENSMUST00000108037 590 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rnpc3Q3UZ01 Mrpl55-202ENSMUST00000108784 729 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rnpc3Q3UZ01 Gm11451-201ENSMUST00000118946 630 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Rnpc3Q3UZ01 Gm11956-201ENSMUST00000119525 512 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Rnpc3Q3UZ01 Gm12516-201ENSMUST00000120819 385 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Rnpc3Q3UZ01 Gm13391-202ENSMUST00000147685 816 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rnpc3Q3UZ01 Gm3948-201ENSMUST00000147795 421 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rnpc3Q3UZ01 Gm23771-201ENSMUST00000178702 110 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Rnpc3Q3UZ01 4930405N21Rik-201ENSMUST00000199950 1200 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Rnpc3Q3UZ01 Timm10b-210ENSMUST00000209588 373 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rnpc3Q3UZ01 1110019B22Rik-202ENSMUST00000218396 989 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rnpc3Q3UZ01 CT571245.2-201ENSMUST00000218421 305 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Rnpc3Q3UZ01 Gm32635-201ENSMUST00000221493 1162 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rnpc3Q3UZ01 AC154290.1-201ENSMUST00000223786 1240 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Rnpc3Q3UZ01 Ms4a8a-201ENSMUST00000025636 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rnpc3Q3UZ01 Hopx-201ENSMUST00000081964 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rnpc3Q3UZ01 Dusp19-201ENSMUST00000028384 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rnpc3Q3UZ01 Kdm4a-202ENSMUST00000097911 4550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rnpc3Q3UZ01 Gm16364-201ENSMUST00000153722 1313 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rnpc3Q3UZ01 Gm26857-201ENSMUST00000181580 3347 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rnpc3Q3UZ01 Vamp1-203ENSMUST00000100942 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rnpc3Q3UZ01 Cyth3-202ENSMUST00000116456 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rnpc3Q3UZ01 Cyb561d1-201ENSMUST00000065664 4058 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rnpc3Q3UZ01 Padi2-201ENSMUST00000030765 4774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rnpc3Q3UZ01 Lig3-202ENSMUST00000080461 3056 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rnpc3Q3UZ01 Ccr4-202ENSMUST00000215425 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rnpc3Q3UZ01 Klk1b16-201ENSMUST00000005933 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rnpc3Q3UZ01 Ctnnbl1-201ENSMUST00000029178 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rnpc3Q3UZ01 Pisd-ps2-201ENSMUST00000127960 1424 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rnpc3Q3UZ01 Rsrc1-206ENSMUST00000162036 1406 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rnpc3Q3UZ01 Pmp2-201ENSMUST00000029034 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rnpc3Q3UZ01 Arhgap1-202ENSMUST00000111329 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rnpc3Q3UZ01 Bicd1-202ENSMUST00000086829 9667 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rnpc3Q3UZ01 Pdhx-201ENSMUST00000011058 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rnpc3Q3UZ01 Lrp8-206ENSMUST00000126573 2590 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rnpc3Q3UZ01 Gm12248-202ENSMUST00000218429 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rnpc3Q3UZ01 Mettl8-202ENSMUST00000100037 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rnpc3Q3UZ01 Efcab14-203ENSMUST00000106524 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rnpc3Q3UZ01 Spata7-203ENSMUST00000101146 1913 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rnpc3Q3UZ01 Spag9-202ENSMUST00000041956 7340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rnpc3Q3UZ01 Fads1-201ENSMUST00000010807 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rnpc3Q3UZ01 Tmem200a-203ENSMUST00000218232 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rnpc3Q3UZ01 Tspan32-201ENSMUST00000009396 1582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rnpc3Q3UZ01 D030025P21Rik-202ENSMUST00000220643 3987 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Rnpc3Q3UZ01 Sdf4-201ENSMUST00000050078 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rnpc3Q3UZ01 Gm26685-201ENSMUST00000181831 2023 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rnpc3Q3UZ01 AC164426.2-201ENSMUST00000225993 2492 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Rnpc3Q3UZ01 Cr1l-201ENSMUST00000075451 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rnpc3Q3UZ01 Ighv10-3-201ENSMUST00000103495 377 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rnpc3Q3UZ01 Serf2-202ENSMUST00000110615 876 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rnpc3Q3UZ01 Rs1-202ENSMUST00000112368 731 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rnpc3Q3UZ01 Gm12628-201ENSMUST00000122193 382 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Rnpc3Q3UZ01 Gm16178-201ENSMUST00000129408 677 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rnpc3Q3UZ01 Gm15978-201ENSMUST00000161043 738 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rnpc3Q3UZ01 Gm20714-202ENSMUST00000176436 748 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rnpc3Q3UZ01 2610027F03Rik-202ENSMUST00000186982 603 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rnpc3Q3UZ01 Gm5852-201ENSMUST00000194119 1021 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Rnpc3Q3UZ01 Gm5542-201ENSMUST00000195485 1089 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Rnpc3Q3UZ01 Gm44958-201ENSMUST00000203734 736 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Rnpc3Q3UZ01 Uhrf1bp1-201ENSMUST00000114849 8584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rnpc3Q3UZ01 Src-201ENSMUST00000029175 3906 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rnpc3Q3UZ01 Gfap-201ENSMUST00000067444 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rnpc3Q3UZ01 Pogk-202ENSMUST00000128861 4848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rnpc3Q3UZ01 Pdlim5-201ENSMUST00000029941 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rnpc3Q3UZ01 Vwa8-201ENSMUST00000040990 7054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rnpc3Q3UZ01 Rbm47-204ENSMUST00000113726 4703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rnpc3Q3UZ01 Arhgef40-202ENSMUST00000100639 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rnpc3Q3UZ01 Gjb2-201ENSMUST00000055698 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rnpc3Q3UZ01 Arid5a-204ENSMUST00000115032 4640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rnpc3Q3UZ01 Cdip1-203ENSMUST00000118703 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rnpc3Q3UZ01 Kctd18-210ENSMUST00000164963 2114 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rnpc3Q3UZ01 Nars2-201ENSMUST00000044466 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rnpc3Q3UZ01 Efna1-202ENSMUST00000118587 1632 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rnpc3Q3UZ01 Sorcs1-201ENSMUST00000072685 4396 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rnpc3Q3UZ01 Ank2-217ENSMUST00000182610 2231 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.8 ms